驗(yàn)證LIR基序突變影響自噬
在HEK293T細(xì)胞中進(jìn)行co-IP，結(jié)果表明STBD1LIR基序W203C是影響基因互作的重要結(jié)構(gòu)。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，STBD中W203C突變影響其與GABARAPL1的結(jié)合，進(jìn)而影響自噬指標(biāo)的表達(dá)。
5. 在臨床樣本中檢測(cè)STBD1的表達(dá)
在*組織、*旁中檢測(cè)STBD1的表達(dá)水平，結(jié)果表明STBD1在*組織中***下調(diào)，與之前的預(yù)測(cè)結(jié)果一致。
6.細(xì)胞實(shí)驗(yàn)研究STBD1的功能
在多種*細(xì)胞中進(jìn)行細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)，STBD1抑制*細(xì)胞生長(zhǎng)，突變W203C會(huì)部分回復(fù)STBD1的抑制作用。
7.動(dòng)物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證STBD1的功能
裸鼠成瘤實(shí)驗(yàn)表明，STBD1抑制**生長(zhǎng)。
8.轉(zhuǎn)錄組、代謝組分析
在細(xì)胞中干擾STBD1，然后進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，分析表達(dá)水平***改變的基因，并進(jìn)行通路富集分析。分析發(fā)現(xiàn)，STBD1抑制**生長(zhǎng)可能是通過(guò)改變基因轉(zhuǎn)錄和重塑糖酵解/糖異生途徑。
為了進(jìn)一步驗(yàn)證STBD1是否重塑代謝，進(jìn)行代謝組分析。結(jié)果表明，STBD1敲除后糖酵解增強(qiáng)。
9.構(gòu)建LIRCP調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)
將LAMs對(duì)應(yīng)蛋白、自噬相關(guān)基因按照生物學(xué)功能聚類(lèi)，構(gòu)建調(diào)節(jié)網(wǎng)絡(luò)，將自噬與**聯(lián)系起來(lái)。 FMT處理導(dǎo)致緊密連接蛋白表達(dá)上調(diào)并促進(jìn)SCI后的腸道屏障完整性的維持。山西標(biāo)書(shū)服務(wù)價(jià)格
人類(lèi)乳腺*患者中LINC00926和PGK1表達(dá)的相關(guān)性及LINC00926與葡萄糖攝取的相關(guān)性我們通過(guò)IHC和FISH檢測(cè)109例人乳腺*樣本中PGK1和LINC00926的表達(dá)情況。與培養(yǎng)細(xì)胞中LINC00926***PGK1的結(jié)果一致，LINC00926的表達(dá)與PGK1的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)，與FOXO3A呈正相關(guān)(圖8A)。通過(guò)18FDGPET掃描評(píng)估葡萄糖攝取增加的乳腺**患者顯示LINC00926和FOXO3A表達(dá)降低，而PGK1表達(dá)增加(圖8B)。綜上所述，這些數(shù)據(jù)表明了LINC00926/PGK1軸在乳腺*中的重要病理作用。
我們的研究***證實(shí)了LINC00926通過(guò)***糖酵解關(guān)鍵酶PGK1的表達(dá)來(lái)***糖酵解，從而在體內(nèi)外***乳腺*細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。在乳腺*患者中，F(xiàn)OXO3A調(diào)控的LINC00926與PGK1表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)概述了FOXO3A/LINC00926/PGK1軸在Warburg效應(yīng)和乳腺**發(fā)生進(jìn)展中的重要性。因此，上調(diào)LINC00926可能是***PGK1過(guò)表達(dá)的乳腺*患者的一種有前途的方法 山西標(biāo)書(shū)服務(wù)價(jià)格circSDHC是一個(gè)很有前景的RCC患者潛在的預(yù)后生物標(biāo)志物和***靶點(diǎn)。
研究了方法差異對(duì)下游生物學(xué)分析的影響A.B.去除中性粒細(xì)胞**提高了在細(xì)胞核和細(xì)胞的均勻流形近似和投影(UMAP)投影中分離各種細(xì)胞類(lèi)型的能力.C使用這些工具，中性粒細(xì)胞的去除提高了標(biāo)記轉(zhuǎn)移評(píng)分，與核基方法相比，滲透性細(xì)胞產(chǎn)生了更多具有高標(biāo)記轉(zhuǎn)移評(píng)分的細(xì)胞.D所有方法產(chǎn)生的CD16+單核細(xì)胞均少于流式細(xì)胞術(shù)觀(guān)察到的CD16+單核細(xì)胞，這表明無(wú)論是使用核或通透細(xì)胞的scATAC-seq過(guò)程中，CD16+單核細(xì)胞可能丟失，或者標(biāo)簽轉(zhuǎn)移方法不利于識(shí)別這種細(xì)胞類(lèi)型.
2、白樺素下調(diào)SREBP靶基因，降低細(xì)胞脂質(zhì)水平
由于SREBP-2是其自身的直接靶標(biāo)，因此白樺素將其表達(dá)下調(diào)40％（圖3A）。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子這一觀(guān)點(diǎn)一致，膽固醇合成途徑中的10個(gè)被測(cè)基因，例如HMGCR，HMG-CoA合酶（HMGCS）和角鯊烯環(huán)氧酶（SE），都被白樺素處理抑制了（圖3A）。類(lèi)似地，與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關(guān)的所有9個(gè)基因，例如SREBP-1c，脂肪酸合酶（FAS）和乙酰輔酶A羧化酶α（ACC），都被白樺素顯著下調(diào)（圖3B）。與早期觀(guān)察結(jié)果一致（圖1A），包括ABCG5和ABCG8在內(nèi)的LXR靶基因不受白樺素的影響（圖3C）。 circSDHC在ccRCC中過(guò)表達(dá)且其過(guò)表達(dá)與低存活率相關(guān).
接著作者為了進(jìn)一步證明YTHDC2與LUAD的關(guān)系，與相鄰的*旁組織相比，在LUAD**中觀(guān)察到Y(jié)THDC2 mRNA和蛋白的***下調(diào)(圖1E-G)，組織芯片檢測(cè)(TMA)評(píng)估cohort #1中YTHDC2的表達(dá)，結(jié)果顯示51% (98/192) LUAD患者的YTHDC2表達(dá)下調(diào)(圖1H、I)。值得注意的是，YTHDC2表達(dá)下調(diào)與更大的**直徑和更晚期的分期相關(guān)(圖1J、K)。表明抑制YTHDC2可促進(jìn)LUAD的**進(jìn)展。
2.過(guò)表達(dá)YTHDC2抑制細(xì)胞活力和**發(fā)生
為了探索YTHDC2在體內(nèi)的m6A解讀器功能，作者構(gòu)建AAV5表達(dá)系統(tǒng)(KPYWT、KPYΔYTH和對(duì)照KPE)(圖2A)。與KPE小鼠***25周后的**相比，KPYWT和KPYΔYTH小鼠的**證實(shí)了YTHDC2持續(xù)上調(diào)(圖2B)，這表明AAV5表達(dá)系統(tǒng)具有持久的效率。雖然YTHDC2不能阻止**的發(fā)生，但**發(fā)生時(shí)間延遲，**負(fù)荷明顯受到抑制，KPYWT小鼠的生存時(shí)間比KPE小鼠和KPYΔYTH小鼠更長(zhǎng)(圖2C-F)。 采用LEfSe方法分析經(jīng)DHEA和tempol處理后***改變的關(guān)鍵系統(tǒng)發(fā)育類(lèi)型。安徽標(biāo)書(shū)免費(fèi)設(shè)計(jì)
第4周測(cè)定FITC標(biāo)記的葡聚糖(4kd)和血液中FITC水平。山西標(biāo)書(shū)服務(wù)價(jià)格
作者進(jìn)一步研究YTHDC2是否是存在人類(lèi)LUAD細(xì)胞中的一種**抑制因子。IB檢測(cè)證實(shí)了YTHDC2的過(guò)表達(dá)和敲除效率(圖2G和S2A)。然而在H1299細(xì)胞中過(guò)表達(dá)YTHDC2WT后，**3D球體的數(shù)量和大小以及異種移植瘤的生長(zhǎng)下降，但在過(guò)表達(dá)YTHDC2ΔYTH時(shí)沒(méi)有觀(guān)察到這些現(xiàn)象(圖2 H-K)。相比之下，敲除H1975細(xì)胞中的YTHDC2增加了小鼠的球體形成和異種移植瘤的生長(zhǎng)(圖S2B-E)。值得注意的是，當(dāng)使用YTHDC2sg2?resistant (res)重組YTHDC2表達(dá)時(shí)，YTHDC2sg2在**發(fā)生中的陽(yáng)性作用得到了恢復(fù)(圖S2B-E)。因此，YTHDC2通過(guò)其m6A閱讀域在LUAD中發(fā)揮**抑制功能。山西標(biāo)書(shū)服務(wù)價(jià)格
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀(guān)，客戶(hù)可隨時(shí)參觀(guān)實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專(zhuān)題，外泌體研究專(zhuān)題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng)：提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě)，標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀(guān)遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)