陜西課題分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-11-05

此外,我們還鑒定了涉及**白復(fù)合體和剪接體的蛋白質(zhì)。核孔復(fù)合體(NPC)和NCT通路的組成部分是tbi后上調(diào)的主要蛋白子集(圖1圖補(bǔ)充1F)。鼻咽*通路此前尚未被認(rèn)為與創(chuàng)傷介導(dǎo)的神經(jīng)退行性變有關(guān),但據(jù)報(bào)道,在ALS/FTD、AD、HD和其他神經(jīng)退行性疾病中,鼻咽*通路被破壞。因此,我們決定進(jìn)一步研究鼻咽*改變介導(dǎo)TDP-43在TBI中的病理變化。蛋白質(zhì)組學(xué)分析顯示,一些Nups在腦損傷時(shí)被上調(diào)(圖1D和E)。對(duì)這些Nups的定量逆轉(zhuǎn)錄酶聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)分析證實(shí),TBI***上調(diào)Nup93-2、Nup54、Nup62、Nup44A,和Nup214 mRNA水平的果蠅幼蟲(圖1F I和圖1圖Supplement 1G)和成年大腦(圖1J L)。提供生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的課題思路設(shè)計(jì)。陜西課題分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

固醇調(diào)控元件結(jié)合蛋白(SREBPs)是***高脂血癥特征性膽固醇、脂肪酸和甘油三酯生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子。本研究中發(fā)現(xiàn)了一種小分子,白樺素,它通過(guò)誘導(dǎo)SREBP裂解***蛋白(SCAP) 與Insig相互作用特異性地抑制SREBP的成熟,進(jìn)而降低膽固醇和脂肪酸的生物合成,改善飲食誘導(dǎo)的肥胖,降低血清和組織中的脂質(zhì)含量,提高胰島素敏感性,減小***斑塊的大小。樺樹皮中含有豐富的白樺素,有望成為開發(fā)***高脂血癥藥物的先導(dǎo)化合物。本研究于2021年1月發(fā)表在《Cell Metabolism》IF:21.567期刊上。重慶課題詢問報(bào)價(jià)我們接下來(lái)研究了Pex對(duì)HSCs生物學(xué)行為的影響。

在Fth- KO小鼠中, TBI后褪黑素對(duì)神經(jīng)的保護(hù)作用被**取消

為了進(jìn)一步探索神經(jīng)元Fth的喪失是否影響褪黑素對(duì)TBI誘導(dǎo)的鐵死亡的影響,測(cè)量了鐵死亡的幾種假定的生物標(biāo)志物。發(fā)現(xiàn)***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平?jīng)]有影響。令人驚訝的是,盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達(dá)水平?jīng)]有顯著差異,但是在褪黑素***的小鼠中,觀察到Fpn mRNA和蛋白表達(dá)水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是,與未***的Fth- KO小鼠相比,用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA(Slc7a11,Ptgs2)和蛋白質(zhì)(xCT,Cox2、4HNE)的表達(dá)。另外,用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)上降低GSH和MDA以及4HNE的水平,和FJB陽(yáng)性細(xì)胞的數(shù)目。這些結(jié)果表明褪黑素沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)上減少TBI引起的鐵死亡和神經(jīng)元變性。

3)IGF-1信號(hào)在Pex誘導(dǎo)的HSC活化和肝纖維化中至關(guān)重要

為了進(jìn)一步探索Pex調(diào)控HSC行為的機(jī)制,我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測(cè)序基因表達(dá)譜(圖3A)。在差異表達(dá)基因中,我們觀察到41個(gè)重疊的上調(diào)基因在Pan02exo組與Npex組和KPCexo組與Npex組之間存在部分交集(圖3B)。主要涉及的基因參與細(xì)胞外空間、細(xì)胞外區(qū)域和ECM(圖3C),表明Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。此外,GO和KEGG通路分析顯示,IGF-1及其下游PI3K/AKT是受Pex影響的排名比較高的信號(hào)通路(圖3D,E)。westernblot分析支持了Pex***增加HSC中IGF-1R、IRS-1和AKT磷酸化的發(fā)現(xiàn)(圖3F)。當(dāng)使用IGF-1R抑制劑時(shí),Pex誘導(dǎo)的p-IGF-1R、p-IRS-1和p-AKT的上調(diào)被阻斷(圖3G)。基于這些結(jié)果,我們推測(cè)IGF-1信號(hào)可能是介導(dǎo)Pex依賴的HSC活化的關(guān)鍵因素。與預(yù)期的一樣,IGF-1R抑制劑抑制了Pex誘導(dǎo)的HSC的活化、增殖和遷移(圖4A-D)。此外,IGF-1R抑制劑逆轉(zhuǎn)了Pex誘導(dǎo)的HSC中ECM的產(chǎn)生(圖4E)。我們的體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明,IGF-1R抑制劑可以阻斷Pex誘導(dǎo)的肝纖維化(圖4F-I)。這些數(shù)據(jù)表明IGF-1信號(hào)在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。 促*分泌體通過(guò)外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。

生化分析結(jié)果顯示,過(guò)表達(dá)circRNF13會(huì)抑制NPC細(xì)胞的葡萄糖攝取和乳酸生成。海馬實(shí)驗(yàn)也表明過(guò)表達(dá)增加細(xì)胞的糖酵解能力,干擾則相反。通過(guò)檢測(cè)細(xì)胞內(nèi)AMPK的水平監(jiān)測(cè)糖酵解通路。研究表明當(dāng)糖酵解被抑制,細(xì)胞內(nèi)AMPK水平被磷酸化***,***的AMPK通過(guò)抑制mTOR會(huì)抑制蛋白合成和轉(zhuǎn)錄,進(jìn)而抑制**生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。結(jié)果顯示,過(guò)表達(dá)circRNF13***增加了NOC細(xì)胞中AMPKα的磷酸化并下調(diào)mTOR水平,并進(jìn)一步下調(diào)下游靶基因mTOR,pS6K和4EBP1的表達(dá);而敲除circRNF13則有相反的效果。當(dāng)加入糖酵解抑制劑2-DG后,敲除circRNF13不能下調(diào)AMPKα的磷酸化。此外,敲除circRNF13造成的NPC的增殖和遷移會(huì)被2-DG所廢除。以上結(jié)果表明circRNF13通過(guò)抑制糖酵解抑制NPC的遷移和侵襲。醫(yī)學(xué)整體課題外包服務(wù)。山西課題細(xì)胞實(shí)驗(yàn)

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食道*是世界上第六大**常見的**,據(jù)報(bào)道患者5年生存率只有12-20%。N6-甲基腺苷(m6A)修飾是真核生物mRNA中**豐富的RNA修飾,主要由m6A調(diào)節(jié)劑介導(dǎo)。m6A修飾調(diào)節(jié)RNA穩(wěn)定性和翻譯效率、染色質(zhì)狀態(tài)、替代聚腺苷酸化和前體mRNA剪接。

***我們來(lái)講一篇刊登在NatureCommunications(IF=14.91)上的一篇文章,題名為METTL3promotestumourdevelopmentbydecreasingAPCexpressionmediatedbyAPCmRNAN6-methyladenosine-dependentYTHDFbinding。上調(diào)METTL3與ESCC患者的不良生存相關(guān)

為探討食管*中中METTL3的表達(dá)譜,分析了**基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)與11個(gè)相鄰的正常食管上皮組織相比,95個(gè)食管*標(biāo)本中METTL3的表達(dá)***上調(diào)。對(duì)包含81對(duì)ESCC標(biāo)本和鄰近正常食管上皮組織的組織芯片進(jìn)行IHC染色顯示,ESCC組織中的METTL3表達(dá)水平***高于配對(duì)鄰近正常組織。Kaplan-Meier分析顯示,高表達(dá)METTL3的患者總生存時(shí)間比低表達(dá)METTL3的患者短。9種不同ESCC細(xì)胞系中METTL3mRNA和蛋白質(zhì)的表達(dá)水平高于Het-1a永生化正常食管上皮細(xì)胞。這些結(jié)果表明,METTL3在食管鱗*中表達(dá)上調(diào),并與食管鱗*患者生存時(shí)間呈負(fù)相關(guān)。 陜西課題分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

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4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序

5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)