CRC細胞外泌體的表征
作者分離從CRC細胞表面脫落的各種囊泡，通過電子顯微鏡、納米顆粒大小電位分析和蛋白質印跡鑒定外泌體。為了確定外泌體是否可以被CRC細胞內化，用熒光染料PKH67標記外泌體，然后將它們與SW480細胞共培養(yǎng)，結果顯示SW480細胞表現(xiàn)出高吸收效率。與PKH67標記的外泌體孵育24小時后，超過90%的SW480細胞對PKH67熒光呈陽性，表明外泌體被SW480細胞內化。
轉移性CRCSW620細胞分泌的外泌體促進CRC細胞的遷移、侵襲和EMT
作者使用細胞系SW480和SW620作為實驗模型，通過CCK-8在24小時、48小時和72小時測定細胞活力。結果表明，SW480-exo或SW620-exo細胞對細胞生長沒有顯著影響。此外，平板集落形成分析顯示SW480-exo或SW620-exo細胞之間的生長沒有差異。然而，來自轉移性CRCSW620細胞的外泌體通過Transwell測定顯著促進了SW480細胞的遷移和侵襲。此外，與SW480-exo和對照組相比，SW620-exo提高了SW480細胞的傷口愈合能力。蛋白質印跡分析以確定與EMT相關的蛋白質的表達水平。結果表明，相對于SW480-exo處理，SW620-exo處理顯著增加波形蛋白、纖連蛋白和N-鈣粘蛋白的表達并降低E-鈣粘蛋白的表達，表明源自轉移性CRC細胞的外泌體在SW480中誘導了EMT。 circNDUFB2過表達影響934個基因的表達水平。大連細胞功能標書
2）整合單核RNA和ATAC數據集，用于預測和驗證ATAC細胞類型分配
snATAC-seq捕獲單個細胞的染色質可及性特征。相對而言，我們對細胞類型特異性染色質可及性圖譜的了解較少;因此，我們利用注釋snRNA-seq數據集使用標簽轉移來預測使用Seurat的snATAC-seq細胞類型。標簽轉移是通過從snATAC-seq數據創(chuàng)建一個基因活性矩陣來進行的，這是一種衡量蛋白編碼基因的基因體和啟動子內染色質可及性的方法。在參考snRNA-seq數據集和查詢基因活性矩陣之間識別轉移錨點，然后分配預測的細胞類型。snATAC-seq預測分數的分布表明，絕大多數細胞具有較高的預測分數，并被自信地劃分為單細胞類型(補充圖2)。 武漢TRF標書FMT處理可恢復SCI小鼠中糞便短鏈脂肪酸(SCFAs)。
第三步：上傳附加文件（可以選擇性上傳）
附加文件中可以包括平臺、批次等信息。 例如，在平臺列中，“1”表示數據來自 Affymetrix U133 plus2 平臺，“2”表示來自安捷倫微陣列芯片的數據，“3”表示來自 Illumina Hiseq 2000 的數據等。
第四步：填寫電子郵箱（選填，建議填寫）
如果填寫郵箱，結果會以郵件形式發(fā)送至該郵箱。
第五步：提交
數據文件全部上傳后，點擊“Submit”進行提交，頁面會自動跳轉至結果頁。也可以根據頁面給出的jobID查詢結果。
結果頁面如下：
總而言之，我們可以使用Rank-In對**的芯片和 RNA-seq中的混合數據進行綜合轉錄組學分析。
與HuR的RRM3結合，中斷HuR-β-actinmRNA相互作用，抑制β-actin表達，抑制OPC遷移
為闡明lnc-PMIF如何與HuR相互作用調節(jié)β-actin表達和OPC遷移，首先通過生物信息學分析預測了lnc-PMIF的二級結構，并合成生物素化的全長lnc-PMIF（WT）和截短的lnc-PMIF突變體，分別為突變體A1（無5’莖環(huán)的正義）、突變體A2（有中心莖環(huán)和3’莖環(huán)的正義）和突變體A3（*有3’莖環(huán)的正義1100-1455bp），轉染MC3T3-E1細胞，并進行標記RNA鏈霉親和素下拉試驗。蛋白免疫印跡分析顯示，HuR存在于轉染WTlnc-PMIF、截短lnc-PMIF突變體A1或截短lnc-PMIF突變體A2的細胞的下拉部分中，但在轉染截短lnc-PMIF突變體A3的細胞的下拉部分中不存在。這些數據表明，lnc-PMIF的中心莖環(huán)足以實現(xiàn)lnc-PMIF和HuR之間的相互作用。 FMT處理***增加了SCI小鼠腸道菌群的豐富度。
miR-101-3p的納米載體抑制**生長
基于上述研究事實，作者專注于利用這種納米載體來攜帶miR-101-3pmimics，并在體內*****實驗中探究其***效果。將**細胞皮下注射到裸鼠體內，處理4周，然后用含有miR-101-3pmimic、miR-101-3pinhibitor或NC的納米載體通過尾靜脈注射給裸鼠***。裝載miR-101-3pmimic的納米載體***抑制了**的生長和體積，而裝載miR-101-3pinhibitor的納米載體則***促進了**的生長和體積。此外，miR-101-3p的表達支持了上述結果，在miR-101-3pmimic的納米載體組上調，在miR-101-3pinhibitor的納米載體組下調。 FMT可能通過***IL-1β/ NF-κB信號通路來緩解神經炎癥。MCD誘導標書廣州
異丁酸含量與BMS評分/ FITC -葡聚糖滲透性之間的相關性無統(tǒng)計學意義。大連細胞功能標書
五、阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配
研究了磷脂酰肌醇3,4,5磷酸(PIP3)在DNA損傷后的細胞定位。將MCF10A細胞按上述方法同步輻照，免疫熒光法分析PTEN的亞細胞分布。PTEN-WT和PTEN-398A蛋白在細胞核和質膜穩(wěn)定定位(圖6A, B)。經過IR處理后，PTEN-WT在質膜上積累(圖6A, B)。相比之下，在這些條件下，沒有檢測到PTEN-398A蛋白的重新定位(圖6A, B)。B).我們通過細胞分離和膜相關PTEN的免疫印跡分析進一步證實了這些結果(圖6C, D)。這些結果表明，ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布，這與AKT通路***減少有關 大連細胞功能標書
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1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗