3）LINC00926通過(guò)抑制乳腺*細(xì)胞中PGK1的表達(dá)來(lái)抑制糖酵解
由于PGK1是一種關(guān)鍵的糖酵解酶，而LINC00926被鑒定為負(fù)調(diào)控PGK1的lncRNA，我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導(dǎo)的乳腺*細(xì)胞增殖抑制中發(fā)揮作用。我們測(cè)試了LINC00926對(duì)葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成的調(diào)節(jié)作用。結(jié)果表明，LINC00926降低了葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成(圖3A)。在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中，PGK1的表達(dá)逆轉(zhuǎn)了這些作用。LINC00926還顯示出細(xì)胞外酸化率下降(圖3B和3C)。PGK1在LINC00926轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中重新表達(dá)挽救了這些效果。在PGK1敲低的MDA-MB-231或MCF-7細(xì)胞中敲低LINC00926對(duì)糖酵解表型沒(méi)有影響(圖3D-3F)，表明LINC00926通過(guò)PGK1抑制糖酵解表型。綜上所述，LINC00926通過(guò)抑制乳腺*細(xì)胞中PGK1的表達(dá)來(lái)抑制糖酵解。 英拜生物提供專業(yè)的編輯潤(rùn)色團(tuán)隊(duì)保證服務(wù)到文章接收為止。蛋白組學(xué)科研免費(fèi)設(shè)計(jì)
為了探討HCC細(xì)胞系中不同miR-106b-5p表達(dá)水平對(duì)TET1和TET2表達(dá)的影響，作者分別在Huh-7細(xì)胞系中過(guò)表達(dá)miR-106b-5p，在HCCLM3細(xì)胞系中對(duì)miR-106b-5p進(jìn)行敲低處理，結(jié)果顯示，miR-106b-5p在Huh-7細(xì)胞系中上調(diào)***抑制TET1和TET2mRNA和蛋白水平。熒光素酶報(bào)告試驗(yàn)顯示野生型熒光活性***低于對(duì)照組。接下來(lái)，作者檢測(cè)了5hmC和5-mC水平的變化來(lái)評(píng)估m(xù)iR-106b-5p是否可以通過(guò)靶向TET基因和調(diào)節(jié)5hmC水平來(lái)重塑表觀遺傳。正如所料，Huh-7/miR-106b-5p-OE細(xì)胞的5hmC水平低于hu-7/Control細(xì)胞，在HCCLM3細(xì)胞系中抑制miR-106b-5p明顯提高了5hmC的水平，但5-mC的水平?jīng)]有改變。CircMEMO1充當(dāng)miR-106b-5p海綿在HCC細(xì)胞中發(fā)揮生物學(xué)功能，作者進(jìn)一步檢測(cè)了不同CircMEMO1水平的HCC細(xì)胞中TET1、TET2蛋白表達(dá)和gDNA5hmC水平的變化。結(jié)果顯示，下調(diào)CircMEMO1降低了Huh-7細(xì)胞系中TET1和TET2蛋白的表達(dá)和gDNA5hmC的水平，而過(guò)表達(dá)CircMEMO1則增加了HCCLM3細(xì)胞系中TET1和TET2的表達(dá)和gDNA5hmC的水平。這些數(shù)據(jù)表明CircMEMO1可以充當(dāng)miR-106b-5p海綿，調(diào)節(jié)肝*細(xì)胞的TET/5hmc軸。cancer科研省自然科學(xué)基金思路是您的操作我們來(lái)做。
tRNA衍生的小RNA (tDRs)***分布于血液和尿液等人體組織中，在**的進(jìn)展中發(fā)揮著重要作用。然而，tDRs在結(jié)直腸*(CRC)血漿中的表達(dá)及其潛在的診斷價(jià)值尚未得到系統(tǒng)的探討。目前有作者發(fā)現(xiàn)血漿中5'-tRF-GlyGCC的表達(dá)水平是一種很有前景的CRC診斷生物標(biāo)志物，該研究于2021年2月發(fā)布在《Genome Medicine》，IF：10.675。
大腸*CRC和健康志愿者HC血漿中tDRs的表達(dá)譜
為了研究tDRs在CRC和HC血漿中的表達(dá)譜，作者使用小RNA高通量測(cè)序分析了3名CRC和3名HC受試者血漿樣本中10-50bp范圍內(nèi)的小RNA(smRNA)。分析表明，在HCs和CRC血漿中，tDRs的豐度按5’-tRF>5’-half/i-tRF>3’-tRF>3’-half的順序降低。此外，大腸*血漿中5-tRF的比例***高于HCs，表明5’-tRF可能參與大腸*的發(fā)生和進(jìn)展。進(jìn)一步分析單個(gè)tDR譜的表達(dá)。分層聚類顯示HCs和HCs之間血漿中tDR表達(dá)存在系統(tǒng)性差異，分別在CRC和HCs中獲得628和745個(gè)tDR。進(jìn)一步分析CRC和HC血漿中5-tRFs的差異。結(jié)果顯示，CRC血漿中的5'-tRF譜與HC血漿中的5’-tRF譜有較大差異。
PTEN缺陷改變了多個(gè)細(xì)胞周期檢查點(diǎn)，可能留下更少的時(shí)間進(jìn)行DNA損傷修復(fù)和/或染色體分離。細(xì)胞周期的進(jìn)展需要幾個(gè)分子過(guò)程的完美執(zhí)行，以確保一個(gè)熟練的，無(wú)錯(cuò)誤的，細(xì)胞分裂。這些事件發(fā)生的速度由周期蛋白依賴激酶(CDKs)的活性決定，CDKs磷酸化關(guān)鍵底物以促進(jìn)DNA合成和有絲分裂進(jìn)程。CDKs的催化活性受細(xì)胞周期檢查點(diǎn)的調(diào)控，這些檢查點(diǎn)監(jiān)測(cè)細(xì)胞周期中主要事件的有序執(zhí)行。檢查點(diǎn)**了故障安全機(jī)制，它確保只有在滿足的比較好情況下才允許細(xì)胞分裂。所有生物體都需要通過(guò)細(xì)胞分裂周期進(jìn)行適當(dāng)?shù)幕蚪M維護(hù)，以確保正常生殖、發(fā)育和預(yù)防包括**在內(nèi)的各種疾病。DNA損傷可由內(nèi)源性過(guò)程引起，如DNA復(fù)制過(guò)程中偶爾引入的DNA不匹配，拓?fù)洚悩?gòu)酶I和拓?fù)洚悩?gòu)酶II活性失效導(dǎo)致的DNA鏈斷裂，或由正常代謝副產(chǎn)品產(chǎn)生的ROS攻擊DNA。外源性來(lái)源主要包括誘變化學(xué)品、紫外線和電離輻射(IR)。細(xì)胞周期檢查點(diǎn)能夠檢測(cè)DNA損傷，提示其存在，并***延緩細(xì)胞周期進(jìn)程的通路，修復(fù)DNA損傷，或通過(guò)誘導(dǎo)細(xì)胞死亡來(lái)消除基因不穩(wěn)定細(xì)胞。尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。
Nup62 OE或?qū)φ展壌竽X的可溶性-不可溶性分選顯示，與對(duì)照相比，Nup62在運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中表達(dá)的上調(diào)***增加了不溶性，從而改變了Tbph的可溶性(圖4F和G)，表明Nup62水平是Tbph溶解度的重要決定因素。qPCR證實(shí)了Nup62的過(guò)表達(dá)(圖4H)。NUP62與內(nèi)源性TDP-43共聚合(圖4I)。與單獨(dú)mRuby相比，NUP62在HEK293T細(xì)胞中的表達(dá)導(dǎo)致TDP-43的溶解性***改變(圖4J和K）。檢測(cè)了nup62介導(dǎo)的TDP-43聚集物在HEK293T細(xì)胞中是否被磷酸化。內(nèi)源性與NUP62-mRuby共定位的TDP-43聚集體被磷酸化(圖4L)。英拜可解放您的雙手釋放您的時(shí)間。代謝組學(xué)科研創(chuàng)新服務(wù)
Caspase-11介導(dǎo)的肝細(xì)胞焦亡促進(jìn)非酒精性脂肪性肝炎的進(jìn)展。蛋白組學(xué)科研免費(fèi)設(shè)計(jì)
與對(duì)照組相比，乳腺*來(lái)源的外泌體miR-138-5p降低了M1相關(guān)表型，相反，M2標(biāo)志物增加并伴隨著CD163陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)的增加（圖6G-I）。用從乳腺*細(xì)胞中分離出來(lái)的外泌體處理THP-1細(xì)胞導(dǎo)致了M2極化，抑制miR-138-5p的表達(dá)可挽救這種極化（圖4J-L）?？傊?，這些結(jié)果表明外泌體miR-138-5p通過(guò)抑制KDM6B表達(dá)調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化。
5、KDM6B去甲基化酶活性增加了M1相關(guān)基因的表達(dá)
抑制KDM6B的組蛋白去甲基化酶活性可抑制其靶基因的轉(zhuǎn)錄。因此，使用雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)來(lái)分析M1靶基因的啟動(dòng)子活性。KDM6B的過(guò)表達(dá)特異性地刺激了促炎因子IL-6、IL-1β和TNF-α編碼基因的啟動(dòng)子活性（圖5A）。相反，沉默KDM6B活性則導(dǎo)致他們的啟動(dòng)子活性抑制，而過(guò)表達(dá)KDM6B降低了H3K27me3的水平（圖5B）。ChIP檢測(cè)顯示，與對(duì)照相比，THP-1細(xì)胞中KDM6B的過(guò)表達(dá)或敲除***增加或減少了KDM6B啟動(dòng)子在不同區(qū)域的占用(圖5C-D)。與此結(jié)果一致，啟動(dòng)子區(qū)域H3K27me3的募**降低或增加當(dāng)KDM6B過(guò)表達(dá)或沉默時(shí)（圖5E-F）?？傊?，下調(diào)KDM6B可提高H3K27me3水平和促炎因子編碼基因的轉(zhuǎn)錄活性，導(dǎo)致抑制M1極化。 蛋白組學(xué)科研免費(fèi)設(shè)計(jì)
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1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)