7、CFL1/PLD1軸介導(dǎo)低氧誘導(dǎo)的HCC細(xì)胞中AKT途徑的***之前的一項(xiàng)研究表明,PLD1***AKT及其下游mTOR通路促進(jìn)HCC細(xì)胞增殖、侵襲。與此一致,作者觀察到CFL1敲除降低了p-AKT水平,在HCCLM3細(xì)胞中通過PLD1恢復(fù)增強(qiáng)了p-AKT水平(圖7A,C)。此外,PLD1沉默逆轉(zhuǎn)了CFL1誘導(dǎo)的Hep3B細(xì)胞中AKT信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的活化(圖7B,D)。值得注意的是,CFL1或PLD1敲除抑制了肝*細(xì)胞中缺氧誘導(dǎo)的AKT通路***和EMT過程(圖7E,F(xiàn))。之后,進(jìn)行拯救實(shí)驗(yàn)探討HIF-1α-CFL1-PLD1軸中PLD1的功能。在HCCLM3細(xì)胞中過表達(dá)的PLD1可以逆轉(zhuǎn)低氧條件下CFL1-shRNA引起的對AKT磷酸化或EMT過程的抑制(圖7G,H)??偟膩碚f,證實(shí)CFL1/PLD1軸在缺氧誘導(dǎo)的HCC進(jìn)展中起重要作用。
總之,該研究表明HCC中過表達(dá)CFL1與較差的臨床病理學(xué)參數(shù)呈正相關(guān)。體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證實(shí)CFL1是HCC**生長和轉(zhuǎn)移的驅(qū)動因素。PDL1/AKT通路介導(dǎo)CFL1的致*功能。此外,CFL1是一個缺氧反應(yīng)基因,通過***PLD1/AKT信號轉(zhuǎn)導(dǎo)參與缺氧誘導(dǎo)的HCC進(jìn)展(圖8)。綜上所述,該研究表明CFL1是低氧微環(huán)境與HCC進(jìn)展之間的一種新的連接體。 circSDHC是一個很有前景的RCC患者潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物和***靶點(diǎn)。重慶FISH標(biāo)書
4)USP35過表達(dá)減少erastin/RSL3觸發(fā)的鐵紊亂和鐵死亡
erastin和RLS3誘導(dǎo)的ROS和MDA生成因USP35過表達(dá)而減少(圖4A,B)。此外,在erastin和RLS3處理的*細(xì)胞中,HETEs水平升高,但在除12-HETE外的USP35過表達(dá)的*細(xì)胞中,HETEs水平降低(圖4C,F(xiàn))。然而,USP35過表達(dá)對GSH含量和GPX4活性沒有影響(圖4G,H)。如圖4I,J所示,USP35的過表達(dá)***減弱了用erastin或RSL3刺激H460和H1299細(xì)胞誘導(dǎo)LIP和Fe2+的作用。與表型改變一致,在基礎(chǔ)條件下,USP35過表達(dá)對鐵代謝和鐵死亡也沒有影響(圖4A,J)。 武漢醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)標(biāo)書第4周測定FITC標(biāo)記的葡聚糖(4kd)和血液中FITC水平。
SP35敲除促進(jìn)肺*細(xì)胞的鐵死亡
我們研究了shUSP35介導(dǎo)的**抑制是否可歸因于細(xì)胞死亡的誘導(dǎo)。如圖2A,B所示,用Nec-1,Z-VAD和CQ***以抑制壞死、凋亡和自噬并不影響細(xì)胞凋亡,表明可能涉及其他形式的細(xì)胞死亡。鐵死亡是一種新的調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡,它與包括肺*在內(nèi)的**生長的發(fā)病機(jī)制有關(guān)。因此,我們使用兩種鐵死亡抑制劑,F(xiàn)er-1和Lip-1,探索了鐵死亡是否導(dǎo)致USP35沉默后的肺細(xì)胞死亡。如圖2A,B所示,鐵死亡抑制阻斷了H460和H1299細(xì)胞中shUSP35介導(dǎo)的細(xì)胞死亡。在shUSP35***的細(xì)胞中,集落形成被抑制,但被Fer-1和Lip1破壞(圖2C)。
首先構(gòu)建MAO-A缺陷的小鼠,然后接種B16-OVA黑色素瘤細(xì)胞,結(jié)果顯示,與野生型相比,MAO-A缺陷小鼠的**生長被***抑制(圖1b-d)。流式檢測TAM的標(biāo)志物表達(dá),結(jié)果顯示MAO-A缺陷小鼠表現(xiàn)出更少的免疫抑制表型,即免疫抑制標(biāo)志物CD206表達(dá)***下調(diào),而免疫刺激分子CD9,CD86和MHC class II I-Ab的表達(dá)上調(diào)(圖1e-h)。進(jìn)一步的分析顯示,來自Maoa KO小鼠的TAMs免疫抑制相關(guān)基因表達(dá)水平降低,如Mrc1,Chi3l3和Arg1(圖1i),而免疫刺激相關(guān)基因表達(dá)上調(diào),如Il6,Tnfα和Ccl2(圖1j)。作者對野生型和Maoa KO小鼠進(jìn)行單細(xì)胞測序,分析了**浸潤免疫細(xì)胞(TIIs)。miR-127-3p是一種*****因子可下調(diào)CDKN3/E2F1軸的活性。
利用高通量RNA-seq和m6A-seq鑒定WTAP靶基因
為了進(jìn)一步驗(yàn)證WTAP介導(dǎo)的m6A甲基化對DLBCL細(xì)胞的影響,對對照組和WTAP缺失的SU-DHL-8細(xì)胞進(jìn)行m6A測序(m6A-seq)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),一致motifDRACH在免疫純化的RNA中富集(圖5A),m6A位點(diǎn)主要存在于外顯子和3’-UTR中,且m6A位點(diǎn)在終止密碼子附近富集程度比較高(圖5B),并通過篩選差異表達(dá)基因中出現(xiàn)的m6A低甲基化峰,鑒定出136個基因(圖5C)。HK2基因有助于**高糖酵解率,同時DLBCL在缺氧脅迫下促進(jìn)生長需要HK2。GSEA分析表明,WTAP的潛在靶基因與缺氧信號***相關(guān)(圖5D),提示HK2是DLBCL中WTAP的關(guān)鍵靶基因。m6A-seq數(shù)據(jù)顯示,WTAP靶向HK2轉(zhuǎn)錄本的5’-UTR,WTAP的敲除導(dǎo)致5’-UTR的m6A水平***下降(圖5E)。***作者為了驗(yàn)證HK2是否是WTAP靶基因,通過構(gòu)建熒光素酶報告載體和CRISPR/CAS9敲除實(shí)驗(yàn),證明了HK2是WTAP在DLBCL中的直接下游靶點(diǎn)(圖5F,5G,5H,5I,5J)。 LAG抗體***富集ciRS-7但未富集circNDUFB2.成都snoRNA標(biāo)書
神經(jīng)絲(NF-200)是神經(jīng)元軸突中富含的細(xì)胞特異性蛋白。重慶FISH標(biāo)書
此外,核輸出基因Emb (Exportin)的mRNA水平在tbi后***增加(圖1M),而與對照組相比,微管相關(guān)蛋白Futsch的mRNA水平?jīng)]有變化(圖1圖Supplement 1H),這與蛋白質(zhì)組學(xué)分析一致。Western blotting進(jìn)一步證實(shí)了tbi依賴性的果蠅幼蟲腦內(nèi)Nup214蛋白水平的升高(圖1N和O)。Western blot分析了損傷后幼蟲(0、2、4和6小時)和成蟲(0、2、4、24和72小時)的時間過程,以評估Nup214蛋白的水平。在檢測的時間點(diǎn)上,不管是幼蟲還是成人的大腦中,Nup214蛋白的水平都是上調(diào)的(圖1P,Q,R,S),這表明創(chuàng)傷可能會破壞Nup214的水平和體內(nèi)的轉(zhuǎn)換。重慶FISH標(biāo)書
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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
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6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
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