我們進一步發(fā)現(xiàn),MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠顯示更低的血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平(圖2D)、血清天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(AST)水平(圖2E)和肝臟甘油三酯水平(圖2F)??傊?,我們的結果表明Caspase-11缺陷減輕了MCD誘導的小鼠肝臟脂肪變性。
3.Caspase-11缺乏減弱NASH小鼠的肝纖維化
通過測量纖維化相關因子的表達我們評估Caspase-11缺失對MCD誘導的肝纖維化的影響。在正常條件下,野生型和Caspase-11缺陷小鼠的TGF-β(圖3A)、α-Sma(圖3B)和Col1a1(圖3C)表達相似。MCD處理的野生型小鼠中TGF-β、α-Sma和Col1a1的表達***上調(diào)。相比之下,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠TGF-β、α-Sma和Col1a1的mRNA水平***降低。這些結果表明,Caspase-11缺乏可減少MCD處理小鼠的肝纖維化。 英拜提供可靠的技術咨詢。成都晝夜節(jié)律芯片科研
在CRC和HC鑒定的628個和745個tDR中,每組分別有85個和202個tDR。此外,CRC患者血漿中81個tDR較HC患者明顯增加。為了驗證小RNA測序結果,對上述3例CRC和3例HC受試者血漿樣本中5例上調(diào)的候選tDR進行了qRT-PCR檢測。CRC血漿中測量到的tDRs均較HC升高,其中5’-tRF-GlyGCC的升高幅度比較大。所有這些數(shù)據(jù)表明,與HC相比,CRC患者血漿中tDRs的表達譜存在差異;此外,5’-tRF,特別是5’-tRF-glygcc在CRC血漿中***升高。
2.CRC患者血漿中5'-tRF-GlyGCC水平5’-tRF-GlyGCC位于第1、2、6、16、17染色體上,轉(zhuǎn)錄本長度為31nt,序列為5’-GCAUGGGUGGUUCAGUGGUAGAAUUCUCGCC-3’(MINTbaseUniqueID:tRF-35-PNR8YP9LON4VN1)。小RNA-seq數(shù)據(jù)提示5’-tRF-GlyGCC在CRC患者中的升高高于其他tDR。進一步檢測了其在CRC(n=105)和HC(n=90)患者血漿中的表達。我們的數(shù)據(jù)顯示,5’-tRF-GlyGCC在CRC患者中的豐度明顯高于HC。然后分析了5’-tRF-GlyGCC在CRC患者不同病理階段(I期,n=11;階段II,n=34;III期,n=32;IV期,n=25)。結果表明,CRC各階段5’-tRF-GlyGCC含量均高于HC。結果表明5’-tRF-GlyGCC可能是一種有前景的診斷CRC患者的生物標志物。 桿狀病毒科研整體服務英拜生物您隨身的科研小助手。
此蛋白酶體抑制劑MG132的作用減弱了circPLCE1-411對RPS3蛋白水平的影響。circPLCE1過表達的細胞中RPS3泛素化水平升高。相反,circPLCE1敲低后,RPS3的泛素化水平降低。接下來,我們用相同濃度的HA-HSP90α、HisRPS3和Myc-HSP70質(zhì)粒轉(zhuǎn)染HEK293T細胞,但增加Flag-circPLCE1質(zhì)粒的濃度用于后續(xù)的免疫沉淀實驗。結果表明,隨著circPLCE1-411表達量的增加,RPS3與HSP90α的互作性降低,而與HSP70的互作性增加。為了鑒定HSP90α與RPS3和circPLCE1-411相互作用的結構域,我們生成了HSP90α截斷突變體,發(fā)現(xiàn)RPS3和circPLCE1-411的相互作用依賴于HSP90α的N端。
在沒有RNA配體的情況下,RIG-I采用一種自動抑制的構象,CARDs發(fā)出信號。因此假設circNDUFB2可能通過促進其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測RIG-I的CARDs(FLAG-CARD)和螺旋酶結構域(HA-ΔCARD)之間的相互作用。結果表明circNDUFB2抑制了RIG-I的CARDs和螺旋酶結構域之間的相互作用。此外,circNDUFB2增強了CARDs與線粒體抗病毒信號蛋白(MAVS)的相互作用。這些結果表明circNDUFB2可能通過破壞CARDs與其解旋酶結構域之間的分子內(nèi)相互作用來***RIG-I,并使RIG-I保持活性,從而***RIG-I-MAVS信號級聯(lián)。Caspase-11介導的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。
蛋白酶***受體信號轉(zhuǎn)導PCR基因芯片可以同時檢測與活化及響應蛋白酶***受體(PARS)相關的84個關鍵基因的表達。PAR家族是一類G蛋白偶聯(lián)型受體,其胞外結構域被蛋白水解酶切割可以***受體。凝血酶(F2)***PAR1,PAR2,PAR4,而胰蛋白酶***PAR3。然而,這4個受體也可以由幾個其他的蛋白酶被***。不同的酶切割受體上特定的位點,會引起不同的下游反應。大多數(shù)蛋白酶***PAR的活性在止血,或血液凝塊的形成和降解中發(fā)揮**作用。-些具體的PAR的信號轉(zhuǎn)導途徑和響應受不同蛋白酶調(diào)控,已明確的包括組織因子(F3),活化蛋白C(PROC),凝血因子VIa(F7),和.因子Xa(F10)。PAR信號也參與其他細胞的受體的調(diào)控,如EPCR(PROCR)。TLR4,S1PR3。這些信號轉(zhuǎn)導通路已確定在多種細胞類型中影響生物過程,如黏附,增殖和遷移。PAR信號失調(diào)可以參與**的發(fā)展。此外,**患者通常診斷出同時患有凝血功能障礙,這是PAR配體本身或參與止血的靶基因失調(diào)所造成的。PAR信號靶基因還包括細胞因子和其他調(diào)節(jié)炎癥反應的蛋白質(zhì),以及血管生成基因。該芯片包括涉及在PAR通路中的配體和受體,以及已確定的特定的下游效應和靶基因。芯片結果可以在特定的生物模型中研究PAR具體途徑所涉及的相關基因。血清或尿液中尿酸濃度的升高與痛風腎臟和血管疾病密切相關。廣州神經(jīng)炎癥科研
FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉(zhuǎn)移。成都晝夜節(jié)律芯片科研
2)Pex增強肝衛(wèi)星細胞(HSCs)的活性
為了證實Pex的生物學功能,將原代小鼠肝細胞與Pex孵育,Pex被受體細胞吸收。然后使用免疫熒光染色對原發(fā)性肝細胞的類型進行表征,結果顯示,desmin+HSCs和F4/80+Kupffer細胞吸收了Pex(圖2A)。我們接下來研究了Pex對HSCs生物學行為的影響,發(fā)現(xiàn)Pex***增強了HSCs的增殖和遷移能力(圖2B和C)。Pex與Npex處理的HSCs的凋亡沒有***差異(圖2D)。westernblot和免疫熒光檢測結果顯示,Pex***上調(diào)α-SMA的表達,說明Pex能促進HSC的活化(圖2E和F)。我們觀察到Pex可以通過下調(diào)vitronectin和tenascinC的表達,上調(diào)collagenI和fibronectin的表達來調(diào)節(jié)HSCs中的ECM分泌(圖2G)。 成都晝夜節(jié)律芯片科研
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗