急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學(xué)上的異質(zhì)性疾病，其特征是克隆擴(kuò)增和突變的造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞分化受損。在AML**常見(jiàn)的驅(qū)動(dòng)突變中，NPM1基因第12外顯子的4堿基對(duì)插入是穩(wěn)定的，在20%-30%的病例中發(fā)生。由于其生物學(xué)意義和預(yù)后影響，NPM1突變?cè)谑澜缧l(wèi)生組織(WHO)的髓性白血病分類(lèi)中**了一個(gè)獨(dú)特的白血病實(shí)體，并在預(yù)后和***決策中發(fā)揮重要作用。NPM1突變通常與誘導(dǎo)和鞏固化療后患者生存的良好影響相關(guān)。在NPM1突變的AML中，F(xiàn)LT3-ITD突變經(jīng)常與DNMT3A突變同時(shí)發(fā)生，這本身與接受標(biāo)準(zhǔn)誘導(dǎo)***的患者預(yù)后更差有關(guān)。大多數(shù)關(guān)于NPM1突變的AML的研究都集中在其他突變的同時(shí)發(fā)生，而突變型NPM1患者基因表達(dá)水平的異質(zhì)性及其生物學(xué)意義尚未得到***研究。英拜生物對(duì)實(shí)驗(yàn)可行性分析。外泌體課題基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)外包
三、INPP4B促進(jìn)晚期核內(nèi)體上PI(3,4)P2到PI(3)P的轉(zhuǎn)化
使用了幾種基于無(wú)偏性蛋白質(zhì)組學(xué)的技術(shù)來(lái)表征INPP4B在pik3a突變ER+乳腺*中的下游信號(hào)功能。首先，利用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)進(jìn)行全細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究，確定GFP-INPP4B與gfp載體表達(dá)MCF-7細(xì)胞中蛋白水平的差異(2倍)。功能注釋分析顯示，inpp4b過(guò)表達(dá)細(xì)胞中上調(diào)的蛋白與內(nèi)溶酶體系統(tǒng)密切相關(guān)，內(nèi)溶酶體系統(tǒng)是介導(dǎo)細(xì)胞外受體和貨物內(nèi)化和降解的囊泡運(yùn)輸途徑(圖3a)。免疫沉淀質(zhì)譜(IP-MS)對(duì)受EGF刺激的MCF-7細(xì)胞進(jìn)行GFP-INPP4B蛋白復(fù)合物的分析，以***I類(lèi)PI3K信號(hào)。從該分析中鑒定出的**富集的結(jié)合伙伴是RAB7A (Rab7)，這是一種定位于晚期核內(nèi)體的小GTPase(圖3b)。GFP-INPP4B與內(nèi)源性Rab7的共免疫共沉淀證實(shí)了INPP4B與Rab7的結(jié)合(圖3c)。通過(guò)免疫電鏡進(jìn)一步分析INPP4B定位于晚期核內(nèi)體，結(jié)果顯示GFPINPP4B定位于晚期核內(nèi)體的限制膜和內(nèi)膜(圖3d)，之前的研究已經(jīng)確定了PI(3,4)P2和PI(3)P。在皂苷處理的MCF-7細(xì)胞中，觀察到內(nèi)源性INPP4B與HARab7WT或HA-Rab7Q67L共同定位于cd63陽(yáng)性的晚期核內(nèi)體(圖3e)。 浙江課題課題設(shè)計(jì)我們使用抗體陣列評(píng)估了表達(dá)PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。
6、白樺素降低***的發(fā)展
用LDLR敲除小鼠探索了白樺素對(duì)***病變形成的作用。LDLR缺陷小鼠用WD飲食并分別添加了成分，對(duì)照（鹽），洛伐他?。?0mg/kg/day）或白樺素（30mg/kg/day）處理14周。不同組的小鼠顯示出相似的食物攝入量和體重（圖7A-7B）。在經(jīng)白樺素處理的小鼠肝臟中，SREBP-1c和SREBP-2降低，脂質(zhì)合成基因（包括HMGCS，HMGCR和FAS）下調(diào)（圖7C）。但是，洛伐他汀可上調(diào)HMGCR和FAS基因的表達(dá)（圖7C）。白樺素極顯著降低了血液中的TC，TG和LDL-c的含量，并增加了HDL-c。洛伐他汀具有類(lèi)似的作用，只是它不降低TG（圖7D–7G）。與對(duì)照處理的小鼠相比，洛伐他汀或白樺素處理的小鼠的主動(dòng)脈斑塊的數(shù)量和大小顯著降低（圖7H和7I）。特別是，主動(dòng)脈弓（圖7J）和胸主動(dòng)脈（圖7K）的病變區(qū)域明顯較小。以上數(shù)據(jù)表明，白樺素降低了WD喂養(yǎng)的LDLR敲除小鼠***病變的形成，并穩(wěn)定了主動(dòng)脈根部粥樣硬化斑塊。
總之，本文確定了SREBP的一種特定的小分子抑制劑，即betulin白樺素，可以降低脂質(zhì)水平，增強(qiáng)胰島素敏感性并減少***斑塊的形成。 這些數(shù)據(jù)支持以下觀點(diǎn)：抑制SREBP途徑可能是***II型糖尿病和***的有用策略。 Betulin可以作為藥物控制代謝性疾病的主要化合物。
轉(zhuǎn)座酶染色質(zhì)可及性單核測(cè)序(snATAC-seq)也是一種單細(xì)胞表觀遺傳組測(cè)序技術(shù)。單細(xì)胞核測(cè)序，能夠獲得組織的細(xì)胞圖譜，解決細(xì)胞異質(zhì)性的問(wèn)題。單細(xì)胞或細(xì)胞核RNA測(cè)序(scRNA-seq或snRNAseq)促進(jìn)了對(duì)定義腎臟細(xì)胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類(lèi)和小鼠腎臟的多個(gè)scRNAseq圖譜已經(jīng)確定了轉(zhuǎn)錄如何有助于細(xì)胞類(lèi)型的特異性。**近的方法已經(jīng)將這種方法擴(kuò)展到單細(xì)胞染色質(zhì)可及性分析。單核染色質(zhì)轉(zhuǎn)置可及性測(cè)序試驗(yàn)(snATACseq)是ATAC-seq的擴(kuò)展，該試劑盒利用Tn5轉(zhuǎn)置酶在數(shù)千個(gè)單個(gè)細(xì)胞中測(cè)量染色質(zhì)可及性。IGF-1信號(hào)在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。
CircMYH9促進(jìn)p53野生型小鼠的結(jié)直腸**發(fā)生
為了確定circMYH9在體內(nèi)CRC發(fā)病機(jī)制中的因果作用，通過(guò)將p53fl/fl小鼠與Villin-Cre小鼠雜交，產(chǎn)生了結(jié)腸特異性、條件性p53KO小鼠。p53WT小鼠和p53KO小鼠用氧化偶氮甲烷(AOM)和葡聚糖硫酸鈉(DSS)處理59天以誘導(dǎo)結(jié)直腸**發(fā)生。在AOM注射前一周，使用AAV9作為載體在小鼠結(jié)腸中特異性過(guò)表達(dá)circMYH9。AAV-circMYH9的轉(zhuǎn)染效率通過(guò)qPCR驗(yàn)證。與p53WT小鼠相比，p53KO小鼠的**數(shù)量、發(fā)病率和大小更多，與AAV-ctrl***的p53WT小鼠相比，p53WT小鼠中circMYH9的過(guò)度表達(dá)導(dǎo)致**數(shù)量、發(fā)病率和大小增加。帶有針對(duì)circMYH9的探針FISH證實(shí)circMYH9仍然在p53wt+AAV小鼠的**組織中表達(dá)。IHC檢查顯示，與ctrl-AAV小鼠相比，具有circMYH9過(guò)表達(dá)的**顯示出p53的表達(dá)受到抑制，而PHGDH和PSPH的表達(dá)增加?？傊?，這些結(jié)果表明circMYH9可以通過(guò)抑制p53和促進(jìn)小鼠SG代謝來(lái)驅(qū)動(dòng)化學(xué)誘導(dǎo)的致*作用。 ATM對(duì)PTEN的磷酸化導(dǎo)致PTEN在質(zhì)膜上重新分布。TOLL課題實(shí)驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)
產(chǎn)生關(guān)于環(huán)境影響疾病的病因和分子機(jī)制的可測(cè)試的假設(shè)。外泌體課題基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)外包
此外，circPDE4B不影響MID1水平(圖4E)。RPD和序列IP分析都顯示circPDE4B促進(jìn)了RIC8A和MID1的結(jié)合(圖4F，G)。與這一發(fā)現(xiàn)相一致的是，體外結(jié)合試驗(yàn)表明，circPDE4B增加了重組RIC8A和MID1蛋白之間的關(guān)聯(lián)(圖4H)。通過(guò)co-IP，MID1與RIC8A在N端調(diào)控域結(jié)合(圖4I)。此外，我們檢測(cè)了RIC8A的功能位點(diǎn)。在HCs中免疫沉淀RIC8A并進(jìn)行MS分析，證實(shí)了RIC8A中氨基酸殘基的泛素化(圖4J)。在RIC8A、K143和K187中鑒定出10個(gè)泛素化位點(diǎn)，并且在人類(lèi)和小鼠之間并不保守(圖4J)。因此，我們將保守的RIC8A位點(diǎn)從賴(lài)氨酸(K)突變?yōu)榫彼?R)，以排除泛素化。IP結(jié)果表明，與WT相比，K415的取代**降低了RIC8A的泛素化位點(diǎn)(圖4K)。有趣的是，K415在哺乳動(dòng)物中高度保守(圖4L，M)。此外，在K415突變后，circPDE4B過(guò)表達(dá)或抑制不再調(diào)節(jié)RIC8A的泛素化水平(圖4N)。這些結(jié)果表明circPDE4B可以作為促進(jìn)RIC8A和MID1之間聯(lián)系的支架。外泌體課題基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)外包
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)