外泌體S100A4通過STAT3磷酸化***OPN轉(zhuǎn)錄接下來探究了S100A4的作用機制，首先選擇了21個**干性相關(guān)基因，然后下載了GEO數(shù)據(jù)進行相關(guān)性分析，結(jié)果顯示S100A4主要和11個基因正相關(guān)（圖4a）。隨后檢測了不同HCC細胞系中敲除和過表達S100A4后11個基因的表達水平的改變，結(jié)果顯示只有OPN是S100A4的下游基因，其表達受到S100A4的調(diào)控（圖4b-f）。OPN是促進HCC轉(zhuǎn)移和干性的關(guān)鍵因子，但外泌體S100A4調(diào)節(jié)OPN的機制仍不清楚。這些結(jié)果證實了外泌體S100A4具有增強HCC細胞轉(zhuǎn)移潛力的功能circNDUFB2敲低促進這些表型。Caspase-11標書深圳
2021年6月，***一篇發(fā)表在Microbiome（IF=11.607）的文章（Microbiota long-term dynamics and prediction of acute graft-versus-host disease in pediatric allogeneic stem cell transplantation.）從共生功能體視點的角度對29名接受同種異體造血干細胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細菌可能預測急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監(jiān)測HSCT患者不同身體部位的微生物群，特別是通過移植前樣本的參與，可能具有預后價值，并有助于指導個性化***策略。識別具有預測移植后aGvHD潛力的獨特細菌，可能為改進預防性臨床管理提供機會，包括對微生物群的調(diào)節(jié)。江蘇流式標書短鏈脂肪酸與運動恢復/腸屏障通透性的相關(guān)性。
為了了解白樺素和他汀類藥物的抗DIO作用，進一步分析了脂質(zhì)吸收，體力活動和能量消耗。在洛伐他汀***的小鼠中，盡管呼吸商（RQ）增強，表明從體內(nèi)利用葡萄糖和蛋白質(zhì)進行能量生產(chǎn)已超過脂質(zhì)氧化，但耗氧量和總能量消耗仍與WD喂養(yǎng)的小鼠相似（圖4F-4H）。另一方面，用洛伐他汀喂養(yǎng)的小鼠的糞便膽固醇和甘油三酸酯（TG）顯著增加（圖4C和4D），表明洛伐他汀降低脂質(zhì)吸收或增加脂質(zhì)排泄，從而拮抗DIO。這一觀察結(jié)果與以前的報告是一致的。另一方面，白樺素對脂質(zhì)吸收/排泄沒有影響（圖4C和4D）。
揭示轉(zhuǎn)錄因子如何隨著時間的推移在DNA、RNA和蛋白質(zhì)水平上調(diào)節(jié)其靶標，對于定義基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(GRN)和分配正常和疾病狀態(tài)的機制至關(guān)重要。RNA-seq是一種使用已建立的分析階段測量基因調(diào)控的標準方法。然而，目前可用的用于解釋有序基因組數(shù)據(jù)（在時間或空間上）的管道方法都沒有使用時間序列模型來分配GRN內(nèi)的因果關(guān)系。此外，也需要將有序的RNA-seq數(shù)據(jù)與蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合數(shù)據(jù)相結(jié)合以區(qū)分直接與間接相互作用的方法。
TIMEOR是***個基于Web的自適應時間序列多組學管道方法，它可以推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。TIMEOR通過利用時間序列RNA-seq、基序分析、蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，解決了對確定因果調(diào)節(jié)機制網(wǎng)絡(luò)的方法的關(guān)鍵需求。 FMT可能通過***NF -κB信號通路來緩解腸道炎癥。
并同年在同期刊中發(fā)表，遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生，Tspan4a和Tspan7（遷移體生成相關(guān)基因）突變體斑馬魚的***形態(tài)發(fā)生受損，并闡明遷移體誘導胚胎細胞至正確的位置，從而影響***形態(tài)發(fā)生[5]。2019年俞立團隊還發(fā)表了關(guān)于遷移體標志物的文章[6]，該文章闡明了人血清中存在遷移體；與外泌體相比，遷移體中存在四種特異性蛋白：NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。
2021年5月，俞立團隊在Cell期刊（IF=38.637）上發(fā)表文章，文章主要講述在外界刺激下，細胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月，俞立團隊利用斷層成像技術(shù)研究不同物種的大規(guī)模細胞遷移和神經(jīng)活動，并觀察了哺乳動物在中性粒細胞遷移和**細胞循環(huán)過程中的各種亞細胞動力學[8]，該研究成果亦發(fā)表于Cell期刊中。 circSDHC通過充當miR-127-3p的海綿促進ccRCC的進展和轉(zhuǎn)移.浙江NF-kB標書
FMT處理可恢復SCI小鼠中糞便短鏈脂肪酸(SCFAs)。Caspase-11標書深圳
我們進一步研究了 YTHDC2 是否是人類 LUAD 細胞中的**抑制因子。選擇 H1975 和 H1299 細胞是因為它們分別在測試的 LUAD 細胞系中表現(xiàn)出比較高和比較低的 YTHDC2 表達。IB 檢測證實了 YTHDC2 的過表達和敲除效率。雖然在 H1299 細胞中YTHDC2 WT過表達后3D 球體的數(shù)量和大小以及異種移植物的**生長減少，但在 YTHDC2 ΔYTH過表達后未觀察到這些影響。相比之下，敲除 H1975 細胞中的 YTHDC2 會增加小鼠的球體形成和異種移植物生長。值得注意的是，當使用 YTHDC2 sg2-抗性（res）重建 YTHDC2 表達時，YTHDC2-sg2 在**發(fā)生中的積極作用得以恢復。因此，YTHDC2 通過其 m 6 A 閱讀域在 LUAD 中發(fā)揮**抑制功能。這些結(jié)果也解釋了為什么 Ythdc2 在鼠**中的顯著表達和 H1299 細胞中的 YTHDC2當突變體過表達時，沒有改變轉(zhuǎn)化表型。Caspase-11標書深圳
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗