2、miR-138-5p介導(dǎo)*細胞誘導(dǎo)的巨噬細胞KDM6B表達抑制構(gòu)建了miR-138-5p過表達的乳腺*細胞系，取其培養(yǎng)基與巨噬細胞共培養(yǎng)，結(jié)果巨噬細胞中miR-138-5p表達***上調(diào)，同時KDM6B的表達***下降。證實miR-138-5p介導(dǎo)*細胞誘導(dǎo)的巨噬細胞KDM6B表達抑制。
3、*細胞來源的外泌體miR-138-5p下調(diào)KDM6B的表達
隨后為了判定上述巨噬細胞中miR-138-5p表達上調(diào)的原因，檢測了巨噬細胞中原代(pri-)和前體(pre-)miR-138的水平。結(jié)果顯示共培養(yǎng)和對照組間原代和前體miR-138的水平?jīng)]有差異，表明miR-138-5p是外源供應(yīng)的（圖1A）。此外，使用RNaseA處理miR-138-5p水平不變，使用TritonX-100其水平***下降。提示miR-138-5p被膜狀結(jié)構(gòu)包裹（圖1B）。進一步分析表明使用外泌體抑制劑GW4869處理組和外泌體刪除組的培養(yǎng)基中miR-138-5p的表達***下降（圖1C）。表明外泌體來源于乳腺*細胞。 circNDUFB2與IGF2BPs相互作用促進泛素/蛋白酶體介導(dǎo)的IGF2BPs降解.重慶TOLL標書
4、TCR和IFN信號共同誘導(dǎo)CD8+T細胞代謝重組
為了研究導(dǎo)致IFN-HighCD8+T細胞線粒體和代謝變化的連續(xù)事件，接下來使用來源于健康對照和結(jié)合了延長IFN處理和TCR活化（這是SLE患者中存在的兩種基本細胞信號）的細胞。盡管CD8+T細胞暴露于IFNα里2天不會引發(fā)任何***的線粒體或代謝變化但7天IFNα暴露，尤其是結(jié)合T細胞活化，可誘導(dǎo)mtDNA編碼基因表達下調(diào)（圖4a）和線粒體變化（圖4b）。然后，分析了CD8+T細胞的氧化能力，發(fā)現(xiàn)在有或沒有CD3/CD28活化的情況下，7天IFNα刺激***增強了基礎(chǔ)OCR，但沒有比較大OCR，當數(shù)值標準化到每個樣本的基礎(chǔ)水平時，導(dǎo)致SRC降低，尤其是當IFNα暴露與T細胞活化結(jié)合時（圖4c）。 circRNA標書省自然科學(xué)基金FMT可能通過***NF -κB信號通路來緩解腸道炎癥。
雄***和雄***受體(AR)是******轉(zhuǎn)錄因子(TF)，是驅(qū)動前列腺*(PCa)發(fā)***展的關(guān)鍵因素。因此AR是晚期PCa******的主要分子靶點。雄***剝奪療法，特別是第二代抗雄***和雄***合成抑制劑**初是有效的。然而，由于患者仍然可以從晚期PCa進展到致命性去勢抗性前列腺*(CRPC)，需要新的***靶點和生物標志物。靶蛋白的一個來源可能是ar相關(guān)的染色質(zhì)蛋白。
大多數(shù)目前已知的核受體(NR)相互作用蛋白，包括那些AR，已經(jīng)通過遺傳篩選，如雙雜交系統(tǒng)，免疫共沉淀和基于肽段的體外方法。盡管親和純化-質(zhì)譜耦合(MS)已經(jīng)啟發(fā)了NRs的輔助調(diào)節(jié)器，但它很少在**NRs自然環(huán)境的條件下進行。然而，通過利用RIME(內(nèi)源性蛋白快速免疫沉淀MS)，Paltoglou等人和Stelloo等人已經(jīng)從PCa細胞交聯(lián)染色質(zhì)中鑒定了幾種內(nèi)源性AR相關(guān)蛋白。
一、CRPC細胞中AR的染色體
散點圖顯示在VCaP細胞的兩個生物重復(fù)中由AR ChIP-SICAP鑒定的染色質(zhì)相關(guān)蛋白。在暴露于R1881(合成AR激動劑）中使用差異的silac標記。在190個ChIP-SICAP定量蛋白中，87個形成了r1881誘導(dǎo)的AR染色體，從而發(fā)現(xiàn)了可能與受體功能相互作用的蛋白。r1881誘導(dǎo)的AR chromatome被分為不同的功能蛋白組(圖1b)。DNA和rna結(jié)合蛋白，組蛋白，DNA修復(fù)和mRNA加工相關(guān)蛋白形成了大部分(~50%)的網(wǎng)絡(luò)。
二、SMARCA4共占據(jù)了大多數(shù)ar結(jié)合位點，但對其染色質(zhì)可及性的影響有限
SMARCA4和AR共同占據(jù)的位點，以及雄***如何影響共同占據(jù)。SMARCA4(61534)的大多數(shù)染色質(zhì)結(jié)合位點沒有受到DHT的影響(簇C1，圖2a），在C2位點，AR和SMARCA4與結(jié)合高度相關(guān)。DHT增強了SMARCA4在這些位點的招募(集群C1，圖2b)?；蚍治鲲@示，與C1位點相比，C2位點具有更高的雄***響應(yīng)元件(AREs)富集，進一步支持雄***誘導(dǎo)的SMARCA4到染色質(zhì)上的募集。FOXA1、ERG和HOXB13的基序依次在C1和C2位點上同樣富集(圖2c)。ChIP-seq數(shù)據(jù)集顯示，F(xiàn)OXA1和ERG的結(jié)合隨著***暴露在C2位點而增加，而在C1位點則不增加(圖2d和e)。然而，HOXB13似乎在C1位點結(jié)合更多(圖2f)。 circNDUFB2可能在NSCLC的進展中起***作用。
染色質(zhì)可及性是驅(qū)動腎元發(fā)育的動態(tài)過程，而腎元祖細胞具有不同的染色質(zhì)可及性譜，且隨其分化而變化。染色質(zhì)可及性在促進或抑制腎臟修復(fù)和再生中的作用對于設(shè)計急性和慢性腎臟疾病的治療方案具有重要意義，并可能有助于改善腎臟類***的定向分化。scRNA-seq和snATAC-seq在成年小鼠腎臟中的聯(lián)合分析為理解染色質(zhì)可及性如何調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄提供了一個框架。然而，人類腎臟的單細胞表觀基因組還沒有被描述。
生物信息學(xué)工具可以從snATAC-seq數(shù)據(jù)集中提取出scRNA-seq無法獲取的***信息。預(yù)測細胞類型特異性順式調(diào)控DNA相互作用和轉(zhuǎn)錄因子活性是補充scRNA-seq獲得的轉(zhuǎn)錄信息的兩種方法。長程染色質(zhì)-染色質(zhì)相互作用在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中起著重要作用，并受到轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的影響。染色質(zhì)可及性分析將有助于識別通過遠程相互作用影響轉(zhuǎn)錄的遠程調(diào)控區(qū)域。 我們證明circSDHC作為miRNA-127-3p的海綿.北京醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)實驗標書
SCI小鼠的握力在損傷后逐漸持續(xù)恢復(fù)。重慶TOLL標書
五、阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配
研究了磷脂酰肌醇3,4,5磷酸(PIP3)在DNA損傷后的細胞定位。將MCF10A細胞按上述方法同步輻照，免疫熒光法分析PTEN的亞細胞分布。PTEN-WT和PTEN-398A蛋白在細胞核和質(zhì)膜穩(wěn)定定位(圖6A, B)。經(jīng)過IR處理后，PTEN-WT在質(zhì)膜上積累(圖6A, B)。相比之下，在這些條件下，沒有檢測到PTEN-398A蛋白的重新定位(圖6A, B)。B).我們通過細胞分離和膜相關(guān)PTEN的免疫印跡分析進一步證實了這些結(jié)果(圖6C, D)。這些結(jié)果表明，ATM對PTEN的磷酸化導(dǎo)致PTEN在質(zhì)膜上重新分布，這與AKT通路***減少有關(guān) 重慶TOLL標書
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
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