由于腸道微生物群在多囊卵巢綜合征的起始和發(fā)展中起著重要作用，作者還研究DHEA和tempol是否影響腸道的氧化還原狀態(tài)。腸道MDA、3-NT和AGEs水平在PCOS大鼠中***高于對(duì)照組和氧化生物標(biāo)記的增加被tempol處理消除(圖3K-M)。此外，tempol***增加PCOS大鼠的腸道SOD1和SOD2表達(dá)(圖3N)。因此，這些結(jié)果表明tempol能夠降低PCOS大鼠的腸道氧化應(yīng)激。
4.Tempol減輕PCOS大鼠腸道微生物失調(diào)
隨后，通過rarefaction和Shannon曲線(Fig.4A-B)，以及4個(gè)α-多樣性指數(shù)(ACE)、Shannon、Simpson和Chao1來(lái)評(píng)估細(xì)菌群落的豐度和多樣性。當(dāng)序列增加到2000時(shí)多個(gè)樣本稀疏曲線往往是平坦的，這表明測(cè)序數(shù)據(jù)的數(shù)量是合理的(圖4C-F)。在多個(gè)樣本Shannon曲線也觀察到類似的結(jié)果(圖4g)，表明大多數(shù)樣本多樣性被測(cè)序覆蓋。有趣的是，rarefaction和Shannon曲線以及4個(gè)α-多樣性指數(shù)的結(jié)果在不同組間沒有差異(圖4A-F)，這表明DHEA處理或tempol干預(yù)對(duì)腸道微生物群α-多樣性沒有明顯影響。 英拜是您身邊的科研小助手。浙江細(xì)胞凋亡甲基化芯片科研
PTEN是一種**抑制因子，調(diào)節(jié)多種細(xì)胞功能，包括***，PI3K/AKT信號(hào)通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此，推測(cè)PI3K/AKT信號(hào)通路可能參與CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化。WB結(jié)果顯示過表達(dá)PTEN可以部分減弱miR-934和HCT-8細(xì)胞源外泌體對(duì)p-AKT和p-PI3K表達(dá)的增強(qiáng)作用，而沉默PTEN則相反（Fig.5k）。更重要的是，當(dāng)與HCT-8細(xì)胞來(lái)源的外泌體和PI3K抑制劑(LY294002)共培養(yǎng)時(shí)，PMA處理的THP-1細(xì)胞中p-AKT和M2標(biāo)記物(CD206、arginase-1和CD163)的表達(dá)下調(diào)（Fig.5l,m）。綜上所述，CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-934可以通過下調(diào)PTEN表達(dá)和***PI3K/AKT信號(hào)通路誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化。深圳腸道微生物組科研為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機(jī)制。
外泌體傳遞的miRNA-335-5p通過靶向RASA1促進(jìn)CRC細(xì)胞遷移、侵襲、EMT和轉(zhuǎn)移
作者用miR-335-5p模擬物或陰性對(duì)照(NC)轉(zhuǎn)染的SW480細(xì)胞的條件培養(yǎng)基中收集外泌體。使用qRT-PCR檢測(cè)這些外泌體中miR-335-5p的水平。結(jié)果顯示含有模擬物（miR-335-5p模擬物-exo）的外泌體顯著促進(jìn)了SW480和SW620細(xì)胞的遷移和侵襲，并且還降低了RASA1蛋白表達(dá)并增加了Ras蛋白表達(dá)。此外，miR-335-5p模擬物-exo抑制EMT，如上皮標(biāo)志物E-鈣粘蛋白的表達(dá)降低和間充質(zhì)標(biāo)志物波形蛋白的表達(dá)增加。***，用miR-335-5p模擬物-exo處理的細(xì)胞顯示出更強(qiáng)的體內(nèi)轉(zhuǎn)移促進(jìn)作用，肺表面宏觀結(jié)節(jié)的數(shù)量急劇增加。這些結(jié)果表明，外泌體介導(dǎo)的miR-335-5p穿梭可能會(huì)加速CRC細(xì)胞的體外遷移和侵襲以及體內(nèi)轉(zhuǎn)移，同時(shí)伴隨著Ras信號(hào)和EMT的***。
四、TEA-seq轉(zhuǎn)錄本、表位和可及性的三峰測(cè)量
A.隨著從單個(gè)核中同時(shí)捕獲RNA-seq和ATAC-seq的商業(yè)平臺(tái)的發(fā)布，我們推斷通透細(xì)胞可以用于同時(shí)捕獲三個(gè)主要的分子隔間:DNA可以用scATAC-seq捕獲，RNA可以用scRNA-seq捕獲，蛋白質(zhì)表位豐度可以用聚腺苷化抗體條形碼捕獲，我們根據(jù)轉(zhuǎn)錄本、表位表位和可及性將其稱為TEA-seq。經(jīng)過試驗(yàn)和關(guān)鍵步驟的優(yōu)化后，我們能夠在10倍基因組MultiomeATAC+基因表達(dá)平臺(tái)上獲得文庫(kù)，該平臺(tái)使用46個(gè)低聚標(biāo)記抗體組合了數(shù)千個(gè)單細(xì)胞的所有三種測(cè)量結(jié)果.
B.D.在對(duì)裝入4孔的細(xì)胞進(jìn)行初始數(shù)據(jù)處理后，我們鑒定出29264個(gè)通過上述scATAC-seqQC標(biāo)準(zhǔn)的細(xì)胞條形碼，有2,500,500個(gè)獨(dú)特的ATAC-seq片段(中值=8762個(gè)獨(dú)特的ATAC片段)，有>500個(gè)基因被scRNA-seq檢測(cè)到(中值=2399個(gè)RNAUMIs;中位數(shù)=檢測(cè)到129,249個(gè)基因)，500個(gè)ADTUMIs.
G.H.更敏感的蛋白質(zhì)豐度測(cè)量允許檢測(cè)許多附加的相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)，例如CCR2/CD192.
I.J.一種單核細(xì)胞上表達(dá)的趨化因子受體和CD38，一種表達(dá)于多種免疫細(xì)胞表面的糖蛋白. 神經(jīng)元中FTH的敲除抵消了褪黑素對(duì)創(chuàng)傷性腦損傷鐵死亡的保護(hù)作用。
下調(diào)MIR210HG可抑制子宮內(nèi)膜*細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲
我們研究了MIR210HG在子宮內(nèi)膜*細(xì)胞中的生物學(xué)功能。我們發(fā)現(xiàn)MIR210HG的下調(diào)有效地降低了Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞的增殖(圖2A和2B)。采用創(chuàng)面愈合實(shí)驗(yàn)和Transwell實(shí)驗(yàn)研究MIR210HG對(duì)**遷移和侵襲的影響。與sh陰性對(duì)照組(NC)相比，轉(zhuǎn)染sh-MIR210HG的細(xì)胞遷移和侵襲減少(圖2C和2D)。流式細(xì)胞術(shù)分析細(xì)胞周期分布(圖2E)。以上結(jié)果提示MIR210HG在子宮內(nèi)膜*中起致*基因的作用。
MIR210HG可能參與了由lncRNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)介導(dǎo)的子宮內(nèi)膜惡性生物學(xué)行為
利用TCGA數(shù)據(jù)集對(duì)子宮內(nèi)膜*樣本進(jìn)行基因**富集分析，探索MIR210HG參與調(diào)控子宮內(nèi)膜*的生物學(xué)通路。MIR210HG的表達(dá)與TGF-b和Wnt通路***相關(guān)，而Smad3基因在這些關(guān)聯(lián)中發(fā)揮了重要作用(圖3A)。搜索工具STRING的分析也顯示SMAD3和HMGA2是強(qiáng)相關(guān)的(圖3B)。我們探究HMGA2是否為MIR210HG的下游基因，發(fā)現(xiàn)MIR210HG下調(diào)后HMGA2蛋白表達(dá)水平降低。相反，當(dāng)MIR210HG高表達(dá)時(shí)，HMGA2的表達(dá)***增加(圖3C)。這表明MIR210HG可能通過上調(diào)HMGA2的表達(dá)來(lái)促進(jìn)子宮內(nèi)膜*細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為。 總體生存率低與m6A水平增高***相關(guān)。發(fā)育可塑性科研地區(qū)科學(xué)基金
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此外，生存分析顯示，EV中CD44v6和C1QBP高表達(dá)的患者的生存結(jié)局明顯較差(圖7F)。循環(huán)外泌體的隨訪數(shù)據(jù)也顯示了一致的結(jié)果。PDAC患者中循環(huán)外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于健康對(duì)照組(圖7G)， PDAC伴有肝轉(zhuǎn)移的患者中循環(huán)外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于無(wú)肝轉(zhuǎn)移的患者(圖7G)。免疫電子顯微鏡顯示，CD44v6和C1QBP在PDAC患者的循環(huán)外泌體***表達(dá)(圖7H)。高循環(huán)外泌體表達(dá)CD44v6和C1QBP的患者比其他患者更容易發(fā)生肝轉(zhuǎn)移 (圖7I)。然而，高表達(dá)循環(huán)外泌體CD44v6和C1QBP的患者生存率明顯較差(圖7J)?？傊?，我們的研究結(jié)果證實(shí)了CD44v6和C1QBP在組織源性EV和循環(huán)外泌體中的表達(dá)可以預(yù)測(cè)PDAC患者的預(yù)后和肝轉(zhuǎn)移。
結(jié)論：我們揭示了原代PDAC細(xì)胞和HSCs之間通過PDAC來(lái)源的外泌體進(jìn)行遠(yuǎn)距離的細(xì)胞通信。此外，Pex通過促進(jìn)肝纖維化微環(huán)境的形成來(lái)指示肝特異性轉(zhuǎn)移。更重要的是，我們發(fā)現(xiàn)外泌體CD44v6/C1QBP復(fù)合物傳遞到HSC的質(zhì)膜上誘導(dǎo)IGF-1信號(hào)通路的***。外泌體CD44v6和C1QBP可能是預(yù)測(cè)PDAC患者預(yù)后的有前途的生物標(biāo)志物，也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。 浙江細(xì)胞凋亡甲基化芯片科研
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