7)MIR210HG通過miR-337-3p和miR-137促進(jìn)**進(jìn)展
為了確定MIR210HG下調(diào)對Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞系惡性行為的抑制作用是否通過miR-337-3p/137介導(dǎo),我們進(jìn)行了功能挽救實(shí)驗(yàn)。結(jié)果證實(shí)MIR210HG沉默對Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞遷移和侵襲的惡性抑制作用被miR-337-3p/137敲低***逆轉(zhuǎn)(圖7A-7E)。這表明MIR210HG通過miR-337-3p/137調(diào)控Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為。
8)抑制MIR210HG和miR-337-3p/137過表達(dá)抑制**生長
我們測定了MIR210HG和miR-337-3p/137在體內(nèi)**模型中的功能。裸鼠實(shí)驗(yàn)中,每組實(shí)驗(yàn)小鼠3只。結(jié)果表明與對照組相比,轉(zhuǎn)染sh-MIR210HG并過表達(dá)miR-337-3p和miR-137降低了**體積(圖8A)。轉(zhuǎn)染shMIR210HG并同時(shí)過表達(dá)miR-337-3p和miR-137的組**體積**小。免疫組化分析顯示,與單獨(dú)轉(zhuǎn)染agomir-337-3p/137和sh-MIR210HG組相比,共轉(zhuǎn)染組HMGA2和Ki-67的表達(dá)較低(圖8B)。
結(jié)論:MIR210HG在子宮內(nèi)膜*患者中是一個(gè)**的預(yù)后因素,干擾MIR210HG的體內(nèi)外表達(dá)可抑制子宮內(nèi)膜*細(xì)胞的惡性表型。MIR210HG-miR-337-3p/137被發(fā)現(xiàn)介導(dǎo)HMGA2調(diào)節(jié)子宮內(nèi)膜*細(xì)胞惡性行為的能力。MIR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2軸是新的子宮內(nèi)膜*分子預(yù)后標(biāo)志物和潛在的***靶點(diǎn)。 英拜生物提供專業(yè)的編輯潤色團(tuán)隊(duì)保證服務(wù)到文章接收為止。武漢腸道微生物科研
點(diǎn)擊該結(jié)構(gòu)的圖像可以獲得放大的圖像。為了幫助用戶精細(xì)化搜索,PROTAC-DB還包含基于物理化學(xué)的過濾工具屬性(例如分子量、log P、log S、拓?fù)錁O性表面積),包含了搜索結(jié)果中每個(gè)屬性的最小值和最大值。對于PROTAC,除了二維結(jié)構(gòu)、化合物ID和靶蛋白外,數(shù)據(jù)表中還顯示了生物活性,包括降解能力、結(jié)合親和力和細(xì)胞活性。該數(shù)據(jù)表可以根據(jù)生物活動的值進(jìn)行排序。對于彈頭和E3配體,搜索結(jié)果中只顯示了初始結(jié)構(gòu)。修改后PROTAC中的結(jié)構(gòu)匯總在其相應(yīng)的詳細(xì)信息頁面中。此外,數(shù)據(jù)表中還顯示了初始結(jié)構(gòu)的生物活性。同樣,也可以根據(jù)這些標(biāo)準(zhǔn)對數(shù)據(jù)表進(jìn)行排序。對于Linker,數(shù)據(jù)表中只顯示了2D結(jié)構(gòu)、化合物ID和目標(biāo)蛋白。結(jié)構(gòu)中的‘R1’和‘R2’分別**彈頭和E3配體的結(jié)合位點(diǎn)。上海腸道屏障科研上海英拜生物的動物建模實(shí)驗(yàn)。
一、YTHDF1在胃*中的過表達(dá)
通過評估YTHDF1突變的分布,我們發(fā)現(xiàn)65%的突變是基因擴(kuò)增,這通常會導(dǎo)致基因產(chǎn)物的過表達(dá)(圖1A).通過對TCGA數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)YTHDF1在胃*患者中的表達(dá)確實(shí)明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高表達(dá)與胃*進(jìn)展(圖1C)和較差的總生存期(圖1D)相關(guān)。對正常胃組織和胃*標(biāo)本進(jìn)行免疫組化分析,證實(shí)**組織中YTHDF1蛋白表達(dá)上調(diào)(圖1F)。此外,YTHDF1在胃*患者中的異常高表達(dá)與更嚴(yán)重的臨床病理特征(如神經(jīng)周圍侵犯、侵襲性**分期(III/IV期vs.I/II期)、靜脈侵犯等***相關(guān)(圖1G)。KaplanMeier生存分析也顯示,YTHDF1高表達(dá)的胃*患者4年總生存期較差。綜上所述,YTHDF1在胃*發(fā)生中具有潛在的致瘤作用。
胰腺*(PC)是**棘手的**之一,被認(rèn)為是預(yù)后**差的消化系統(tǒng)**。外泌體是微環(huán)境中**細(xì)胞和基質(zhì)細(xì)胞之間相互交流的重要介質(zhì)。**的發(fā)展不僅由*細(xì)胞決定,還受**微環(huán)境(Tumor microenvironment, TME)中缺氧、脂質(zhì)和間質(zhì)細(xì)胞這三個(gè)重要因素的調(diào)控。肥胖與包括PC在內(nèi)的幾種**的風(fēng)險(xiǎn)增加有關(guān),并增加PC的發(fā)病率和死亡率。然而,PC衍生的外泌體在TME的進(jìn)展和與脂肪細(xì)胞的串?dāng)_中的潛在分子機(jī)制尚未闡明。因此,有作者對此進(jìn)行了研究,并把研究結(jié)果發(fā)表在《Molecular Therapy - Nucleic Acids》,IF:8.886。降低腸上皮細(xì)胞尿酸的產(chǎn)生。
神經(jīng)性疼痛和炎癥PCR基因芯片可用于研究與疼痛反應(yīng)的傳導(dǎo)、維護(hù)和調(diào)節(jié)相關(guān)的84個(gè)基因的表達(dá)。有害環(huán)境刺激、組織損傷和疾病都可以引起疼痛。由于疼痛折磨著大約20%的人口,所以疼痛既提供了大量的***目標(biāo),同時(shí)也提供一個(gè)可以了解神經(jīng)系統(tǒng)的功能及分子機(jī)制的途徑。雖然疼痛產(chǎn)生的原因眾多,包括外周神經(jīng)系統(tǒng)(PNS)損傷,***系統(tǒng)(CNS)神經(jīng)性疼痛,外周組織的損傷和或炎癥啟動的炎癥性疼痛,然而神經(jīng)性和炎癥性疼痛的根本原因在于從***的神經(jīng)元損傷檢測到終止于脊髓背角的薄層的傳導(dǎo)通路。這條通路包括:疼痛感受器收集信息,通過神經(jīng)傳遞到***系統(tǒng),并影響動作電位產(chǎn)生的離子通道和嘌呤、**類、**素受體,導(dǎo)致二階神經(jīng)元***,再通過谷氨酸、5-羥色胺和多巴胺系統(tǒng)的突觸傳遞進(jìn)行信號傳導(dǎo)。其中,傷害性感受的傳導(dǎo),可以被炎癥介質(zhì)相關(guān)的浸潤性免疫細(xì)胞和神經(jīng)元受損調(diào)節(jié)。脊髓神經(jīng)元的興奮性也可以被鄰近的小膠質(zhì)細(xì)胞所釋放的生長因子、趨化因子和細(xì)胞因子調(diào)控。內(nèi)源性**肽和花生四烯酸代謝產(chǎn)物的作用,通過G-蛋白偶聯(lián)受體同樣可以調(diào)節(jié)神經(jīng)元的興奮性。許多這些途徑都是目前正在研究的潛在的藥物鎮(zhèn)痛疼痛***的發(fā)展目標(biāo)。專注于生命科學(xué)內(nèi)的前沿研究。硬膜粘結(jié)科研整體服務(wù)
大黃酸能緩解D。SS誘導(dǎo)的小鼠慢性結(jié)腸炎。武漢腸道微生物科研
三、通過RNA-seq、RIP-seq和MeRIP-seq鑒定ythdf1調(diào)控的轉(zhuǎn)錄本
對YTHDF1基因敲除MGC-803細(xì)胞和對照細(xì)胞進(jìn)行RNA-seq。RNA圖譜顯示YTHDF1抑制導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄異常(圖3A)?;虮倔w論(GO)分析表明,下調(diào)的基因在血管生成、細(xì)胞遷移、粘附和細(xì)胞生長等方面富集;而定位于負(fù)調(diào)控**進(jìn)展的基因表達(dá)上調(diào)(圖3B)。RIP-seq獲得了9082個(gè)結(jié)合YTHDF1的候選基因。我們分析了功能富集變化*****的**000個(gè)基因,表明它們高度參與了**相關(guān)途徑(圖3C)。但累積分布分析表明,YTHDF1結(jié)合基因與YTHDF1未結(jié)合基因在轉(zhuǎn)錄水平上沒有***差異(圖3D)。這與之前的研究結(jié)果一致,即YTHDF1主要調(diào)控基因翻譯。MeRIP-seq鑒定YTHDF1調(diào)控的m6A修飾的轉(zhuǎn)錄本。2365個(gè)轉(zhuǎn)錄本檢測到m6A修飾,主要發(fā)生在mrna中(98%;圖3 e;補(bǔ)充表S7),優(yōu)先聚集在外顯子(58%;圖3 e)。與其他n6 -甲基腺苷測序結(jié)果一致,m6A峰在30UTR區(qū)域富集(圖3F),并*被典型GGAC基元檢測(圖3G)。將RIP-seq和MeRIP-seq整合的重疊轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行富集分析,發(fā)現(xiàn)Wnt和Hippo信號通路受到了***影響(圖3H)。假設(shè)YTHDF1抑制通過Hippo或Wnt途徑抑制**生長(圖3I)。 武漢腸道微生物科研
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺,提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)