2021年,來自加拿大多倫多大學(xué)和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學(xué)等團隊合作在Nature communication雜志上發(fā)表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質(zhì)性?;趓na-seq的基因表達譜分析,確定了兩種新亞型,稱為原始型和committed型?;诨虮磉_、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異,在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態(tài)和患者生存聯(lián)系起來。此外,表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。***ATM對PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。醫(yī)學(xué)科研課題細(xì)胞實驗
miR-144在鼻咽*組織和細(xì)胞中上調(diào)
先前的文獻強調(diào)了miR-144在NPC發(fā)展過程中的促*作用。我們首先確定miR-144在NPC中的表達模式。采用qRT-PCR方法分析95例鼻咽*活檢標(biāo)本和95例慢性鼻咽炎鼻咽活檢標(biāo)本中miR-144的表達。結(jié)果表明,miR-144在鼻咽*組織中的表達水平高于在非*性鼻咽組織中的表達水平(圖1A),并通過原位雜交(ISH)進一步驗證(圖1B)。如圖1C所示,相對于非*性鼻咽組織,鼻咽*組織中CD31的免疫組化染色增強。在鼻咽*組織中,CD31的表達與miR-144的表達呈正相關(guān)(圖1D)。隨后,我們通過qRT-PCR比較了人鼻咽*細(xì)胞系(C666-1和SUNE1)和鼻咽上皮細(xì)胞系NP69之間miR-144的表達水平。與預(yù)期的一樣,C666-1和SUNE1細(xì)胞表現(xiàn)出相對于NP69更高水平的miR-144表達(圖1E)。以上結(jié)果提示,miR144在鼻咽*組織和細(xì)胞中呈高表達,與CD31表達呈正相關(guān),表明miR144與**血管生成具有潛在的相關(guān)性。 炎癥課題售后服務(wù)提供分子生物以及到后續(xù)動物建模的一整套服務(wù)。
四、在體內(nèi)和體外,NUPs的上調(diào)導(dǎo)致TDP-43/TBPH定位錯誤和聚集
為了檢測Nup上調(diào)對Tbph (Drosophila TDP-43)病理的影響,我們建立了一個位點特異性Nup62過表達(Nup62 OE)蠅線,并對內(nèi)源性Tbph進行染色。在eGFP對照(以下稱為對照)表達的果蠅幼蟲VNC中,Tbph的分布以細(xì)胞核為主,而Nup62 OE幼蟲VNC***改變了Tbph的定位,出現(xiàn)細(xì)胞質(zhì)聚集(圖4A)。定量分析顯示,與對照組相比,Nup62 OE果蠅幼蟲或成年大腦中斑點Tbph***增加(圖4B)。與對照組相比,Nup62 OE vnc的核Tbph強度***降低(圖4C)。此外,核細(xì)胞質(zhì)(N/C)分割進一步證實,與對照組相比,Nup62 OE動物的Tbph N/C比值***降低(圖4D和E),表明Nup62的上調(diào)改變了Tbph在體內(nèi)的亞細(xì)胞定位。Nup62表達引起的Tbph的錯位和聚集也讓我們檢測了Nup62表達是否影響Tbph的溶解度。
3)M1-BMDMs來源的外泌體上調(diào)ROS水平,損害bEnd.3細(xì)胞的線粒體功能
已有研究表明,ROS與BSCB中斷有關(guān),調(diào)節(jié)ROS水平在促進***系統(tǒng)損傷后功能恢復(fù)中起著至關(guān)重要的作用?;谥暗慕Y(jié)果,我們研究了M1-BMDMs和ROS在bEnd.3細(xì)胞中的關(guān)系。流式細(xì)胞術(shù)分析表明,M1-CM處理可***提高bEnd.3細(xì)胞中ROS水平。GW4869可以部分逆轉(zhuǎn)這種增加(圖3A和B)。此外,與M1-CM孵育后,線粒體超氧化物水平***升高,GW4869部分消除線粒體超氧化物水平(圖3C和D)。如圖JC-1染色所示,加入M1-CM后線粒體電位***降低,GW4869部分恢復(fù)線粒體電位(圖3E和F)。M1-CM處理使線粒體長度縮短、腫脹,線粒體破碎的細(xì)胞比例明顯增加。然而,GW4869可以部分逆轉(zhuǎn)線粒體形態(tài)變化(圖3G和H)。此外,M1-CM暴露***降低了氧化磷酸化的生物標(biāo)志物OCR(圖3I)?;A(chǔ)呼吸,ATP產(chǎn)生,呼吸能力,呼吸逆轉(zhuǎn)在添加M1-CM后***減少,而GW4869部分緩解了這一影響(圖3J)。 動物建模模型實驗的整體服務(wù)。
HA-Rab7T22N是一個不定位于晚期核內(nèi)體的顯性陰性突變體(補充圖3f),它的表達也阻止了內(nèi)源性INPP4B的募集(圖3e),表明活性的gtp結(jié)合的Rab7是INPP4B亞細(xì)胞定位到晚期核內(nèi)體所必需的。 GFP-INPP4B***提高了細(xì)胞內(nèi)PI(3)P水平(1.8倍)(圖3f),PI(3,4)P2也存在于早期和晚期核內(nèi)體。表達INPP4B shrna的MCF-7細(xì)胞顯示出更明顯的細(xì)胞內(nèi)PI(3,4)P2斑點,表明INPP4B缺失抑制PI(3,4)P2在核內(nèi)體上的降解,導(dǎo)致其積累(圖3g)。GFP-INPP4B沒有改變PI(3) p陽性早期核內(nèi)體的比例,但***增加了PI(3) p陽性晚期核內(nèi)體的比例(1.7倍)(圖3h, i)。完善的實驗平臺提供可視化的建模服務(wù)。推薦課題細(xì)胞實驗
提供***科研設(shè)計咨詢及輔助實驗。醫(yī)學(xué)科研課題細(xì)胞實驗
6、CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化促進CRLM
將弱轉(zhuǎn)移的CRC細(xì)胞系SW480和RKO與miR-934mimics預(yù)處理的THP-1細(xì)胞的CM共培養(yǎng)。結(jié)果顯示,無論是體內(nèi)還是體外,侵襲和轉(zhuǎn)移能力都隨著miR-934mimics外泌體處理而升高,隨著anti-miR-934外泌體處理而下降(Fig.6c–g)。這些結(jié)果表明,CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化可以增強CRC細(xì)胞的侵襲和肝轉(zhuǎn)移能力。
7、CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化,通過***CRC細(xì)胞中的CXCL13/CXCR5軸促進CRLM
用HCT-8細(xì)胞來源的外泌體與陰性對照處理或PMA預(yù)處理的THP-1細(xì)胞孵育,分析趨化因子水平。如Fig.7a所示,CXCL13、IL-10和CCL22的表達水平遠遠高于其他趨化因子的水平。然后,PMA-pretreatedTHP-1細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-934mimics或NC,ELISA表明CXCL13的表達***增加(大約10倍)而CCL22和IL-10(二至三倍),這表明CXCL13可能在CRLM的進展扮演了一個重要的角色(Fig.7b)。此外,結(jié)果顯示,過表達miR-934或下調(diào)miR-934可部分增強或減弱HT29/HCT8細(xì)胞來源外泌體對M2巨噬細(xì)胞分泌CXCL13的增強作用(Fig.7c)。 醫(yī)學(xué)科研課題細(xì)胞實驗
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗