2、HMH-exo增強低轉移性HCC細胞系的轉移潛力
為了探究HCC轉移時外泌體在細胞與細胞串擾中的可能作用,作者實驗HMH-exo預處理低轉移性的HCC細胞系。結果發(fā)現,與LMH-exo或者PBS預處理組相比,HMH-exo***增強了低轉移性HCC細胞系的轉移能力;隨后作者使用低轉移性HCC細胞系構建了體內原位異種移植瘤模型,成瘤后使用外泌體***6周,***檢測肝臟**和肺轉移,結果顯示與其它組相比,HMH-exo組的肝臟**更大,肺轉移結節(jié)更多。(圖2)。這些結果表明HMH-exo可以在體內外增強低轉移性HCC細胞的轉移能力。 上海英拜提供課題外包服務。RNA PULLdown課題課題設計
自噬“貨物”是有選擇性裝載的,其中主要依靠LIR基序與LC3互作,形成自噬體。隨后,自噬體進行運輸、溶解。研究表明,自噬異常會影響疾病進程。**中的自噬具有雙重作用:一方面自噬的發(fā)生會增強*細胞的生存能力;另一方面,抑制自噬會造成“廢物”的積累、基因突變等,誘發(fā)**。
1、Meta-GWAS分析
收集三組GWAS數據用于meta分析,確定了35個基因區(qū)域中36個**的基因突變(p<5×10?8)。接下來,分析SNP200kb內與AD***相關(p<10-5)的突變,篩選獲得PRKD3/NDUFAF7,SHARPIN,CHRNE,PLCG2,APP6個基因,這6個基因都存在于AD發(fā)病***相關的突變。
2、多基因風險評分(PRS)
為了評估AD遺傳景觀的穩(wěn)健性和綜合效應,基于39個遺傳變異(不包括APOE基因型)構建了一個加權PRS。
接下來測試了RPS與臨床診斷的關聯(lián)。PRS與臨床診斷的AD病例的關聯(lián)與病理證實的AD的關聯(lián)相似;在伴隨的腦部病變(除AD之外)存在的情況下PRS與AD相關;在不同性別中,RPS與AD的相關性無差異,并且在早發(fā)型、晚發(fā)型中效果一致。
3、PRS有可能及早識別有風險的受試者
使用12,386例樣本分析RPS能否識別早發(fā)型AD(AAO),結果表明,PRS與APOE基因型相結合,可能對AAO進行有效的預測。 免疫熒光課題實驗檢測服務生命科學領域內的精細研究。
LC3陽性囊泡在質膜損傷后在修復部位積聚用激光照射*細胞MCF7,致使細胞膜上形成小孔。使用膜不可滲透的FM1-43染料測量膜完整性,發(fā)現在Ca2+存在下,細胞能夠在20到30s內修復它們的質膜(Fig.1,AandB,left);在缺乏Ca2+的培養(yǎng)基中受損的細胞無法修復并繼續(xù)吸收細胞不可滲透的染料(Fig.1B,right)。使用穩(wěn)定表達融合蛋白增強型綠色熒光蛋白(eGFP)-LC3的MCF7細胞研究激光照射后自噬是否參與該過程,結果顯示,LC3陽性點在損傷后大約8-10min開始在修復部位形成(Fig.1C);在未損傷區(qū)域中LC3陽性點未增加(Fig.1D);LC3依賴于ATG7(Fig.1E-H)。
長鏈非編碼RNA(lncRNA)可以順式或反式發(fā)揮多種功能,包括調節(jié)基因轉錄和RNA剪接、調節(jié)RNA和蛋白質的活性或豐度以及組織核結構域。它們***參與細胞命運編程/重編程、分化、發(fā)育,尤其是與人類疾病相關。盡管近年來高通量測序技術的快速發(fā)展已經鑒定了數十萬種人類lncRNA,但其中只有一小部分得到了很好的表征。
***我們來講一個關于lncRNA的數據——LncExpDB(./lncexpdb),該數據庫由中國國家生物信息中心和中國科學院北京基因組研究所團隊搭建,數據庫相關文章于2020年10月12日以“LncExpDB:anexpressiondatabaseofhumanlongnon-codingRNAs”為題在線發(fā)表于NucleicAcidsResearch雜志(IF=)。 zVAD預處理也略微增加了IR后PTEN-398A細胞中未解決的DNA損傷灶的數量。
四、在體內和體外,NUPs的上調導致TDP-43/TBPH定位錯誤和聚集
為了檢測Nup上調對Tbph (Drosophila TDP-43)病理的影響,我們建立了一個位點特異性Nup62過表達(Nup62 OE)蠅線,并對內源性Tbph進行染色。在eGFP對照(以下稱為對照)表達的果蠅幼蟲VNC中,Tbph的分布以細胞核為主,而Nup62 OE幼蟲VNC***改變了Tbph的定位,出現細胞質聚集(圖4A)。定量分析顯示,與對照組相比,Nup62 OE果蠅幼蟲或成年大腦中斑點Tbph***增加(圖4B)。與對照組相比,Nup62 OE vnc的核Tbph強度***降低(圖4C)。此外,核細胞質(N/C)分割進一步證實,與對照組相比,Nup62 OE動物的Tbph N/C比值***降低(圖4D和E),表明Nup62的上調改變了Tbph在體內的亞細胞定位。Nup62表達引起的Tbph的錯位和聚集也讓我們檢測了Nup62表達是否影響Tbph的溶解度。 TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。鐵死亡課題整體服務
小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現典型的外泌體結構。RNA PULLdown課題課題設計
點擊該基因的名稱,將彈出該基因在NCBI中的鏈接。也可以單擊“paper ID”來瀏覽原始文獻中的更多詳細信息。***,在“詳細信息”部分中總結了有關疾病,細胞類型和基因的詳細信息。SC2disease還提供了從基于單細胞的結果和基于GWAS的結果得出的疾病的易感基因。所有GWAS數據均從GWAS目錄獲得。以2型糖尿病為例,將通過單擊“可視化”顯示由scRNA-seq和GWAS檢測到的易感基因列表。此外,可通過單擊“可視化”以可視方式顯示結果。在所得圖中,x軸是從GWAS結果獲得的基因中SNP的**小P值。y軸是從scRNA-seq結果獲得的疾病的重疊敏感性基因的細胞類型。條的顏色顯示基因表達的log 2倍變化。RNA PULLdown課題課題設計
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗