創(chuàng)傷性腦損傷(TBI)是世界范圍內(nèi)**常見的死亡和殘疾原因之一。事實上,創(chuàng)傷性腦損傷導致的繼發(fā)性損傷可導致長期的神經(jīng)和神經(jīng)精神后遺癥,包括神經(jīng)退行性疾病,如肌萎縮性脊髓側(cè)索硬化癥(ALS)、阿爾茨海默病(AD)和帕金森病。TBI還與慢性創(chuàng)傷性腦病(CTE)的發(fā)展有關,CTE是一種與反復頭部創(chuàng)傷相關的進行性神經(jīng)退行性綜合征。反復創(chuàng)傷患者(如CTE)的死后腦組織以及創(chuàng)傷性腦損傷動物模型顯示微管相關蛋白(TAU)和TAR DNA/RNA結合蛋白(TDP-43)病理變化。TDP-43病理是神經(jīng)退行性變的標志,在~ 97%的ALS病例、~ 45%的額顳葉癡呆(FTD)病例和~ 60%的AD病例中均有TDP-43表現(xiàn)。盡管有證據(jù)表明TDP-43病理作為神經(jīng)退行性變的生物標志物,但仍不清楚重復創(chuàng)傷如何促進TDP-43蛋白病。代謝變化被認為是腸病**重要的特征之一。河南科研實驗外包
急性髓系白血病(AML)是一種基因和生物學上的異質(zhì)性疾病,其特征是克隆擴增和突變的造血干細胞和祖細胞分化受損。在AML**常見的驅(qū)動突變中,NPM1基因第12外顯子的4堿基對插入是穩(wěn)定的,在20%-30%的病例中發(fā)生。由于其生物學意義和預后影響,NPM1突變在世界衛(wèi)生組織(WHO)的髓性白血病分類中**了一個獨特的白血病實體,并在預后和***決策中發(fā)揮重要作用。NPM1突變通常與誘導和鞏固化療后患者生存的良好影響相關。在NPM1突變的AML中,F(xiàn)LT3-ITD突變經(jīng)常與DNMT3A突變同時發(fā)生,這本身與接受標準誘導***的患者預后更差有關。大多數(shù)關于NPM1突變的AML的研究都集中在其他突變的同時發(fā)生,而突變型NPM1患者基因表達水平的異質(zhì)性及其生物學意義尚未得到***研究。黑龍江科研國家自然科學基金FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉(zhuǎn)移。
此外,流式細胞儀分析證實,第 7 天胰腺中CD11b + F4/80 + CD206 +巨噬細胞顯著減少,這與免疫熒光數(shù)據(jù)一致。在總 CD11b +單核細胞/巨噬細胞中,成熟巨噬細胞 (F4/80 + MHCII hi ) 減少,而未成熟巨噬細胞 (F4/80 mid MHCII - ) 在第 7 天增加,此時胰腺巨噬細胞在 ADM 階段(第 3 天)短暫消耗。F4/80 mid MHCII -巨噬細胞表達更高水平的 CCR2 和 TNFα,表明它們與炎癥單核細胞(CD11b + Ly6C hi CCR2 +)分化并可能導致組織損傷。上述結果表明,ADM期胰腺巨噬細胞的耗竭(以M2樣表型為主),將觸發(fā)炎性單核細胞再次流入胰腺,從而在第7天造成組織損傷。
Lnc-LEMGC是胃*轉(zhuǎn)移相關的lncRNA
與無LNM的胃*組織相比,有LNM的胃*組織中有五種表達***上調(diào),其他五種表達***下調(diào)。為了驗證微陣列分析結果,通過定量PCR(qPCR)證實uc001pqq.1過度表達,而在LNM胃*組織中AK095500、AK021443和ENSTZ0 00 03 98 098的表達降低。作者選擇AK095500(lnc-LEMGC)進行進一步研究。在90例具有***臨床病理參數(shù)的原發(fā)性胃**中測定了lnc-LEMGC的表達水平。在轉(zhuǎn)移性胃*組織中,Lnc-LEMGC表達下調(diào)10.7倍,因此,Lnc-LEMGC表達降低與胃*轉(zhuǎn)移潛能相關。在胃細胞系中也檢測了lnc-LEMGC的表達水平,表明lnc-LEMGC在高轉(zhuǎn)移人胃*細胞系SGC7901中的表達逐步增加,然后是低轉(zhuǎn)移細胞系AGS、KATOII、MKN45、MGC803、BGC823。低lnc-LEMGC表達與LNM陽性(P<0.0001)、遠處轉(zhuǎn)移陽性(P=0.0032)和AJCC分期(P=0.0333)密切相關。此外,Kaplan-Meier分析顯示lnc-LEMGC過表達與生存期更長有關。單分子RNA熒光原位雜交顯示lnc-LEMGC主要分布在細胞核中,核/細胞質(zhì)分離證實了這一點。因此,低水平的lnc-LEMGC可作為胃*患者**zzzzzzzz轉(zhuǎn)移或預后較差的預測因子。 促進胰腺*的生長和轉(zhuǎn)移。
5)circPDE4B和RIC8A調(diào)控軟骨細胞中的p38信號通路
為了闡明RIC8A下游的信號通路,我們研究了RIC8A敲低的HCs中MAPKs、NF-κB和mTOR的磷酸化水平。兩種RIC8AshRNA***降低了p38的磷酸化水平(圖5A)。然后用信號分子抑制劑對HCs進行預處理,包括ERK1/2抑制劑、p38抑制劑和JNK抑制劑,然后是RIC8A過表達。經(jīng)過p38MAPK抑制劑預處理的RIC8A過表達抑制了OA,然而,ERK或JNK抑制劑對其沒有影響(圖5B)。此外,***RIC8AshRNA或過表達腺病毒后,p38MAPK的磷酸化及其定位發(fā)生了異常調(diào)節(jié)(圖5C-E)。這些結果表明,RIC8A在軟骨細胞中通過p38信號通路發(fā)揮作用。接下來我們研究了circPDE4B在OA中調(diào)控p38信號通路中的作用。circPDE4B過表達降低,而circPDE4B敲低***p38MAPK信號,同時p38磷酸化和核轉(zhuǎn)位(圖5F-H)。然后我們進行了拯救試驗。如圖5I-K所示,RIC8A過表達挽救了過表達circPDE4B誘導的p38信號通路的下調(diào),而抑制RIC8A挽救了敲除circPDE4B誘導的p38信號通路的***,以及p38的磷酸化和核易位?;谶@些發(fā)現(xiàn),circPDE4B-RIC8A軸在調(diào)節(jié)軟骨細胞下游p38MAPK信號通路中發(fā)揮重要作用。 上海英拜生物設有專業(yè)的武漢技術中心。廣東科研免費設計
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六、多組學方法分析表征近端小管細胞子集
Cicero研究了從PT到PT_VCAM1轉(zhuǎn)變過程中染色質(zhì)可及性的變化。VCAM1和TPM1轉(zhuǎn)錄增加(圖6a)與VCAM1基因體和啟動子區(qū)域染色質(zhì)可及性增加相關(圖6b,c)。同樣,SLC5A12和SLC4A4轉(zhuǎn)錄降低(圖6c)與染色質(zhì)可及性降低相關(圖6c,補充圖15)。通過評估chromVAR轉(zhuǎn)錄因子的活性,我們發(fā)現(xiàn)了可能調(diào)節(jié)近端小管和PT_VCAM1之間過渡的轉(zhuǎn)錄因子。有趣的是,近端小管顯示出強大的HNF4A活性,該活性在PT_VCAM1簇中降低,并與增加的REL和RELA活性相一致(圖6d)。我們在PT_VCAM1細胞核中驗證了減少的HNF4A蛋白表達(圖6e)。我們從VCAM1基因體中鑒定出一個約60kb的開放染色質(zhì)區(qū)域,該區(qū)域包含一個與VCAM1啟動子相互作用的RELA基序(通過ciscoaccessibilitynetwork)。實際上,ChIP-qPCR擴增了該位點,使其能夠與RELA結合(圖6f,補充圖17b),為該細胞類型中RELA調(diào)控VCAM1表達提供了實驗證據(jù)。 河南科研實驗外包
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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗