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來源: 發(fā)布時間:2021-11-07

8)人類乳腺*患者中LINC00926和PGK1表達(dá)的相關(guān)性

及LINC00926與葡萄糖攝取的相關(guān)性我們通過IHC和FISH檢測109例人乳腺*樣本中PGK1和LINC00926的表達(dá)情況。與培養(yǎng)細(xì)胞中LINC00926抑制PGK1的結(jié)果一致,LINC00926的表達(dá)與PGK1的表達(dá)呈負(fù)相關(guān),與FOXO3A呈正相關(guān)(圖8A)。通過18FDGPET掃描評估葡萄糖攝取增加的乳腺**患者顯示LINC00926和FOXO3A表達(dá)降低,而PGK1表達(dá)增加(圖8B)。綜上所述,這些數(shù)據(jù)表明了LINC00926/PGK1軸在乳腺*中的重要病理作用。

結(jié)論我們的研究***證實(shí)了LINC00926通過抑制糖酵解關(guān)鍵酶PGK1的表達(dá)來抑制糖酵解,從而在體內(nèi)外抑制乳腺*細(xì)胞的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移。在乳腺*患者中,F(xiàn)OXO3A調(diào)控的LINC00926與PGK1表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)概述了FOXO3A/LINC00926/PGK1軸在Warburg效應(yīng)和乳腺**發(fā)生進(jìn)展中的重要性。因此,上調(diào)LINC00926可能是***PGK1過表達(dá)的乳腺*患者的一種有前途的方法。 IGF-1信號在Pex誘導(dǎo)的肝纖維化中起重要作用。肝損傷課題CRO

這些明確的造血干細(xì)胞在妊娠后4周(pcw)首先在胎兒肝臟定植,并在那里大量擴(kuò)張。在10.5 pcw時,造血部位再次轉(zhuǎn)移到骨腔(即骨髓[BM]),成人造血在此處長久建立。人們認(rèn)為,***批在骨髓中播種的造血干細(xì)胞在其增殖和分化特性發(fā)生戲劇性變化之前,會繼續(xù)快速增加數(shù)量,以適應(yīng)高產(chǎn)量分化子代的需要。

歷史上,造血系統(tǒng)的分化過程被描述為一系列中間步驟,由細(xì)胞表面標(biāo)記物(即分化簇[CD])定義。在這個模型中,造血干細(xì)胞通常表現(xiàn)為造血樹,造血干細(xì)胞產(chǎn)生了越來越多的譜系限制性細(xì)胞類型,**終導(dǎo)致成熟的血細(xì)胞。這種模式在過去的5年里發(fā)生了改變,一些研究報告了數(shù)千個單個造血細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄組,這些細(xì)胞被細(xì)胞表面標(biāo)記物隔離,在小鼠模型和成人中。這些報告表明,以前被認(rèn)為是同質(zhì)的祖先種群,實(shí)際上在轉(zhuǎn)錄水平上是非常異構(gòu)的。 細(xì)胞因子芯片英拜生物對整體實(shí)驗(yàn)實(shí)施的全局把控。

細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學(xué)抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物,目前正在其他**類型的數(shù)百項(xiàng)臨床試驗(yàn)中進(jìn)行評價。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內(nèi)在細(xì)胞抑制機(jī)制,而其作為免疫調(diào)節(jié)劑的新作用知之甚少。本研究利用整合的表觀基因組、轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)分析,證明了CDK4/6抑制劑在促進(jìn)免疫T細(xì)胞記憶的表型和功能獲得中的新作用。本文的機(jī)制見解拓寬了CDK4/6抑制劑作為增強(qiáng)抗**T細(xì)胞免疫的臨床工具的前瞻性效用。本研究于2021年5月14日發(fā)表在《Cancer Discovery》IF:29.497期刊上。

1)SsD在AML中表現(xiàn)出抗增殖活性

為了闡明SsD在白血病中的藥理作用,我們在10個人白血病細(xì)胞系中探討了一系列SsD濃度的影響。我們發(fā)現(xiàn)SsD在大多數(shù)白血病細(xì)胞系中以劑量依賴的方式抑制細(xì)胞活力(圖1A)。為了進(jìn)一步研究SsD對白血病的抑制作用,我們在4種白血病細(xì)胞系NB4、kas1、MV4-11和U937(SsD敏感性排名前4位的細(xì)胞)進(jìn)行了集落實(shí)驗(yàn)。與細(xì)胞活力結(jié)果相似,SsD***抑制了所測細(xì)胞系的集落數(shù)量和大小(圖1B-E)。有趣的是,SsD對細(xì)胞增殖和活力的抑制可能是由于細(xì)胞周期阻滯在G1期和NB4細(xì)胞凋亡增加(圖1F-G)。 可以上傳原始的fast文件。

2)SsD響應(yīng)相關(guān)基因和通路的鑒定

為了進(jìn)一步確定可能與白血病細(xì)胞中SsD敏感性相關(guān)的潛在靶點(diǎn),我們對SsD處理過的NB4細(xì)胞進(jìn)行了RNA測序。我們共發(fā)現(xiàn)3732個上調(diào)基因和3442個下調(diào)基因(圖2A)。為了揭示SsD的潛在機(jī)制,我們進(jìn)行了富集分析并研究了差異基因相關(guān)的通路。我們篩選了上調(diào)和下調(diào)基因富集的**個通路(圖2B)。此外,我們使用GSEA研究SsD處理影響的信號通路(圖2C)。我們的數(shù)據(jù)顯示,SsD處理導(dǎo)致MYC靶點(diǎn)、E2F靶點(diǎn)和G2M檢查點(diǎn)信號級聯(lián)受到抑制。有趣的是,這些發(fā)現(xiàn)與FTO抑制劑和內(nèi)源性FTO的下調(diào)抑制的信號通路相一致。因此,SsD的抑制作用可能有助于FTO抑制細(xì)胞周期和增殖(圖2D-E)。此外,絕大多數(shù)通過FTO敲低而上調(diào)的信號通路對SsD富集,同樣,絕大多數(shù)被SsD抑制的信號通路也被FTO敲低而抑制(圖2F)。更重要的是,SsD介導(dǎo)的m6A相關(guān)基因的變化具有***的一致性(圖2G)。綜上所述,SsD可能參與了FTO介導(dǎo)的m6ARNA甲基化途徑。 高通量分子實(shí)驗(yàn)的后續(xù)標(biāo)書申請指導(dǎo)服務(wù)。克羅恩課題課題設(shè)計

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miR-144通過FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路發(fā)揮促血管生成功能

我們確定NPC-EV來源的miR-144是否通過介導(dǎo)FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路促進(jìn)HUVECs的血管樣管形成。免疫印跡分析結(jié)果表明,在miR-144抑制劑處理的鼻咽*細(xì)胞來源的EVs中,si-FBXW7處理導(dǎo)致FBXW7表達(dá)下調(diào),HIF-1α和VEGF-A表達(dá)升高。這表明miR-144對HIF-1α/VEGF-A通路的影響是以FBXW7依賴的方式發(fā)生的(圖6A)。同樣地,我們還發(fā)現(xiàn)與單獨(dú)抑制miR-144相比,聯(lián)合抑制miR-144和FBXW7后,HUVEC的遷移(圖6B)和侵襲(圖6C)增強(qiáng),以及血管樣管形成(圖6D)增加,這表明miR-144在體外依賴于FBXW7的促血管生成功能。體內(nèi)Matrigel栓試驗(yàn)(圖6E和6F)顯示,與單獨(dú)抑制miR-144相比,包含miR144模擬物處理過的鼻咽*細(xì)胞EVs的凝膠栓在miR-144和FBXW7抑制聯(lián)合作用下,新形成的血管增強(qiáng)了,說明NPC-EVmiR-144在體內(nèi)依賴于FBXW7的促血管生成功能。

結(jié)論:總之,本研究的關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)為EV來源的miR-144在體外鼻咽*的進(jìn)展中發(fā)揮促進(jìn)作用提供了證據(jù)。具體來說,miR-144可以通過鼻咽*細(xì)胞來源的EVs轉(zhuǎn)運(yùn)到HUVECs,**終強(qiáng)化其惡性表型,為鼻咽*基于EVs的生物標(biāo)志物和***方式的發(fā)展提供了一個新靶點(diǎn)。 肝損傷課題CRO

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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)