3、tiRNA-Gly直接與RBM17相互作用，調(diào)控RBM17在PTC細(xì)胞中的表達(dá)
為了探究tiRNA-Gly在促*中分子機(jī)制，作者合成了生物素標(biāo)記的tiRNA-Gly及其反義序列，進(jìn)行RNApull-down實驗，進(jìn)而挖掘K1細(xì)胞中與tiRNA-Gly相互作用的蛋白。結(jié)果發(fā)現(xiàn)了一個50KD左右大小的條帶，選擇經(jīng)質(zhì)譜測定肽數(shù)>3和獨特肽數(shù)>3的蛋白，獲得了5個可能的tiRNA-Gly相互作用蛋白，其中RBN17通過了WB驗證（圖2B）。RIP實驗也證實tiRNA-Gly在RBM17抗體組富集（圖3C）。進(jìn)一步RIP實驗表明，tiRNA-Gly在RBM17全長序列中***富集，但在UHM截斷后的序列中富集度***下降，表明tiRNA-Gly和RBM17的相互作用依賴UHM（圖3D）。此外，與tiRNA-Gly的相互作用促進(jìn)了K1細(xì)胞RBM17從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)移到細(xì)胞核，雖然tiRNA-Gly主要定位于細(xì)胞質(zhì)，但同時導(dǎo)致K1細(xì)胞胞質(zhì)RBM17蛋白水平降低，核RBM17蛋白水平升高（圖3E-G）。因此，這些研究表明tiRNA-Gly與RBM17的UHM結(jié)合促進(jìn)RBM17的核轉(zhuǎn)運。 采用UPGMAPCoA和NMDS評估不同群體的腸道菌群β-多樣性.浙江標(biāo)書推薦咨詢
5’-Trf-GlyGCC的表達(dá)隨著CRC進(jìn)展而增加。此外，5’-tRF-GlyGCC在I/II期CRC患者中的豐度明顯低于III/IV期患者。轉(zhuǎn)移組患者血漿5’-tRF-GlyGCC水平明顯高于無轉(zhuǎn)移組。CEA≥5ng/ml組的5’-tRF-GlyGCC水平明顯高于CEA<5ng/ml。CRC患者CA199≥37IU/ml的5’-tRF-GlyGCC水平明顯高于CA199<37IU/ml。結(jié)果顯示，CRC患者血漿中5’-tRF-GlyGCC水平與CEA和CA199水平***正相關(guān)。5’-tRF-GlyGCC在結(jié)直腸*患者血漿中上調(diào)，并隨著結(jié)直腸*的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移而升高。收集16對**組織和血漿樣本，驗證5’-tRF-GlyGCC在CRC組織和相同患者血漿中的表達(dá)是否存在相關(guān)性。結(jié)果顯示5’-tRF-GlyGCC在血漿中的表達(dá)與配對CRC組織中的表達(dá)***相關(guān)。提示血漿中5’-tRF-GlyGCC水平較高的患者在結(jié)直腸*組織中5’-tRF-GlyGCC水平也較高。代謝組學(xué)標(biāo)書實驗外包PCOS大鼠血清水蘇糖水平升高。
CircACTN4直接與FUBP1相互作用并***MYC的轉(zhuǎn)錄。
為了探索circACTN4的分子機(jī)制，首先進(jìn)行了pulldown和質(zhì)譜分析circACTN4結(jié)合蛋白，發(fā)現(xiàn)FUBP1在circACTN4上顯著富集。RIP檢測進(jìn)一步證實FUBP1可以通過qRT-PCR與BC細(xì)胞中的內(nèi)源性circACTN4特異性結(jié)合。FISH-IF分析顯示circACTN4和FUBP1共定位于細(xì)胞核中。但是circACTN4的上調(diào)和敲低并沒有改變FUBP1的表達(dá)水平，表明circACTN4不參與FUBP1的翻譯后調(diào)控。ChIP-PCR測定證實FUBP1與BC細(xì)胞中MYC啟動子結(jié)合。構(gòu)建了FUBP1和FIR過表達(dá)和敲低質(zhì)粒。通過qRT-PCR和蛋白質(zhì)印跡確定轉(zhuǎn)染效率。qRT-PCR和WB的結(jié)果表明，F(xiàn)UBP1的上調(diào)或下調(diào)分別顯著增加或降低了BC細(xì)胞中MYC的表達(dá)水平。此外，qRT-PCR發(fā)現(xiàn)FUBP1在BC組織中的表達(dá)明顯高于鄰近正常組織中的表達(dá)。Pearson相關(guān)分析表明circACTN4的水平與BC組織中FUBP1的表達(dá)呈正相關(guān)。
微生物群對宿主的適應(yīng)性免疫系統(tǒng)如T細(xì)胞發(fā)揮免疫調(diào)節(jié)功能。例如，與擬桿菌屬和梭狀芽胞桿菌相關(guān)的人類共生腸道菌株可以在無菌小鼠中誘導(dǎo)T調(diào)節(jié)(Treg)細(xì)胞。**近的研究表明，功能不同的T細(xì)胞亞群，如輔助T細(xì)胞17 (TH17)和Treg細(xì)胞參與了aGVHD的發(fā)病機(jī)制。除腸道外的身體部位的微生物群，如口腔和鼻腔，也被認(rèn)為參與免疫調(diào)節(jié)。我們之前曾提出，腸道微生物群與同種異體造血干細(xì)胞移植后的免疫細(xì)胞重建有關(guān)。然而，其他粘膜部位的微生物群是否受同種異體造血干細(xì)胞移植的影響，是否與aGvHD相關(guān)，是否與患者免疫系統(tǒng)的恢復(fù)相關(guān)，目前尚不清楚。circSDHC通過充當(dāng)miR-127-3p的海綿促進(jìn)ccRCC的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移.
為了檢查hnRNPA2B1和p53前體mRNA的關(guān)聯(lián)，進(jìn)行使用抗hnRNPA2B1的RIP測定，證明hnRNPA2B1與p53前體mRNA相互作用。使用生物素化的反義DNA探針提取了p53前體mRNA。hnRNPA2B1被共沉淀。hnRNPA2B1敲低導(dǎo)致p53的前體mRNA和蛋白質(zhì)水平降低。這些結(jié)果表明hnRNPA2B1可能對p53前體mRNA發(fā)揮穩(wěn)定作用。qPCR結(jié)果顯示hnRNPA2B1敲低可以消circMYH9缺失對p53pre-mRNA表達(dá)的促進(jìn)作用，而hnRNPA2B1過表達(dá)可以挽救由circMYH9過表達(dá)誘導(dǎo)的p53前體mRNA的下調(diào)表達(dá)。circMYH9敲低增加了hnRNPA2B1和p53前體mRNA之間的結(jié)合，而增加的circMYH9表達(dá)減弱了hnRNPA2B1與p53前體mRNA的結(jié)合。這些發(fā)現(xiàn)表明circMYH9通過阻止hnRNPA2B1與p53前體mRNA結(jié)合來抑制p53前體mRNA的穩(wěn)定性。脊髓損傷（Spinal cord injury, SCI）患者表現(xiàn)出腸道菌群紊亂而腸道失調(diào)加重SCI模型中的神經(jīng)損傷。甘肅標(biāo)書歡迎咨詢
FMT處理可以改善脊髓損傷小鼠的運動恢復(fù)。浙江標(biāo)書推薦咨詢
m6A RNA甲基化是mRNA轉(zhuǎn)錄后**常見的內(nèi)部甲基化。這是一個由m6A WER系統(tǒng)控制的可逆過程，由書寫器(W)、擦除器(E)和閱讀器(R)組成，而m6A甲基化的**終結(jié)果取決于特異性閱讀器的識別并結(jié)合。目前研究發(fā)現(xiàn)抑制肺腺*(LUAD)與m6A閱讀器YTHDC2相關(guān)。該研究2021年1月發(fā)表在《Redox biology》，IF：11.799的期刊上。
1.YTHDC2表達(dá)在LUAD中被抑制，且與臨床預(yù)后差相關(guān)
為了驗證m6A閱讀器在肺*的表達(dá)，作者通過GEPIA數(shù)據(jù)庫分析了LUAD中已知的閱讀器，包括YTHDF1/2/3、YTHDC1/2、HNRNPA2B1、HNRNPC/G、eIF3A、FMR1和IGF2BP1/2。如圖1A和B顯示，與正常肺相比，LUAD中YTHDC2、IGF2BP2表達(dá)下調(diào)，而結(jié)合Oncomine數(shù)據(jù)庫和Kaplan-Meier圖譜進(jìn)一步分析，發(fā)現(xiàn)較低的YTHDC2與LUAD患者較差的總生存率相關(guān)(圖1D)，這證實了YTHDC2與LUAD存在負(fù)相關(guān)的關(guān)系。 浙江標(biāo)書推薦咨詢
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1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗