瀏覽工具將PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)歸納為兩類(lèi)：“目標(biāo)瀏覽”和“化合物瀏覽”。目標(biāo)瀏覽將在“PROTAC”、“彈頭”、“E3配體”和“Linker”類(lèi)別選項(xiàng)卡下顯示目標(biāo)蛋白質(zhì)的名稱(chēng)列表，點(diǎn)擊列表中選定的蛋白質(zhì)將跳轉(zhuǎn)到與該蛋白質(zhì)相對(duì)應(yīng)的所有化合物的列表?；衔餅g覽主要用于可視化“PROTAC”、“彈頭”、“E3配體”和“Linker”類(lèi)標(biāo)簽下所有化合物的二維結(jié)構(gòu)。此外，在“PROTAC”、“彈頭”和“E3配體”類(lèi)標(biāo)簽下還將展示生物活性。
可視化和過(guò)濾數(shù)據(jù)表中的結(jié)果查詢(xún)或?yàn)g覽結(jié)果顯示為數(shù)據(jù)表，包含2D結(jié)構(gòu)和其他信息，如化合物ID、目標(biāo)蛋白質(zhì)和生物活性(圖2)。 腸道微生物發(fā)酵的某些**終產(chǎn)物可進(jìn)入血液影響宿主***系統(tǒng)的生理功能。江蘇microRNA標(biāo)書(shū)
PGE2增強(qiáng)IL4Rα信號(hào)以增強(qiáng)巨噬細(xì)胞的M2***
巨噬細(xì)胞能夠響應(yīng)可變的局部微環(huán)境信號(hào)從一種功能表型切換到另一種功能表型。除了經(jīng)典的信號(hào)級(jí)聯(lián)（例如，IL4/IL4Rα），巨噬細(xì)胞還可以整合由細(xì)胞外刺激觸發(fā)的代謝線索，以***它們的M2表型。在這里，我們想知道PGE2是否也參與了AP損傷后胰腺巨噬細(xì)胞的M2極化。為此，我們首先檢查了AP損傷后PGE2的動(dòng)態(tài)表達(dá)。COX1和COX2是產(chǎn)生前列腺素的兩種關(guān)鍵酶。在這里我們發(fā)現(xiàn)Ptgs2(COX2)的表達(dá)在第3天達(dá)到峰值，而Ptgs1(COX1)的表達(dá)在第1天下降并在第3天回到基礎(chǔ)水平。一致地，免疫熒光分析顯示PGE2在第3天升高，并在第5天迅速恢復(fù)到基礎(chǔ)水平。值得注意的是，PGE2在第3天主要與導(dǎo)管樣細(xì)胞（CK19+細(xì)胞）共表達(dá)，以及部分與巨噬細(xì)胞（F4/80+細(xì)胞）共表達(dá)。此外，根據(jù)我們的RNA-seq數(shù)據(jù)和流式細(xì)胞術(shù)分析，我們發(fā)現(xiàn)巨噬細(xì)胞中COX2的表達(dá)也在第3天達(dá)到峰值。更有趣的是，與IL4Rα-巨噬細(xì)胞和單核細(xì)胞相比，IL4Rα+巨噬細(xì)胞表達(dá)了更高水平的COX2。 廣州MCD誘導(dǎo)標(biāo)書(shū)Tempol是一種潛在的***多囊卵巢綜合征的策略。
5）下調(diào)STK39可抑制乳腺*細(xì)胞EMT、遷移和侵襲為了進(jìn)一步研究STK39在乳腺*中的作用，我們?cè)贛DA-MB-231和MDA-MB-157細(xì)胞中建立了STK39敲低的克隆。我們使用兩個(gè)**的shRNA實(shí)現(xiàn)了內(nèi)源性STK3980-90%的敲除效率。在這兩個(gè)克隆中，STK39敲低增加了CDH1的水平，下調(diào)了N-cadherin的表達(dá)。STK39的缺失***增加了上皮標(biāo)記物的mRNA表達(dá)水平。免疫熒光分析也提示CDH1上調(diào)，N-cadherin下調(diào)。STK39基因敲除極大地抑制了這些細(xì)胞的遷移和侵襲能力)。STK39敲除的克隆中SNAI1的表達(dá)在很大程度上恢復(fù)了STK39消融誘導(dǎo)的效應(yīng)。此外，TGF-β1處理誘導(dǎo)MCF10A細(xì)胞EMT并***SNAI1表達(dá)。STK39缺失***抑制EMT和SNAI1的表達(dá)。綜上所述，STK39在很大程度上以SNAI1依賴(lài)的方式增強(qiáng)乳腺*轉(zhuǎn)移。
Blimp-1在持續(xù)刺激下抑制PGC1α
持久抗原對(duì)于改變向衰竭分化至關(guān)重要，但其代謝后果尚不清楚。由于連續(xù)的刺激不產(chǎn)生明顯的代謝抑制，持續(xù)的刺激可能***一個(gè)轉(zhuǎn)錄抑制因子，阻止代謝重編程。Blimp-1(由Prdm1編碼)就是這樣一種抑制因子，在B16黑色素瘤中**終耗盡的CD8+ T細(xì)胞中高度上調(diào)(圖4a)，并在缺氧條件下持續(xù)***(圖4b)。體外缺氧條件下持續(xù)***的T細(xì)胞也抑制PGC1α的表達(dá)(圖4c)。 進(jìn)一步確定Blimp-1是否可以抑制PGC1α，發(fā)現(xiàn)強(qiáng)制表達(dá)Blimp-1可以抑制293T細(xì)胞中Ppargc1a啟動(dòng)子構(gòu)建的活性，而不影響其活力(圖4d)。Prdm1f/fCd4Cre小鼠的CD8+ T細(xì)胞通過(guò)在缺氧條件下持續(xù)***而抵抗功能障礙(圖4e,f)，而在持續(xù)***條件下無(wú)法抑制Ppargc1a的表達(dá)(圖4g)。在PD-1hiTim3+ TILs中，Blimp-1的缺失導(dǎo)致了通過(guò)IL-2和**壞死因子(TNF)產(chǎn)生的線粒體質(zhì)量和多功能性的恢復(fù)(圖4h, i)。 免疫組織學(xué)染色顯示TNFαIL-1β和NF- κ b陽(yáng)性染色主要分布在結(jié)腸黏膜層。
***是一種系統(tǒng)性疾病，與炎癥細(xì)胞浸潤(rùn)和免疫相關(guān)途徑的***有關(guān)。本文旨在揭示與免疫相關(guān)的變化，并探索頸***斑塊形成過(guò)程中的新型免疫學(xué)特征。首先，我們應(yīng)用了集成的生物信息學(xué)方法，包括CIBERSORT和基因集富集分析（GSEA）?；虮磉_(dá)矩陣GSE28829，GSE41571和GSE43292是從基因表達(dá)綜合（GEO）數(shù)據(jù)集獲得的。經(jīng)過(guò)一系列數(shù)據(jù)預(yù)處理步驟后，使用CIBERSORT，GSEA和ClusterProfiler軟件包對(duì)所得的組合表達(dá)矩陣進(jìn)行了分析。在對(duì)早期和晚期頸***斑塊進(jìn)行比較和分析后，我們發(fā)現(xiàn)，在晚期斑塊中活化記憶CD4T細(xì)胞的百分比較高，而靜息記憶CD4細(xì)胞的百分比較低。此外，記憶CD4T細(xì)胞的***可以促進(jìn)頸***斑塊的發(fā)展。另外，F(xiàn)OXP3tTreg細(xì)胞成熟也可以參與頸動(dòng)脈斑塊的進(jìn)展。circRNAs在**的發(fā)展和進(jìn)展中發(fā)揮著重要的調(diào)控作用.Caspase-11標(biāo)書(shū)深圳
RCC細(xì)胞中CDKN3基因敲除導(dǎo)致細(xì)胞增殖率降低.江蘇microRNA標(biāo)書(shū)
再生胰腺中胰腺巨噬細(xì)胞的動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄組譜
為了進(jìn)一步了解AP恢復(fù)過(guò)程中巨噬細(xì)胞的表型和功能，分離出胰腺巨噬細(xì)胞用于RNA-seq分析。顯著性差異表達(dá)基因繪制熱圖。為了評(píng)估這些基因簇的功能，使用網(wǎng)絡(luò)工具DAVIDGeneOntology(GO)進(jìn)行了功能注釋分析。值得注意的是，在急性炎癥期（簇32，D1特征簇）高度表達(dá)的基因特別富集炎癥反應(yīng)和CCR2依賴(lài)性趨化性。簇25和27包含在ADM階段（第3天）高表達(dá)的基因，具有不同的表達(dá)模式和功能，表明該階段的巨噬細(xì)胞異質(zhì)性。例如，與ECM-受體相互作用和PI3K-AKT信號(hào)通路相關(guān)的基因在簇27中富集，而與細(xì)胞周期相關(guān)的基因在簇25中富集。 江蘇microRNA標(biāo)書(shū)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)