人類干細(xì)胞miRNA的PCR芯片用于研究干細(xì)胞感應(yīng)、維護(hù)、分化和識(shí)別相關(guān)的84個(gè)miRNA的表達(dá)。所有的干細(xì)胞都能夠自我更新和分化成多種細(xì)胞類型。多能干細(xì)胞能夠分化成3胚層的任何類型細(xì)胞,而3胚層表達(dá)--組對(duì)多能性至關(guān)重要的miRNA,包括可以提高重編程使分化細(xì)胞回到干細(xì)胞狀態(tài)。然而,**近的研究表明,與胚胎干細(xì)胞(ESC)相比,誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(IPSC)和始發(fā)態(tài)(或外胚層)干細(xì)胞(epiSC)的miRNA表達(dá)有差異。在分化過程多能性標(biāo)記物的表達(dá)水平下降而其他分化關(guān)鍵miRNA的表達(dá)增加。附加的miRNA在特定階段或在特定血統(tǒng)變得更加普遍,導(dǎo)致miRNA對(duì)三種不同胚層祖細(xì)胞獨(dú)特的表達(dá)模式。這個(gè)芯片確定miRNA的相對(duì)表達(dá)對(duì)多能性和分化干細(xì)胞重要性。芯片還額外包括**胚胎干細(xì)胞(ESC),誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC),外胚層干細(xì)胞(epiSC),胚狀體的身體細(xì)胞,胚層祖細(xì)胞的標(biāo)記。每張芯片含-個(gè)對(duì)照組使得分析數(shù)據(jù)時(shí)可以用相對(duì)定量OOCT方法評(píng)估逆轉(zhuǎn)錄效率,基因組DNA污染和PCR效率。利用這張芯片,通過實(shí)時(shí)定量PCR??梢院喴浊铱煽康貦z測(cè)與干細(xì)胞**相關(guān)的miRNA的表達(dá)。FOXO3A誘導(dǎo)的LINC00926限制乳腺瘤細(xì)胞的生長和轉(zhuǎn)移。湖南科研動(dòng)物模型構(gòu)建
目前,PROTAC-DB包括1662個(gè)PROTAC,202個(gè)彈頭(靶向目標(biāo)蛋白質(zhì)的小分子),65個(gè)E3配體(能夠募集E3連接酶的小分子)和806個(gè)接頭,以及它們的化學(xué)結(jié)構(gòu),生物學(xué)活性和理化性質(zhì)。除了彈頭和E3配體的生物活性外,PROTAC-DB還提供PROTAC的降解能力,結(jié)合親和力和細(xì)胞活性。
數(shù)據(jù)庫的查詢和瀏覽為了方便對(duì)PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)進(jìn)行檢索,作者提供了檢索和瀏覽工具。在檢索工具上,PROTAC-DB可以進(jìn)行基于文本的檢索和基于結(jié)構(gòu)的檢索?;谖谋镜乃阉魇窃谡麄€(gè)PROTAC-DB中進(jìn)行搜索的一種簡單方式,只需輸入單個(gè)術(shù)語,如目標(biāo)名稱、化合物名稱或ID。對(duì)于基于結(jié)構(gòu)的搜索,用戶可以在ChemDoodle編輯器中輸入SMILES字符串、上傳MO***F文件或繪制分子草圖。導(dǎo)入自編輯的分子后,可以從三個(gè)搜索選項(xiàng)(similarity、substructure或exact)中選擇一個(gè)。在相似性搜索中,利用類FCFP指紋中的位向量Morgan指紋來計(jì)算兩個(gè)分子之間的Tanimoto相似度??梢赃x擇數(shù)據(jù)集(PROTAC、彈頭、E3配體或Linker)進(jìn)行搜索。
單細(xì)胞相關(guān)課題科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)專注于生命科學(xué)內(nèi)的前沿研究。
這些明確的造血干細(xì)胞在妊娠后4周(pcw)首先在胎兒肝臟定植,并在那里大量擴(kuò)張。在10.5 pcw時(shí),造血部位再次轉(zhuǎn)移到骨腔(即骨髓[BM]),成人造血在此處長久建立。人們認(rèn)為,***批在骨髓中播種的造血干細(xì)胞在其增殖和分化特性發(fā)生戲劇性變化之前,會(huì)繼續(xù)快速增加數(shù)量,以適應(yīng)高產(chǎn)量分化子代的需要。
歷史上,造血系統(tǒng)的分化過程被描述為一系列中間步驟,由細(xì)胞表面標(biāo)記物(即分化簇[CD])定義。在這個(gè)模型中,造血干細(xì)胞通常表現(xiàn)為造血樹,造血干細(xì)胞產(chǎn)生了越來越多的譜系限制性細(xì)胞類型,**終導(dǎo)致成熟的血細(xì)胞。這種模式在過去的5年里發(fā)生了改變,一些研究報(bào)告了數(shù)千個(gè)單個(gè)造血細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組,這些細(xì)胞被細(xì)胞表面標(biāo)記物隔離,在小鼠模型和成人中。這些報(bào)告表明,以前被認(rèn)為是同質(zhì)的祖先種群,實(shí)際上在轉(zhuǎn)錄水平上是非常異構(gòu)的。
與基因表達(dá)改變一致,白樺素處理以濃度依賴性的方式***減少了膽固醇和脂肪酸的從頭合成(圖3D-E)。此外,白樺素降低了細(xì)胞膽固醇(圖3F)和中性脂質(zhì)(主要是膽固醇酯和甘油三酸酯)的穩(wěn)態(tài)水平(圖3G)。 兩者合計(jì),我們的數(shù)據(jù)表明白樺素抑制SREBP加工并下調(diào)膽固醇和脂肪酸的生物合成,從而降低細(xì)胞脂質(zhì)水平。 有趣的是,洛伐他汀顯著降低了膽固醇的合成(圖3D),但也適度地增加了脂肪酸的生物合成(圖3E),這可能是因?yàn)槁宸ニ∈荋MGCR的抑制劑,它可以阻斷膽固醇的合成,進(jìn)而刺激SREBP的活化,從而增加脂肪酸合成。 總體生存率低與m6A水平增高***相關(guān)。
3、外泌體S100A4是HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛力的關(guān)鍵增強(qiáng)子
為了探究通過HMH-exo增強(qiáng)HCC轉(zhuǎn)移能力的關(guān)鍵,作者對(duì)LMH-exo和HMH-exo進(jìn)行了iTRAQ質(zhì)譜篩選。結(jié)果從HMH-exo中鑒定到116個(gè)***上調(diào)和43***下調(diào)的蛋白質(zhì);結(jié)果發(fā)現(xiàn)了4個(gè)蛋白家族的聚類:Apo、PSM、EEF/EIF和S100鈣結(jié)合蛋白家族(圖3a-b)。經(jīng)過文獻(xiàn)分析,作者主要關(guān)注了S100鈣結(jié)合蛋白家族,并以其中*****差異表達(dá)的4個(gè)蛋白為主:依次是S100A4,S100A6,S100A10,和S100A11。作者檢測(cè)了這4個(gè)蛋白在5個(gè)HCC細(xì)胞系外泌體中的表達(dá)豐度,結(jié)果發(fā)現(xiàn)依然是S100A4的表達(dá)水平比較高(圖3c)。因此,初步選擇S100A4進(jìn)行下一步分析。 英拜生物是國內(nèi)承接各類高通量測(cè)序科研項(xiàng)目以及一站式的測(cè)序文章發(fā)表服務(wù)的公司之一。四川科研贈(zèng)送提供技術(shù)路線
文章使用FMT(糞微生態(tài)移植)來確定大黃酸改變的腸道菌群是否對(duì)結(jié)腸炎有療效。湖南科研動(dòng)物模型構(gòu)建
總之,SLE患者純化T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析根據(jù)ISG表達(dá)水平將其分為兩組,表達(dá)高I型IFN標(biāo)記的患者顯示線粒體編碼基因和線粒體相關(guān)代謝途徑的表達(dá)減少,在CD8+T細(xì)胞中更明顯。這表明SLE中與I型IFN相關(guān)的線粒體功能失調(diào)。
2、ISGs高表達(dá)患者CD8+T細(xì)胞線粒體異常
在研究I型IFN信號(hào)與線粒體異常之間的潛在聯(lián)系之前,應(yīng)用計(jì)算機(jī)模擬和體外相結(jié)合的方法,根據(jù)I型IFN信號(hào)的強(qiáng)弱程度對(duì)SLE患者進(jìn)行分層:高水平的ISGs(IFN-high)、低水平的ISGs(IFN-low)和無ISGs(IFN-Neg)。隨后,探究IFN-high和IFN-Neg的SLE患者中T細(xì)胞的線粒體基因型,以類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎(RA)患者為疾病對(duì)照。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與健康組,IFN-Neg組和RA組相比,來源于IFN-high的SLE患者的CD8+T細(xì)胞表現(xiàn)出線粒體大小增加(圖2a,b)和線粒體膜超極化(圖2c)。在IFN-High的SLE患者中,也觀察到細(xì)胞ROS(cROS)陽性CD8+T細(xì)胞比例增加,但只是線粒體ROS(mROS)染色細(xì)胞比例有上升趨勢(shì)(圖2d)。在IFN-Neg的SLE患者中也檢測(cè)到更高比例cROS陽性細(xì)胞,這表明了一種疾病特異性效應(yīng)(圖2d)。 湖南科研動(dòng)物模型構(gòu)建
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)