外泌體circ_0072083與膠質(zhì)瘤患者的TMZ耐藥、診斷和生存有關(guān)
為了分析外泌體 circ_0072083 在膠質(zhì)瘤患者中的價值,從患者的血清樣本中分離外泌體。通過 TEM 和特定標記物(CD63、CD81 和 TSG101)驗證外泌體。此外,大小主要在100-200 nm,并且在耐藥患者中其濃度更高。此外,與TMZ敏感患者(n ?=33)相比,TMZ耐藥患者(n =36)的外泌體circ_0072083水平顯著上調(diào)。此外,通過將這些外泌體暴露于不同條件來評估外泌體 circ_0072083 的穩(wěn)定性,結(jié)果表明 TMZ 耐藥患者中外泌體 circ_0072083 的豐度不受不同孵育時間和不同 pH 值的顯著影響。此外,外泌體 circ_0072083 可以作為神經(jīng)膠質(zhì)瘤的**診斷靶標(AUC= 0.85,P ?< 0.05),并且外泌體 circ_0072083 水平高的患者總生存率較低(P ?< 0.05)。?根據(jù)平均水平將患者分為高(n ?= 36)或低(n = 33)外泌體circ_0072083組。桌子表格11總結(jié)出高外泌體circ_0072083水平與膠質(zhì)瘤患者的**大小、晚期WHO分級、MGMT甲基化和TMZ抗性相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)表明外泌體circ_0072083在神經(jīng)膠質(zhì)瘤患者中具有重要作用。這表明外泌體circ_0072083可以通過在Warburg效應下調(diào)節(jié)ALKBH5介導的去甲基化來調(diào)節(jié)miR-1252-5p/NANOG軸來增加膠質(zhì)瘤中的TMZ抗性。 英拜在全國各省會城市均有自己的**客戶。收縮壓科研省自然科學基金
CD8+T細胞是**重要的**適應性免疫調(diào)節(jié)細胞,通過直接殺死*細胞來介導抗**免疫。PD-1抑制***CD8+T細胞以增加T細胞***,從而導致**消退。因此,CD8+T細胞的***可能是通過免疫療法***LSCC的關(guān)鍵。這篇文章以生信分析開篇,篩選出關(guān)鍵基因后在動物模型與臨床樣本中進行了簡單的驗證。實驗思路如下:
1.下載GEO數(shù)據(jù)并進行數(shù)據(jù)篩選下載數(shù)據(jù)集GSE17710,選擇變異系數(shù)>0.1的5000個基因進行后續(xù)WGCNA分析2.CIBERSORT分析免疫浸潤分析獲得每個樣本中22種免疫細胞的豐度,選擇T細胞作為WGCNA分析的性狀**(其中,T細胞包括7中亞型)3.WGCNA構(gòu)建基因網(wǎng)絡使用R包“WGCNA”對5000個WGCNA分析,構(gòu)建LSCC基因共表達網(wǎng)絡,軟閾值β=5(R2=0.9)構(gòu)建無標度網(wǎng)絡。動態(tài)混合切割來建立分層聚類樹,樹枝**了一系列具有相似表達數(shù)據(jù)的基因,每個樹葉**了樹上的單個基因。生成了十八個模塊。 遼寧缺氧信號通路科研Th1/Th2細胞失衡也是結(jié)腸炎的一個重要特征。
3)IGF-1信號在Pex誘導的HSC活化和肝纖維化中至關(guān)重要
為了進一步探索Pex調(diào)控HSC行為的機制,我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測序基因表達譜(圖3A)。在差異表達基因中,我們觀察到41個重疊的上調(diào)基因在Pan02exo組與Npex組和KPCexo組與Npex組之間存在部分交集(圖3B)。主要涉及的基因參與細胞外空間、細胞外區(qū)域和ECM(圖3C),表明Pex調(diào)節(jié)HSC的ECM分泌。此外,GO和KEGG通路分析顯示,IGF-1及其下游PI3K/AKT是受Pex影響的排名比較高的信號通路(圖3D,E)。westernblot分析支持了Pex***增加HSC中IGF-1R、IRS-1和AKT磷酸化的發(fā)現(xiàn)(圖3F)。當使用IGF-1R抑制劑時,Pex誘導的p-IGF-1R、p-IRS-1和p-AKT的上調(diào)被阻斷(圖3G)?;谶@些結(jié)果,我們推測IGF-1信號可能是介導Pex依賴的HSC活化的關(guān)鍵因素。與預期的一樣,IGF-1R抑制劑抑制了Pex誘導的HSC的活化、增殖和遷移(圖4A-D)。此外,IGF-1R抑制劑逆轉(zhuǎn)了Pex誘導的HSC中ECM的產(chǎn)生(圖4E)。我們的體內(nèi)實驗表明,IGF-1R抑制劑可以阻斷Pex誘導的肝纖維化(圖4F-I)。這些數(shù)據(jù)表明IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。
6、CDK4/6抑制誘導T細胞表型與免疫檢查點***的良好反應相關(guān)
在臨床小鼠模型中,CDK4/6抑制劑與ICB顯示出***的協(xié)同作用。鑒于**近的研究強調(diào)**微環(huán)境中的干細胞樣T細胞是ICB反應的關(guān)鍵介質(zhì),作者假設(shè)CDK4/6i介導的T細胞記憶誘導產(chǎn)生了更有利的T細胞池用于免疫檢查點靶向***,因此將有助于該聯(lián)合***的療效。事實上,這種CDK4/6i應答特征富集在ICB應答患者的CD8+TIL中,在單細胞和患者水平準確分為應答者和非應答者(Fig.6A-D)。這表明CDK4/6i誘導了T細胞內(nèi)基因特征,該特征與患者對ICB的良好反應相關(guān)。 英拜提供一年三節(jié)的購物卡津貼。
越來越多的證據(jù)表明細胞外囊泡(EVs)通過促進實體**中**-內(nèi)皮細胞之間的通訊來刺激血管生成。先前的研究表明miR-144是鼻咽*(NPC)細胞來源的EVs中的內(nèi)含物之一,但EVs miR-144對**內(nèi)皮細胞和血管生成的影響尚不清楚。2021年3月發(fā)表于“Molecular Therapy”(IF=11.454)的文章“miR-144 delivered by nasopharyngeal carcinoma-derived EVs stimulates angiogenesis through the FBXW7/HIF-1a/VEGF-A axis”對此展開了研究。本研究旨在探討**源性細胞外囊泡(EVs)在鼻咽*血管生成中的作用。我們初步采集鼻咽*活檢標本。外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉(zhuǎn)移。重慶腸道菌科研
代謝變化被認為是腸病**重要的特征之一。收縮壓科研省自然科學基金
細胞間的相互作用在**進展和轉(zhuǎn)移中發(fā)揮關(guān)鍵作用。目前關(guān)于這些**細胞是如何與其他細胞相互交流的仍有很多是未知的。**釋放的外泌體被認為是**進行細胞間溝通的有效介質(zhì)。Dong等探索了肝細胞*(HCC)外泌體在其轉(zhuǎn)移和預后價值中的功能。本文于2021年6月發(fā)表在《Signal Transduction and Targeted Therapy》期刊上,IF:13.493。
1、外泌體的分離與鑒定以及HCC細胞的釋放和吸收
使用投射電子顯微鏡觀察了外泌體的形態(tài)和形狀;納米粒子**分析發(fā)現(xiàn)外泌體直徑在40-200nm之間,并且在6個HCC細胞系外泌體中都檢測到了外泌體標志物CD63,CD9,和Alix的表達;然后使用DIO標記高轉(zhuǎn)移性HCC細胞的外泌體(HMH-exo)和低轉(zhuǎn)移性HCC細胞外泌體(LMH-exo),在激光掃描共焦顯微鏡下觀察到綠色標記的HMH-exo和LMH-exo都可以被低轉(zhuǎn)移性HCC細胞細胞系有效吸收(圖1)。這些結(jié)果表明已經(jīng)成功分離和純化HCC來源的外泌體并且他們可以被其它HCC細胞吸收。 收縮壓科研省自然科學基金
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗