2）SsD響應(yīng)相關(guān)基因和通路的鑒定
為了進(jìn)一步確定可能與白血病細(xì)胞中SsD敏感性相關(guān)的潛在靶點(diǎn)，我們對(duì)SsD處理過(guò)的NB4細(xì)胞進(jìn)行了RNA測(cè)序。我們共發(fā)現(xiàn)3732個(gè)上調(diào)基因和3442個(gè)下調(diào)基因(圖2A)。為了揭示SsD的潛在機(jī)制，我們進(jìn)行了富集分析并研究了差異基因相關(guān)的通路。我們篩選了上調(diào)和下調(diào)基因富集的**個(gè)通路(圖2B)。此外，我們使用GSEA研究SsD處理影響的信號(hào)通路(圖2C)。我們的數(shù)據(jù)顯示，SsD處理導(dǎo)致MYC靶點(diǎn)、E2F靶點(diǎn)和G2M檢查點(diǎn)信號(hào)級(jí)聯(lián)受到抑制。有趣的是，這些發(fā)現(xiàn)與FTO抑制劑和內(nèi)源性FTO的下調(diào)抑制的信號(hào)通路相一致。因此，SsD的抑制作用可能有助于FTO抑制細(xì)胞周期和增殖(圖2D-E)。此外，絕大多數(shù)通過(guò)FTO敲低而上調(diào)的信號(hào)通路對(duì)SsD富集，同樣，絕大多數(shù)被SsD抑制的信號(hào)通路也被FTO敲低而抑制(圖2F)。更重要的是，SsD介導(dǎo)的m6A相關(guān)基因的變化具有***的一致性(圖2G)。綜上所述，SsD可能參與了FTO介導(dǎo)的m6ARNA甲基化途徑。 METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。細(xì)胞死亡通路發(fā)現(xiàn)者科研中標(biāo)率高
小泛素修飾(SUMO)結(jié)合稱(chēng)為SUMO修飾，其作為生物活性分類(lèi)的誘導(dǎo)劑分子進(jìn)入細(xì)胞外囊泡(EVs)，觸發(fā)淋巴管生成，進(jìn)一步驅(qū)動(dòng)**淋巴結(jié)(LN)轉(zhuǎn)移，但確切的機(jī)制仍不清楚。本研究發(fā)現(xiàn)，SUMOylation促進(jìn)細(xì)胞外囊泡介導(dǎo)的lncRNA ELNAT1的傳遞和膀胱*的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。該文于2021年4月發(fā)表在《The Journal of Clinical Investigation》IF: 14.808。
1.SUMOylation參與膀胱*的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移
為了探討SUMOylation在膀胱*（BCa）的淋巴結(jié)（LN）轉(zhuǎn)移中的作用，作者基于淋巴*與TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中比較SUMOylation的表達(dá)譜，發(fā)現(xiàn)BCas中UBC9的高表達(dá)，同時(shí)生成分析顯示，與UBC9表達(dá)較低的患者相比，UBC9表達(dá)較高的患者總生存率（OS）和無(wú)病生存期（DFS）較低（Figure1A-E）。為了證明UBC9在LN轉(zhuǎn)移中的作用，作者通過(guò)242例的BCas患者樣本，發(fā)現(xiàn)UBC9在LN轉(zhuǎn)移過(guò)程中高表達(dá)（Figure1F）。 沈陽(yáng)糞便微生物科研英拜是您身邊的科研小助手。
2021年6月，***一篇發(fā)表在Microbiome（IF=11.607）的文章（Microbiotalong-termdynamicsandpredictionofacutegraft-versus-hostdiseaseinpediatricallogeneicstemcelltransplantation.）從共生功能體視點(diǎn)的角度對(duì)29名接受同種異體造血干細(xì)胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進(jìn)行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細(xì)菌可能預(yù)測(cè)急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監(jiān)測(cè)HSCT患者不同身體部位的微生物群，特別是通過(guò)移植前樣本的參與，可能具有預(yù)后價(jià)值，并有助于指導(dǎo)個(gè)性化***策略。識(shí)別具有預(yù)測(cè)移植后aGvHD潛力的獨(dú)特細(xì)菌，可能為改進(jìn)預(yù)防性臨床管理提供機(jī)會(huì)，包括對(duì)微生物群的調(diào)節(jié)。背景：在異種造血干細(xì)胞移植(allogeneichematopoieticstemcelltransplantation,allo-HSCT)中，供者來(lái)源的干細(xì)胞輸注被用于***各種類(lèi)型的血液病和非血液病。在異種造血干細(xì)胞移植患者中，移植后人體腸道菌群發(fā)生變化，這可能部分歸因于******和調(diào)理方案。
然而，SsD***降低了MerTK和BCL-2轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性，這隨后導(dǎo)致了它們的翻譯降低(圖7F和7G)?；蛱禺愋詍6A qPCR證實(shí)MerTK、BCL-2和STAT3的RNA或蛋白水平的變化是由m6A介導(dǎo)的mRNA穩(wěn)定性引起的。為了在體內(nèi)檢測(cè)這些效應(yīng)，我們將Kas-1尼洛替尼耐藥細(xì)胞移植給裸鼠。細(xì)胞接種后，為了保持耐藥表型，我們繼續(xù)每周兩次腹腔注射尼洛替尼，直到**體積接近100mm3。然后，隨機(jī)分組給予次優(yōu)劑量的SsD (圖7H)。SsD本身略微減緩了耐藥**的生長(zhǎng)(圖7I和7J)。在機(jī)制上，我們觀察到mRNA m6A甲基化的總體增加(圖7K)。
結(jié)論：我們的研究揭示了FTO/m6A修飾信號(hào)之間之前未被認(rèn)識(shí)到的聯(lián)系，并闡明了SsD在AML中的功能。該研究可能為靶向FTO/m6A的表轉(zhuǎn)錄組提供一個(gè)有前途的策略，并突出柴胡皂甙***白血病的臨床潛力。 代謝變化被認(rèn)為是腸病**重要的特征之一。
MIR210HG與子宮內(nèi)膜*患者的低生存率相關(guān)
為了識(shí)別子宮內(nèi)膜*組中異常表達(dá)的lncRNA，我們分析了來(lái)自TCGA的數(shù)據(jù)。表達(dá)陣列分析顯示332個(gè)lncRNA的表達(dá)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。7個(gè)lncRNA表達(dá)上調(diào)(圖1A和1B)。然后，我們分析了GEO數(shù)據(jù)集，發(fā)現(xiàn)在子宮內(nèi)膜*GSE17025隊(duì)列中MIR210HG的表達(dá)也上調(diào)(圖1C)。qPCR顯示MIR210HG在子宮內(nèi)膜*中的表達(dá)明顯高于正常子宮內(nèi)膜組織(圖1D)。此外，我們分析了MIR210HG的表達(dá)與子宮內(nèi)膜*患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系，發(fā)現(xiàn)MIR210HG在從I、II期到III、IV期的進(jìn)展過(guò)程中增加。MIR210HG的表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移***相關(guān)(圖1E)。原位雜交實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，MIR210HG在子宮內(nèi)膜*中的表達(dá)水平高于正常子宮內(nèi)膜組織(圖1F)。MIR210HG高表達(dá)的子宮內(nèi)膜*患者生存率較低(圖1G)。 英拜專(zhuān)注高通量測(cè)序行業(yè)的整體服務(wù)。上?；蚪M研究服務(wù)科研
文章使用FMT(糞微生態(tài)移植)來(lái)確定大黃酸改變的腸道菌群是否對(duì)結(jié)腸炎有療效。細(xì)胞死亡通路發(fā)現(xiàn)者科研中標(biāo)率高
此外，circPDE4B不影響MID1水平(圖4E)。RPD和序列IP分析都顯示circPDE4B促進(jìn)了RIC8A和MID1的結(jié)合(圖4F，G)。與這一發(fā)現(xiàn)相一致的是，體外結(jié)合試驗(yàn)表明，circPDE4B增加了重組RIC8A和MID1蛋白之間的關(guān)聯(lián)(圖4H)。通過(guò)co-IP，MID1與RIC8A在N端調(diào)控域結(jié)合(圖4I)。此外，我們檢測(cè)了RIC8A的功能位點(diǎn)。在HCs中免疫沉淀RIC8A并進(jìn)行MS分析，證實(shí)了RIC8A中氨基酸殘基的泛素化(圖4J)。在RIC8A、K143和K187中鑒定出10個(gè)泛素化位點(diǎn)，并且在人類(lèi)和小鼠之間并不保守(圖4J)。因此，我們將保守的RIC8A位點(diǎn)從賴(lài)氨酸(K)突變?yōu)榫彼?R)，以排除泛素化。IP結(jié)果表明，與WT相比，K415的取代**降低了RIC8A的泛素化位點(diǎn)(圖4K)。有趣的是，K415在哺乳動(dòng)物中高度保守(圖4L，M)。此外，在K415突變后，circPDE4B過(guò)表達(dá)或抑制不再調(diào)節(jié)RIC8A的泛素化水平(圖4N)。這些結(jié)果表明circPDE4B可以作為促進(jìn)RIC8A和MID1之間聯(lián)系的支架。細(xì)胞死亡通路發(fā)現(xiàn)者科研中標(biāo)率高
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