陜西科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2021-12-02

越來(lái)越多的證據(jù)表明,circRNAs作為功能性RNA在各種**中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。然而,大多數(shù)circRNA參與食管鱗狀細(xì)胞*(ESCC)的機(jī)制仍未明確,其介導(dǎo)的分子機(jī)制也大多不清楚。小編給大家分享2021年7月發(fā)表于“CELL DEATH & DISEASE”(IF=8.469)的文章“Circular RNA hsa_circ_0000277 sequesters miR-4766-5p to upregulate LAMA1 and promote esophageal carcinoma progression”。在這里,我們篩選了circRNA在ESCC組織中的表達(dá)譜,發(fā)現(xiàn)與正常對(duì)照組相比,hsa_circ_0000277(稱為circPDE3B)在ESCC組織和細(xì)胞系中的表達(dá)***增加。circPDE3B在ESCC患者中的高表達(dá)與晚期TNM分期和預(yù)后不佳相關(guān)。功能實(shí)驗(yàn)表明,circPDE3B在體外和體內(nèi)均能促進(jìn)ESCC細(xì)胞的發(fā)生和轉(zhuǎn)移。circPDE3B可以作為ceRNA,通過(guò)miR4766-5p來(lái)消除對(duì)LAMA1的抑制作用。此外,LAMA1在ESCC組織中***上調(diào),并與侵襲性致*表型呈正相關(guān)。更重要的是, circPDE3B在ESCC中的致*作用部分依賴于miR-4766-5p/LAMA1軸。生物信息學(xué)分析結(jié)合驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)表明,上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)***參與了circPDE3B-miR-4766-5p /LAMA1軸在ESCC中的致*功能。


文章檢測(cè)了小鼠腸系膜淋巴結(jié)(MLN)中的Th17細(xì)胞(與結(jié)腸炎癥密切相關(guān))。陜西科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

5)M1-Exos通過(guò)傳遞miR-155加重了EndoMT

為了研究外泌體miR-155在SCI后M1-Exos介導(dǎo)的BSCB破壞惡化中的作用,構(gòu)建miR-155過(guò)表達(dá)(miR-155OE)和敲低(miR-155KD)BMDMs,然后分離外泌體并處理bEnd.3細(xì)胞。如圖5A和B所示,miR-155OE-Exos組TEER值***降低,通透性***增加,而miR-155KD-Exos組則相反。加入miR-155OE-Exos后,ZO-1和Occludin的熒光強(qiáng)度明顯降低,而miR-155KD-Exos處理后,ZO-1和Occludin的表達(dá)***增強(qiáng)(圖5C和D)。此外,westernblot檢測(cè)TJs蛋白的表達(dá),結(jié)果與上述討論的結(jié)果相似(圖5E)。miR-155OE-Exos可促進(jìn)細(xì)胞形態(tài)轉(zhuǎn)化,其分支更少,體細(xì)胞更長(zhǎng)。miR-155KD-Exos處理后的結(jié)果則相反(圖5F)。miR-155OE-Exos暴露后,I型膠原蛋白、III型膠原蛋白和α-SMA蛋白水平上調(diào),CD31蛋白水平下調(diào),而miR-155KD-Exos作用相反(圖5G)。以上結(jié)果表明,外泌體miR-155在促進(jìn)bEnd.3細(xì)胞的EndoMT中起著至關(guān)重要的作用。 寧夏科研服務(wù)價(jià)格Th1/Th2細(xì)胞失衡也是結(jié)腸炎的一個(gè)重要特征。

生物標(biāo)志物是生物體中可測(cè)量的物質(zhì)或特征,它指示某些現(xiàn)象,例如狀況,疾病,飲食,干預(yù)措施或環(huán)境暴露。在這方面,生物標(biāo)記物可分為三種類型:(i)分子(化學(xué)物質(zhì),蛋白質(zhì)或基因),(ii)細(xì)胞(細(xì)胞類型,細(xì)胞形態(tài),組織組織學(xué))或(iii)成像(X射線,CT) ,PET或MRI功能)。生物標(biāo)記物類型的選擇在很大程度上取決于所研究的現(xiàn)象和所研究的生物系統(tǒng)。在醫(yī)學(xué)中,生物標(biāo)志物的主要目的是診斷,預(yù)后或預(yù)測(cè)疾病。它們還可以用于評(píng)估藥物,***,污染物,食物或其他攝入物質(zhì)的暴露。

tiRNA-Gly通過(guò)RBM17調(diào)節(jié)增殖或遷移相關(guān)基因的選擇性剪接

由于RBM17是一種參與mRNA選擇性剪接的剪接體蛋白,研究tiRNA-Gly在與RBM17結(jié)合時(shí)是否調(diào)節(jié)下游基因的選擇性剪接將是一項(xiàng)有趣的研究。對(duì)過(guò)表達(dá)tiRNA-Gly后的K1細(xì)胞系進(jìn)行RNA測(cè)序,所有的選擇性剪切事件如6A所示,外顯子跳躍(cassette外顯子)占37.67%,A5SSs剪接占6.78%,A3SSs剪接占4.99%,備選***外顯子(AltStart)剪接占18.19%,備選末端外顯子(AltEnd)剪接占18.74%,互斥事件(MEXs)占5.12%,內(nèi)含子保留剪接(IR)占8.51%。外顯子跳躍顯然是tiRNA-Gly誘導(dǎo)的**頻繁的選擇性剪接事件。MAP4K4、POSTN、HACE1、DPP9和BRCA1是外顯子跳躍導(dǎo)致表達(dá)變化比較大的基因。tiRNA-Gly誘導(dǎo)了MAK4K4第16外顯子的跳躍,POSTN第21外顯子的跳躍,HACE1第8外顯子的跳躍,DPP9第21外顯子的跳躍和BRCA1第13外顯子的跳躍(圖6B)。如圖6C-D所示,升高的tiRNA-Gly誘導(dǎo)了MAP4K4一個(gè)截?cái)嘈?NM_4834.4)的mRNA水平,降低了一個(gè)長(zhǎng)型(NM_1242560.1)的mRNA水平,而下調(diào)的RBM17則起相反的作用。重要的是,RBM17的敲除阻斷了由tiRNA-Gly誘導(dǎo)的MAP4K4截?cái)嘧凅w(NM_4834.4)的增加,表明tiRNA-Gly誘導(dǎo)的選擇性剪接依賴于RBM17。 英拜提供分子生物學(xué)以及免疫病理相關(guān)實(shí)驗(yàn)。

    公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(CTD,/)是一個(gè)創(chuàng)新的數(shù)字生態(tài)系統(tǒng),它將化學(xué)品、基因、表型、疾病和暴露的毒理學(xué)信息聯(lián)系起來(lái),以促進(jìn)對(duì)人類健康的了解。整合了基于文獻(xiàn)、人工策劃的交互,以創(chuàng)建一個(gè)知識(shí)庫(kù),協(xié)調(diào)跨物種異質(zhì)數(shù)據(jù)的化學(xué)暴露及其生物影響。在這兩年一次的更新中,報(bào)告CTD的含量增加了20%,現(xiàn)在提供了4500萬(wàn)個(gè)毒性基因組關(guān)系,涉及600個(gè)比較物種的16300多種化學(xué)品、51300個(gè)基因、5500種表型、7200種疾病和163000次暴露事件。此外,通過(guò)CTD疾病頁(yè)面上的新數(shù)據(jù)選項(xiàng)卡(幫助填補(bǔ)環(huán)境健康方面的知識(shí)空白)和新的表型搜索參數(shù)(用于批量查詢和維恩分析工具),增加了化學(xué)表型內(nèi)容的功能。此外,還介紹了新的CTD解剖學(xué)頁(yè)面,允許用戶從解剖學(xué)角度獨(dú)特地探索和分析化學(xué)-表型相互作用。 **近科研技術(shù)的開發(fā)。海南科研贈(zèng)送提供技術(shù)路線

評(píng)估了成對(duì)*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達(dá)。陜西科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

在與轉(zhuǎn)染sh陰性對(duì)照(CoshCtrl)的PANC-1細(xì)胞共培養(yǎng)過(guò)程中,與轉(zhuǎn)染shROR (CoshROR)相比,成熟脂肪細(xì)胞表現(xiàn)出脂滴明顯減少,細(xì)胞外觀呈拉長(zhǎng)狀,類似成纖維細(xì)胞的形態(tài)。為了確定外泌體linc-ROR誘導(dǎo)脂肪細(xì)胞脫分化的機(jī)制,采用western blot和實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析PID 11不同實(shí)驗(yàn)條件下脂肪細(xì)胞的基因表達(dá)水平。正如預(yù)期的那樣,在一些成熟的脂肪細(xì)胞特異性標(biāo)記物,如葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)體-4 (GLUT4)、增殖***受體γ (ppar)和***敏感脂肪酶(HSL)的表達(dá)方面,我們觀察到,與CoshROR或單個(gè)脂肪細(xì)胞(PBS-Adi)組相比,CoshCtrl組明顯降低了它們的表達(dá)水平。此外,還檢測(cè)了一些成纖維細(xì)胞特異性基因的表達(dá)水平,如α平滑肌肌動(dòng)蛋白(α-SMA)、基質(zhì)金屬蛋白酶11 (MMP11)和膠原蛋白I。共培養(yǎng)6天后其表達(dá)水平***升高,進(jìn)一步支持脂肪細(xì)胞向成纖維細(xì)胞樣細(xì)胞的脫分化過(guò)程。陜西科研分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。

3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序

5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)