7）SsD克服了m6A介導(dǎo)的白血病對(duì)酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性由于FTO抑制使耐藥細(xì)胞對(duì)酪氨酸激酶抑制劑（TKI）***敏感，我們檢測了SsD對(duì)TKI耐藥細(xì)胞的療效。我們發(fā)現(xiàn)SsD聯(lián)合尼洛替尼或PKC412在降低細(xì)胞活力方面更有效(圖7A)，這表明SsD***抑制了Kas-1NR和MV4-11PR細(xì)胞的增殖。細(xì)胞的分子特征也顯示TKIS介導(dǎo)的m6A低甲基化被挽救(圖7B-C)。雖然SsD沒有改變Kas-1NR和MV4-11PR細(xì)胞中ALKBH5、METTL3、YTHDF2的蛋白水平(圖7D)，但TKI上調(diào)的m6A相關(guān)基因MerTK、BCL-2和STAT3的表達(dá)受損(圖7E)。與上述結(jié)果一致，MerTK、BCL-2和STAT3在TKI耐藥細(xì)胞的mRNA和蛋白水平上更穩(wěn)定這些細(xì)胞表現(xiàn)出更強(qiáng)的攻擊性和增殖能力.外泌體標(biāo)書
CircCwc27下調(diào)可預(yù)防APP/PS1小鼠Aβ沉積及相關(guān)的神經(jīng)退行性影響行為測試后，進(jìn)一步探索CircCwc27對(duì)AD病理的影響。研究中用抗Aβ抗體對(duì)APP/PS1小鼠的腦切片進(jìn)行染色，結(jié)果顯示，注射LV-shCircCwc27的小鼠斑塊負(fù)荷明顯減輕，還發(fā)現(xiàn)注射LV-shCircCwc27后，皮質(zhì)和海馬的可溶性和不可溶性aβ40和aβ42也持續(xù)減少。此外，APP/PS1小鼠中，CircCwc27的表達(dá)與Aβ40和aβ42的水平呈正向關(guān)。鑒于LV-sh-CircCwc27注射液對(duì)斑塊沉積的保護(hù)作用，我們通過LAMP1抗體免疫染色檢測了CircCwc27敲低是否影響軸突萎縮，因?yàn)樵贏D小鼠模型中，LAMP1陽性營養(yǎng)不良神經(jīng)突與Aβ斑塊密切相關(guān)。我們發(fā)現(xiàn)注射LV-sh-CircCwc27的小鼠海馬中Aβ與營養(yǎng)不良神經(jīng)突共定位的面積***減少(Figs.3H)。此外，還確定了CircCwc27對(duì)突觸完整性的，LV-sh-CircCwc27注射并不影響突觸相關(guān)蛋白的表達(dá)，而在APP/PS1小鼠中則***防止突觸相關(guān)蛋白降低(Figs.3I)。小鼠腦切片免疫熒光染色進(jìn)一步證實(shí)了上述結(jié)果。神經(jīng)炎癥是AD的另一個(gè)重要病理標(biāo)志。研究中注射LV-sh-CircCwc27***降低了APP/PS1小鼠小膠質(zhì)細(xì)胞和星形膠質(zhì)細(xì)胞的活性(Figs.3J)。以上結(jié)果表明，敲除CircCwc27在AD的神經(jīng)炎癥和神經(jīng)退行性影響中具有保護(hù)作用。鐵死亡標(biāo)書省自然科學(xué)基金環(huán)狀RNA（circRNA）是一類共價(jià)閉合的單鏈RNA.
因此，作者推測**-細(xì)胞CM通過重組內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的脂質(zhì)組分來觸發(fā)IRE1/XBP1的***。內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜脂質(zhì)譜顯示，與對(duì)照組相比，CM處理的BMDM的PC/PE比值***降低，并觀察到PUFA的比值***下降。隨后，作者通過過表達(dá)LPCAT3（一種PC合成酶）試圖挽救內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜脂質(zhì)組分。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，過表達(dá)LPCAT3***增加了CM刺激的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的PC/PE比值和不飽和PC的豐度，還觀察到LPCAT3過表達(dá)減少了CM處理的BMDM內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜的延伸，以及阻斷CM誘導(dǎo)的sXBP1產(chǎn)生和致瘤性基因的表達(dá)。綜上所述，這些數(shù)據(jù)表明，**誘導(dǎo)的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜脂質(zhì)成分重組對(duì)啟動(dòng)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激介導(dǎo)的致瘤極化至關(guān)重要。
為了識(shí)別潛在的差異表達(dá)的 circRNA，從 GEO 數(shù)據(jù)庫中篩選了可能在 CRC和*旁組織中差異表達(dá)的circRNA。共檢測到8個(gè)下調(diào)的 circRNA和237 個(gè)上調(diào)的circRNA。然后，通過微陣列分析進(jìn)一步分析3對(duì)CRC和*旁組織中的circRNA表達(dá)譜，92個(gè)circRNA上調(diào)，85個(gè)circRNA下調(diào)。數(shù)據(jù)庫中的 237 個(gè)上調(diào)circRNA與微陣列中92個(gè)上調(diào)circRNA相交，鑒定出9個(gè)重疊的 circRNA。在9個(gè)circRNA中，hsa_circ_0092283，也稱為 circMYH9，起源于 MYH9 基因，由內(nèi)含子37的頭尾剪接組成。由于circMYH9與其他8個(gè)circRNA相比顯著上調(diào)，選擇它進(jìn)行進(jìn)一步研究。qRT-PCR 分析表明 circMYH9可以通過cDNA中的不同引物進(jìn)行擴(kuò)增，并且在基因組 DNA（gDNA）組中沒有觀察到其他產(chǎn)物。此外，circMYH9 對(duì) RNase R具有抗性，而 MYH9 mRNA 可以被RNase R降解。然后，通過 Sanger 測序證實(shí)了circMYH9 的RT-PCR 產(chǎn)物。circNDUFB2通過增強(qiáng)泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩(wěn)定性。
然而，在EHGB1細(xì)胞系中，過表達(dá)miR-502-3p延緩了細(xì)胞的生長、遷移和侵襲。為檢測LncRNA HGBC是否誘導(dǎo)SET表達(dá)是否取決于LncRNA HGBC與miR-502-3p的結(jié)合，在GBC-SD和EH-GB1兩個(gè)細(xì)胞系中，通過過表達(dá)LncRNA-HGBC發(fā)現(xiàn)mRNA和蛋白質(zhì)水平上SET表達(dá)上調(diào)，LncRNA HGBC的過度表達(dá)導(dǎo)致SET表達(dá)增加，而LncRNA HGBC的miR-502-3p結(jié)合位點(diǎn)突變卻未能誘導(dǎo)SET表達(dá)，通過IHC發(fā)現(xiàn)，**異種移植模型中在LncRNA-HGBC耗盡之后SET的表達(dá)量也隨之降低，過表達(dá)LncRNA-HGBC的**異種移植模型中LncRNA-HGBC表達(dá)量***增加，說明LncRNA-HGBC和SET之間存在共表達(dá)，LncRNA-HGBC通過競爭性結(jié)合miR-502-3p調(diào)節(jié)SET的表達(dá)。我們進(jìn)行了熒光素酶報(bào)告基因檢測.成都SCI標(biāo)書
轉(zhuǎn)座酶染色質(zhì)可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細(xì)胞表觀遺傳組測序技術(shù)。外泌體標(biāo)書
miR-138-5p抑制巨噬細(xì)胞表達(dá)KDM6B
首先檢查了MB-MDA-231乳腺*細(xì)胞對(duì)巨噬細(xì)胞樣細(xì)胞系THP-1中KDM6B表達(dá)的影響。與MDA-MB-231懸浮共培養(yǎng)48小時(shí)后，THP-1細(xì)胞中的KDM6B水平顯著降低，源自MDA-MB-231的條件培養(yǎng)基(CM)抑制了THP-1細(xì)胞中KDM6B的表達(dá)，表明乳腺*細(xì)胞分泌的一種因子是造成這種效應(yīng)的原因。miRNA參與填充**微環(huán)境的不同細(xì)胞類型之間的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。因此，試圖確定miRNA是否有助于KDM6B表達(dá)的調(diào)節(jié)。為此進(jìn)行了生物信息學(xué)分析和文獻(xiàn)綜述，確定靶向KDM6B3'-UTR的miRNA。確定了miR-138-5p、miR-146a和miR-20a-3p作為候選miRNA。當(dāng)我們分析與MDA-MB-231細(xì)胞共培養(yǎng)后THP-1細(xì)胞中miRNA水平的變化時(shí)，發(fā)現(xiàn)miR-138-5p和miR-146a顯著增加，而miR-20a-3p減少。 外泌體標(biāo)書
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)