我們發(fā)現(xiàn),在circMAPK1穩(wěn)定下調(diào)的SGC7901和MGC803細(xì)胞中,與對(duì)照組相比,MAPK1-109aa與MEK1的結(jié)合明顯減少,而MAPK1與MEK1的結(jié)合增加(圖7f)。在MKN45和BGC823細(xì)胞中,IRES突變時(shí)MAPK1-109aa不翻譯。因此,MAPK1與MEK1的結(jié)合沒有明顯變化。然而,過表達(dá)circMAPK1后,MAPK1與MEK1的結(jié)合***減少,而MAPK1-109aa與MEK1的結(jié)合***增加(圖7g)。因此,以上結(jié)果表明MAPK1-109aa與MAPK1競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合MEK1。隨后的Western blot結(jié)果也證實(shí),在過表達(dá)circMAPK1的細(xì)胞系中,MAPK1-109aa***升高,磷酸化的MAPK1/2降低,而在circMAPK1敲低的細(xì)胞中則相反(圖7h)。此外,MAPK1的下游效應(yīng)因子,如p-ELK1、p-c-Fos、p-c-JUN和p-RSK,也被過表達(dá)的circMAPK1***抑制(圖7i)。這些結(jié)果表明,circMAPK1編碼的MAPK1-109aa通過抑制MAPK1信號(hào)通路發(fā)揮抑*作用。我們使用抗體陣列評(píng)估了表達(dá)PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。內(nèi)分泌課題國(guó)家自然科學(xué)基金
多囊卵巢綜合征(PCOS)是一種復(fù)雜的內(nèi)分泌和代謝紊亂疾病,通常伴有氧化應(yīng)激。Tempol是一種超氧化物歧化酶(SOD)模擬物,可預(yù)防由氧化應(yīng)激引起的多種疾病。但是,目前尚不清楚tempol對(duì)PCOS的影響。本文通過腸道微生物組的16S rDNA測(cè)序和非靶向代謝組學(xué)分析脫氫表雄酮(DHEA)誘發(fā)的PCOS卵巢功能障礙和葡萄糖耐量減輕的大鼠模型回答了該問題,并于2021年2月發(fā)表在《Redox Biol》IF:9.986。
1.Tempol減輕DHEA誘導(dǎo)的PCOS大鼠卵巢功能障礙和細(xì)胞凋亡
實(shí)驗(yàn)過程設(shè)計(jì)如圖1A所示。用發(fā)情周期觀察DHEA和/或tempol對(duì)卵巢功能的影響,如圖1B所示,oil+PBS組大鼠的動(dòng)情周期為4~5天,而DHEA+PBS組大鼠大多處于動(dòng)情期(圖1B)。經(jīng)tempol處理后,發(fā)情周期紊亂得到改善(圖1B)。 炎癥課題地區(qū)科學(xué)基金促*分泌體通過外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。
接下來,我們合成了野生型HuR蛋白(WT)和HuR蛋白的截短突變體(即分別為單獨(dú)HuR的RNA識(shí)別基序(RRM)1的突變體B1、單獨(dú)HuRRRM2的突變體B2和單獨(dú)HuRRRM3的突變體B3)(圖4C)。同時(shí),我們?cè)O(shè)計(jì)并合成了生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針,分別特異性靶向lnc-PMIF的中心-莖環(huán)和生物素標(biāo)記的或未標(biāo)記的探針,特異性靶向之前報(bào)道的與HuR蛋白相互作用的β-actinmRNA的序列。RNA電泳遷移率變動(dòng)分析(EMSA)發(fā)現(xiàn)只有當(dāng)生物素標(biāo)記的lnc-PMIF探針與WTHuR或截短突變體B3共孵育時(shí),才能檢測(cè)到lnc-PMIF-HuR復(fù)合物,這表明HuR的RRM3可介導(dǎo)HuR和lnc-PMIF之間的相互作用。lnc-PMIF與β-actinmRNA競(jìng)爭(zhēng)與HuR相互作用。過表達(dá)HuR-RRM3后細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)下降***上調(diào),遷移活性增強(qiáng)。所有這些表明lnc-PMIF可與HuR的RRM3結(jié)合,中斷HuR-β-actin的相互作用,抑制β-actin的表達(dá),抑制OPC的遷移。
急性髓系白血病(AML)的靶向***的實(shí)施一直具有挑戰(zhàn)性。FTO是一種m6A去甲基酶,作為一種致*基因,促進(jìn)白血病*基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病發(fā)生。因此為大家介紹于2021年3月發(fā)表于影響因子為8.579的Theranostics上文章“Saikosaponin D exhibits anti-leukemic activity by targeting FTO/m6A signaling”。在這里,我們研究了Saikosaponin-d (SsD)在AML中***的抗增殖作用中的作用,并通過靶向SsD的FTO來評(píng)估m(xù)6A去甲基化活性。SsD在體外和體內(nèi)均能***抑制AML細(xì)胞增殖,促進(jìn)細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期阻滯。機(jī)制上,SsD直接靶向FTO,從而增加了m6A RNA的甲基化,降低了下游基因轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性,導(dǎo)致相關(guān)通路的抑制。重要的是,SsD還克服了FTO/m6A介導(dǎo)的白血病對(duì)酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性。總之,F(xiàn)TO依賴的m6A RNA甲基化介導(dǎo)了SsD的抗白血病作用,使SsD成為一種***白血病的藥物。***ATM對(duì)PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。
3)RIC8A與circPDE4B相互作用,參與OA
為了鑒別與circPDE4B相互作用的蛋白,我們采用RPD-MS(圖3A),共鑒定出112個(gè)與circPDE4B相互作用的蛋白(圖3B),確定RIC8A。HCs中的RNA-蛋白共定位證實(shí)了RIC8A和circPDE4B之間的相互作用(圖3C)。RPD實(shí)驗(yàn)表明,體外線性轉(zhuǎn)錄的circPDE4B能拉下重組RIC8A(圖3D)。然后,我們使用catRAPID工具預(yù)測(cè)circPDE4B和RIC8A的相互作用區(qū)域(圖3E)。為了識(shí)別預(yù)測(cè)的結(jié)合位點(diǎn),我們將FLcircPDE4B截短為3個(gè)片段。據(jù)預(yù)測(cè),RIP結(jié)果顯示有FL和S3被RIC8A拉下(圖3F)。有綜合來看,這些結(jié)果表明circPDE4B在HCs中與RIC8A相互作用。我們進(jìn)一步的研究表明,circPDE4B調(diào)控RIC8A蛋白水平,而不是mRNA水平或穩(wěn)定性(圖3G-I)。我們還阻斷了RIC8A蛋白的合成,并觀察到sh-陰性對(duì)照(NC)和sh-circPDE4B的HCs之間的RIC8A蛋白半衰期有明顯差異(圖3J),說明circPDE4B降低了RIC8A蛋白的穩(wěn)定性。經(jīng)PS341處理后,RIC8A在circPDE4B過表達(dá)和下調(diào)細(xì)胞中均未發(fā)生變化(圖3K,L),表明circPDE4B通過蛋白酶體活性調(diào)節(jié)RIC8A。無(wú)論內(nèi)源性還是外源性RIC8A,RIC8A的多泛素化在circPDE4B耗盡后均下降,在過表達(dá)circPDE4B后則上升(圖3O)。綜上,circPDE4B翻譯后影響蛋白酶體介導(dǎo)的RIC8A的降解和周轉(zhuǎn)。 完善的實(shí)驗(yàn)平臺(tái)提供可視化的建模服務(wù)。醫(yī)學(xué)科研課題贈(zèng)送提供技術(shù)路線
也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。內(nèi)分泌課題國(guó)家自然科學(xué)基金
我們進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠顯示更低的血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶(ALT)水平(圖2D)、血清天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶(AST)水平(圖2E)和肝臟甘油三酯水平(圖2F)??傊?,我們的結(jié)果表明Caspase-11缺陷減輕了MCD誘導(dǎo)的小鼠肝臟脂肪變性。
3.Caspase-11缺乏減弱NASH小鼠的肝纖維化
通過測(cè)量纖維化相關(guān)因子的表達(dá)我們?cè)u(píng)估Caspase-11缺失對(duì)MCD誘導(dǎo)的肝纖維化的影響。在正常條件下,野生型和Caspase-11缺陷小鼠的TGF-β(圖3A)、α-Sma(圖3B)和Col1a1(圖3C)表達(dá)相似。MCD處理的野生型小鼠中TGF-β、α-Sma和Col1a1的表達(dá)***上調(diào)。相比之下,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠TGF-β、α-Sma和Col1a1的mRNA水平***降低。這些結(jié)果表明,Caspase-11缺乏可減少M(fèi)CD處理小鼠的肝纖維化。 內(nèi)分泌課題國(guó)家自然科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)