因?yàn)镃XCL13是一種趨化劑,可以促進(jìn)表達(dá)CXCR5的細(xì)胞趨化,使用IHC染色評(píng)估其在CRC中的表達(dá),結(jié)果顯示CXCR-5在結(jié)直腸*組織中的染色強(qiáng)于正常組織,說明M2極化巨噬細(xì)胞分泌的CXCL13主要作用于CRC細(xì)胞(Fig. 7d)。PMA預(yù)處理后的THP-1細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-934 mimics,并與加入anti-CXCL13抗體或IgG的SW480細(xì)胞或RKO細(xì)胞共培養(yǎng)。此外,上述TPH-1細(xì)胞液與敲除CXCR5的細(xì)胞共培養(yǎng)。體外transwell實(shí)驗(yàn)顯示,在與miR-934過表達(dá)PMA處理的THP-1細(xì)胞的CM共培養(yǎng)組中,anti-CXCL13抗體抑制了CRC細(xì)胞的遷移和侵襲;轉(zhuǎn)染了shCXCR5的SW480和RKO細(xì)胞與miR-934過表達(dá)PMA處理的THP-1細(xì)胞共培養(yǎng)時(shí),遷移和侵襲能力降低(Fig. 7e, f)。此外,小鼠體內(nèi)肝轉(zhuǎn)移檢測(cè)表明,與對(duì)照組相比,用anti-CXCL13抗體或敲除CXCR5的CRC細(xì)胞的肝轉(zhuǎn)移菌落減少(Fig. 7g–i)。這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。江蘇陽(yáng)性神經(jīng)元科研
基序分析發(fā)現(xiàn)E2F TF基序在乙?;档拖嚓P(guān)區(qū)域***富集,在T細(xì)胞記憶驅(qū)動(dòng)因子相關(guān)基序乙?;黾?,包括含叉頭框因子(Fig. 2F)。為了確定這些變化是否伴隨著對(duì)不同細(xì)胞狀態(tài)的長(zhǎng)期表觀遺傳影響,在CDK4/6抑制后對(duì)體外活化的T細(xì)胞進(jìn)行了ATAC-seq,觀察到染色質(zhì)開放性的整體降低,T細(xì)胞記憶相關(guān)基因區(qū)域的開放性增加,包括Tcf7、Ccr7和Sell (Fig. 2G)。為了解開CDK4/6抑制后記憶和效應(yīng)特征的明顯二分法,在暴露于CDK4/6i 24h后,對(duì)體外活化T細(xì)胞進(jìn)行了單細(xì)胞RNA-seq。該分析顯示存在CDK4/6i處理后改變的不同T細(xì)胞亞群,簇2、4、5和8增加,簇0減少,以及整體G1細(xì)胞周期停滯(Fig. 2H-I)。接下來對(duì)記憶和效應(yīng)基因標(biāo)記,并使用AUCell比較富集評(píng)分,確定細(xì)胞池中不同的記憶樣和效應(yīng)樣簇(Fig. 2J)。有趣的是,CDK4/6i處理后增加的細(xì)胞簇2和5是記憶樣細(xì)胞,8是效應(yīng)樣細(xì)胞,證明CDK4/6i抑制促進(jìn)異質(zhì)T細(xì)胞池中表型不同的亞群細(xì)胞的記憶分化,增***應(yīng)功能。收縮壓科研英拜可解放您的雙手釋放您的時(shí)間。
公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(CTD,/)是一個(gè)創(chuàng)新的數(shù)字生態(tài)系統(tǒng),它將化學(xué)品、基因、表型、疾病和暴露的毒理學(xué)信息聯(lián)系起來,以促進(jìn)對(duì)人類健康的了解。整合了基于文獻(xiàn)、人工策劃的交互,以創(chuàng)建一個(gè)知識(shí)庫(kù),協(xié)調(diào)跨物種異質(zhì)數(shù)據(jù)的化學(xué)暴露及其生物影響。在這兩年一次的更新中,報(bào)告CTD的含量增加了20%,現(xiàn)在提供了4500萬個(gè)毒性基因組關(guān)系,涉及600個(gè)比較物種的16300多種化學(xué)品、51300個(gè)基因、5500種表型、7200種疾病和163000次暴露事件。此外,通過CTD疾病頁(yè)面上的新數(shù)據(jù)選項(xiàng)卡(幫助填補(bǔ)環(huán)境健康方面的知識(shí)空白)和新的表型搜索參數(shù)(用于批量查詢和維恩分析工具),增加了化學(xué)表型內(nèi)容的功能。此外,還介紹了新的CTD解剖學(xué)頁(yè)面,允許用戶從解剖學(xué)角度獨(dú)特地探索和分析化學(xué)-表型相互作用。***,用新的基于文獻(xiàn)的化學(xué)同義詞增強(qiáng)了CTD化學(xué)頁(yè)面(以改進(jìn)查詢),并添加了1600個(gè)基于氨基酸的化合物(以增加化學(xué)景觀)。總之,這些更新繼續(xù)增強(qiáng)CTD作為一個(gè)強(qiáng)大的資源,以產(chǎn)生關(guān)于環(huán)境影響疾病的病因和分子機(jī)制的可測(cè)試的假設(shè)。
隨著全球老齡化人口的逐步增長(zhǎng),研究和制定健康老齡化戰(zhàn)略的需求變得越來越重要,并呈現(xiàn)出新的緊迫性。衰老是一個(gè)復(fù)雜的過程,受遺傳和表觀遺傳調(diào)控、翻譯后調(diào)控、代謝調(diào)控、宿主-微生物組相互作用、生活方式和許多其他因素的影響。近年來,高通量組學(xué)技術(shù)(包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀基因組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、藥物基因組學(xué)和宏基因組學(xué))已廣泛應(yīng)用于衰老研究,從而對(duì)衰老相關(guān)的分子變化進(jìn)行大規(guī)模分析。因此,與衰老相關(guān)的有價(jià)值的數(shù)據(jù)量越來越大,需要一個(gè)開放和集成的數(shù)據(jù)庫(kù)來支持新的衰老研究領(lǐng)域。英拜的高通量測(cè)序服務(wù)質(zhì)量。
PTEN是一種**抑制因子,調(diào)節(jié)多種細(xì)胞功能,包括***,PI3K/AKT信號(hào)通路是PTEN通過其磷酸酶活性靶向的**重要通路之一。因此,推測(cè)PI3K/AKT信號(hào)通路可能參與CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化。WB結(jié)果顯示過表達(dá)PTEN可以部分減弱miR-934和HCT-8細(xì)胞源外泌體對(duì)p-AKT和p-PI3K表達(dá)的增強(qiáng)作用,而沉默PTEN則相反(Fig.5k)。更重要的是,當(dāng)與HCT-8細(xì)胞來源的外泌體和PI3K抑制劑(LY294002)共培養(yǎng)時(shí),PMA處理的THP-1細(xì)胞中p-AKT和M2標(biāo)記物(CD206、arginase-1和CD163)的表達(dá)下調(diào)(Fig.5l,m)。綜上所述,CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934可以通過下調(diào)PTEN表達(dá)和***PI3K/AKT信號(hào)通路誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化。Th1/Th2細(xì)胞失衡也是結(jié)腸炎的一個(gè)重要特征。重慶線粒體能量代謝芯片科研
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在整個(gè)細(xì)胞群中,2D-R和2W-R樣本之間沒有明顯的差異,這表明暴露在s-flow條件下2天或2周的細(xì)胞基本沒有變化。S-flow條件下(2D-R和2W-R)很少發(fā)現(xiàn)SMC,而急性d-flow條件下(2D-L)SMC數(shù)量增加至2.3%,慢性d-flow條件下(2W-L)SMC數(shù)量進(jìn)一步增加至18.2%。四種情況下都有成纖維細(xì)胞,其中在急性d-flow情況下**多(2D-L時(shí)為17%)(圖1D)對(duì)2D-R、2D-L、2W-R、2W-L4個(gè)樣本的序列reads使用R軟件包進(jìn)行分析。UMAP分析將總核群劃分為13個(gè)細(xì)胞群,它們以流量和時(shí)間依賴的方式分布(圖1E和1F)。通過Signac將scATAC-seq數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為基因活性指數(shù),并使用上述scRNA-seq研究中描述的相同標(biāo)記基因確定細(xì)胞身份。在13個(gè)簇中,8個(gè)是內(nèi)皮簇(E1E8),其次是SMCs、Fibro、巨噬細(xì)胞、dc、T細(xì)胞和未定義(ND)(圖1G)。江蘇陽(yáng)性神經(jīng)元科研
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1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)