通過(guò)circRNA芯片分析了三對(duì)NSCLC樣品中circRNA的表達(dá)譜,總共鑒定出109個(gè)circRNA失調(diào),33個(gè)上調(diào),76個(gè)下調(diào)。qRT-PCR驗(yàn)證52個(gè)配對(duì)NSCLC樣品中**差異circRNA的表達(dá)。circNDUFB2是**顯著下調(diào)的circRNA。臨床分析發(fā)現(xiàn)circNDUFB2高表達(dá)與NSCLC患者的**大小、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和分期呈負(fù)相關(guān)。結(jié)果表明,circNDUFB2在NSCLC中經(jīng)常被下調(diào),并且與NSCLC的惡性特征呈負(fù)相關(guān)。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產(chǎn)生,長(zhǎng)度為249nt。circNDUFB2可由發(fā)散引物擴(kuò)增,收斂引物不能擴(kuò)增。核酸酶消化證實(shí)circNDUFB2具有閉環(huán)結(jié)構(gòu)。放線(xiàn)菌素D處理表明,與NDUFB2mRNA相比,circNDUFB2是穩(wěn)定的。核質(zhì)分離PCR以及熒光原位雜交(FISH)顯示circNDUFB2主要定位于細(xì)胞質(zhì)中。這些結(jié)果表明circNDUFB2是一個(gè)circRNA。完善的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)提供可視化的建模服務(wù)。細(xì)胞因子
2)在體內(nèi)和體外,DRD2的表達(dá)抑制BrCa細(xì)胞的**發(fā)生
構(gòu)建過(guò)表達(dá)DRD2的MDA-MB231和BT549細(xì)胞,通過(guò)RT-PCR(Figure2A)和WB(Figure2B)驗(yàn)證。CCK8實(shí)驗(yàn)證明,DRD2異位表達(dá)抑制**細(xì)胞生長(zhǎng)(圖2C)。在單層集落形成實(shí)驗(yàn)(圖2D)和軟瓊脂形成實(shí)驗(yàn)(圖2E)中,DRD2也損害了存活能力。并進(jìn)行細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期分布分析。DRD2的表達(dá)***促進(jìn)了BrCa細(xì)胞凋亡(圖2F),并阻斷了MDA-MB231和BT549在G2/M期的凋亡(圖2G)。此外,過(guò)表達(dá)DRD2促進(jìn)了BrCa細(xì)胞對(duì)PTX的敏感性(圖2H)。在傷口愈合實(shí)驗(yàn)中,異位表達(dá)的DRD2比對(duì)照組表現(xiàn)出更少的閉合人工傷口的能力(圖2I)。與此相一致的是,DRD2的過(guò)表達(dá)***降低了BrCa的遷移和侵襲(圖2J)。在體內(nèi)進(jìn)一步測(cè)定了DRD2的抑瘤作用。皮下**模型顯示過(guò)表達(dá)DRD2模型的**體積和重量均減小(圖2K)。 出生缺陷拷貝數(shù)TIMEOR用于推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。
一、異種HSCT前后監(jiān)測(cè)腸道、口腔和鼻腔微生物群和宿主免疫系統(tǒng)。
在1年的時(shí)間里,從29名兒童的10個(gè)時(shí)間點(diǎn)收集糞便樣本、口腔拭子和前鼻孔拭子:在HSCT前2次,HSCT當(dāng)天,HSCT后1個(gè)月每周,以及HSCT后12個(gè)月的3個(gè)隨訪(fǎng)時(shí)間點(diǎn)(圖1)。通過(guò)16SrRNA基因譜測(cè)定這些樣本中的微生物群落動(dòng)態(tài)。共對(duì)709份患者樣本(212份糞便樣本、248份口腔拭子和249份鼻拭子來(lái)自10個(gè)時(shí)間點(diǎn))進(jìn)行了鑒定。發(fā)現(xiàn)移植前患者的微生物群落組成與健康對(duì)照不同;三個(gè)身體部位性在HSCT后微生物α多樣性下降;在一年中,微生物群落動(dòng)態(tài)呈現(xiàn)出三個(gè)階段:第一階段(在檢查前和適應(yīng)開(kāi)始時(shí)的樣本),第二階段(HSCT的***天到第1個(gè)月),第三階段(月+3到月+12)(圖1C);第一階段和第三階段的樣本在口腔和鼻腔重疊,表明微生物群落可能從較晚的時(shí)間點(diǎn)恢復(fù)到與造血干細(xì)胞移植前類(lèi)似的狀態(tài)。
3)DRD2重新編碼MφM1表型,下調(diào)IL-6和IL-10
據(jù)報(bào)道,DRD2可調(diào)節(jié)M1的極化。結(jié)果顯示,在DRD2表達(dá)水平較高的BrCa組織中,M1Mφ的浸潤(rùn)增加,M2Mφ的浸潤(rùn)減少(圖3A)。為進(jìn)一步研究DRD2對(duì)TAMs的調(diào)控作用,構(gòu)建了BrCa與Mφ共培養(yǎng)體系。當(dāng)Mφ與表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞共培養(yǎng)時(shí),qRT-PCR顯示M1表型標(biāo)記增加,M2Mφ標(biāo)記下調(diào)(圖3B-C)。qRT-PCR也證實(shí)了載體轉(zhuǎn)染的BrCa細(xì)胞將Mφ調(diào)節(jié)為M2型(圖3C)[12]。WB結(jié)果顯示,表達(dá)DRD2的BrCa細(xì)胞上調(diào)M1標(biāo)記iNOS,下調(diào)M2標(biāo)記CD206(圖3D)。IF染色顯示,與表達(dá)DRD2的**細(xì)胞共培養(yǎng)后,Mφ表現(xiàn)為M1表型(圖3E)。上述結(jié)果表明,BrCa中的DRD2具有將Mφ重新編碼為M1表型的能力。為了探索使Mφ向M1表型分化的關(guān)鍵調(diào)控因子,我們進(jìn)行了細(xì)胞因子陣列分析。結(jié)果表明,TNF-α和兩種誘導(dǎo)M1極化的經(jīng)典細(xì)胞因子IFNγ均未增加。而與Mφ共培養(yǎng)后,DRD2***下調(diào)IL-6和IL-10(圖3F)。分析熒光值,進(jìn)一步證實(shí)IL-6和IL-10下調(diào)(圖3F)。因此,DRD2可以將Mφ重新編碼為M1表型,并在crosstalk過(guò)程中***下調(diào)IL-6和IL-10。 高通量分子實(shí)驗(yàn)的后續(xù)標(biāo)書(shū)申請(qǐng)指導(dǎo)服務(wù)。
VD通過(guò)Ca2+-CAMKK2途徑調(diào)控AMPK
AMPK通過(guò)上游激酶磷酸化***,主要包括STK11/LKB1和CAMKK2/CaMKKβ。為了確定AMPK激酶是否參與paricalcitol介導(dǎo)的AMPK***,我們使用STO-609(選擇性CAMKK抑制劑)、CAMKK2siRNA和HK-2STK11KO細(xì)胞。與STO-609或CAMKK2siRNA共同處理完全消除了paricalcitol刺激的PRKAA1和ULK1磷酸化。然而,paricalcitol能夠***HK-2STK11KO細(xì)胞中的PRKAA1和ULK1。這些結(jié)果表明paricalcitol通過(guò)CAMKK2***AMPK。由于CAMKK2主要受細(xì)胞內(nèi)Ca2+濃度的調(diào)節(jié)。為了闡明Ca2+信號(hào)在paricalcitol介導(dǎo)作用中的參與,我們使用熒光Ca2+探針Fluo4AM評(píng)估了細(xì)胞內(nèi)Ca2+濃度的變化對(duì)paricalcitol處理的響應(yīng)。如圖7D所示,當(dāng)HK2細(xì)胞暴露于高糖環(huán)境時(shí),Ca2+濃度下降,paricalcitol可以緩解這種下降。 醫(yī)學(xué)整體課題外包服務(wù)。核受體與輔助調(diào)節(jié)因子
提供整體課題外包實(shí)驗(yàn)構(gòu)思。細(xì)胞因子
藥物篩選確定**類(lèi)腸道中HIF-2α的合成易損性
作者構(gòu)建Apc缺失型(Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/fl)和CRCHIF-2α過(guò)表達(dá)小鼠模型(Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL),從這2個(gè)小鼠模型中分離腸類(lèi)藥物,并用化療藥物培養(yǎng),生長(zhǎng)被監(jiān)測(cè)了5天。在Cdx2-ERT2Cre;在Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL小鼠中,他莫昔芬可誘導(dǎo)HIF-2α,并特異性地破壞結(jié)腸上皮細(xì)胞中的Apc。來(lái)自Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/fl**腸系膜的小鼠對(duì)doxorubicin,mitoxantrone,irinotecan,以及eribulin等藥物高度敏感,與來(lái)自Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF2αLSL/LSL的不同。RSL3、sorafenib索拉菲尼、erastin和DMF被認(rèn)為是***的小分子,可以***降低Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF2αLSL/LSL**腸道類(lèi)物質(zhì)的生長(zhǎng)。Erastin和RSL3是經(jīng)典的ferroptosis***劑,分別抑制xCT(由Slc7a11基因編碼,是xC系統(tǒng)的一個(gè)組成部分)和GPX4。DMF一種細(xì)胞可滲透的線(xiàn)粒體衍生物,在一些**細(xì)胞系中具有細(xì)胞毒性這些結(jié)果表明,HIF-2α表達(dá)的**可以被氧化應(yīng)激***劑選擇性靶向。 細(xì)胞因子
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀,客戶(hù)可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專(zhuān)題,外泌體研究專(zhuān)題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng):提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě),標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)