我們進(jìn)一步的研究表明,circPDE4B調(diào)控RIC8A蛋白水平,而不是mRNA水平或穩(wěn)定性(圖3G-I)。我們還阻斷了RIC8A蛋白的合成,并觀察到sh-陰性對(duì)照(NC)和sh-circPDE4B 的HCs之間的RIC8A蛋白半衰期有明顯差異(圖3J),說明circPDE4B降低了RIC8A蛋白的穩(wěn)定性。經(jīng)PS341處理后,RIC8A在circPDE4B過表達(dá)和下調(diào)細(xì)胞中均未發(fā)生變化(圖3K,L),表明circPDE4B通過蛋白酶體活性調(diào)節(jié)RIC8A。無論內(nèi)源性還是外源性RIC8A, RIC8A的多泛素化在circPDE4B耗盡后均下降,在過表達(dá)circPDE4B后則上升(圖3O)。綜上所述,circPDE4B翻譯后影響蛋白酶體介導(dǎo)的RIC8A的降解和周轉(zhuǎn)。促進(jìn)胰腺*的生長和轉(zhuǎn)移。湖北通用細(xì)胞因子科研
藥物篩選確定**類腸道中HIF-2α的合成易損性
作者構(gòu)建Apc缺失型(Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/fl)和CRCHIF-2α過表達(dá)小鼠模型(Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL),從這2個(gè)小鼠模型中分離腸類藥物,并用化療藥物培養(yǎng),生長被監(jiān)測(cè)了5天。在Cdx2-ERT2Cre;在Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL小鼠中,他莫昔芬可誘導(dǎo)HIF-2α,并特異性地破壞結(jié)腸上皮細(xì)胞中的Apc。來自Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/fl**腸系膜的小鼠對(duì)doxorubicin,mitoxantrone,irinotecan,以及eribulin等藥物高度敏感,與來自Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF2αLSL/LSL的不同。RSL3、sorafenib索拉菲尼、erastin和DMF被認(rèn)為是***的小分子,可以***降低Cdx2-ERT2Cre;Apcfl/flHIF2αLSL/LSL**腸道類物質(zhì)的生長。Erastin和RSL3是經(jīng)典的ferroptosis***劑,分別抑制xCT(由Slc7a11基因編碼,是xC系統(tǒng)的一個(gè)組成部分)和GPX4。DMF一種細(xì)胞可滲透的線粒體衍生物,在一些**細(xì)胞系中具有細(xì)胞毒性這些結(jié)果表明,HIF-2α表達(dá)的**可以被氧化應(yīng)激***劑選擇性靶向。 染色質(zhì)科研中標(biāo)率高評(píng)估了成對(duì)*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達(dá)。
METTL3增強(qiáng)APCmRNA的m6A和隨后的YTHDF結(jié)合抑制APC表達(dá)
YTHDF1-3介導(dǎo)mRNA降解,針對(duì)YTHDF1的抗體進(jìn)行RIP分析,實(shí)時(shí)定量PCR分析顯示,在KYSE180中,與APCmRNA結(jié)合的YTHDF2的數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于YTHDF1和YTHDF3的數(shù)量,并且由于METTL3缺失而減少。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,在很大程度上促進(jìn)了YTHDF2與APCmRNA的結(jié)合。
為了研究YTHDF2與APCmRNA結(jié)合在APC表達(dá)中的作用,我們?nèi)コ薡THDF2,這增加了KYSE450細(xì)胞中APC的mRNA(圖5d和補(bǔ)充圖5e)和蛋白質(zhì)表達(dá)。YTHDF1–3的聯(lián)合缺失進(jìn)一步增加了這些細(xì)胞中APC的mRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)。此外,還進(jìn)行了熒光素酶報(bào)告子分析,結(jié)果表明,缺失YTHDF2增強(qiáng)了由含m6A的WTAPCCDS序列驅(qū)動(dòng)的熒光素酶活性,而突變的APC增強(qiáng)了熒光素酶活性,并使該活性抵抗了YTHDF2缺失的調(diào)節(jié)。此外,METTL3過表達(dá)抑制由WTAPCCDS序列驅(qū)動(dòng)的熒光素酶活性通過YTHDF2耗竭恢復(fù),其不影響突變的APC增強(qiáng)的熒光素酶活性。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,隨后的YTHDF結(jié)合抑制了APC的表達(dá)。
**調(diào)節(jié)因子通常作為蛋白質(zhì)復(fù)合物中的亞基存在,并以多種方式參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控,例如通過調(diào)節(jié)組蛋白修飾和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。哺乳動(dòng)物BRG1-或brm相關(guān)的染色質(zhì)重塑復(fù)合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細(xì)胞染色質(zhì)可及性景觀。該復(fù)合物是細(xì)胞周期和增殖的關(guān)鍵調(diào)控因子,也是前列腺*的驅(qū)動(dòng)因子,具有多種**特異性作用。此外,頻繁發(fā)生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復(fù)合物重新靶向于染色質(zhì),促進(jìn)前列腺*的發(fā)生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復(fù)雜功能的關(guān)鍵組件。此外,AR與DNA序列特異性轉(zhuǎn)錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經(jīng)建立。TF FOXA1可以結(jié)合到封閉的染色質(zhì)區(qū)域,調(diào)節(jié)其染色質(zhì)可及性,從而促進(jìn)AR結(jié)合染色質(zhì)引發(fā)PCa。METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長和轉(zhuǎn)移。
肝miRNA發(fā)現(xiàn)者miRNAPCR芯片用于研究肝組織豐富表達(dá)或特異性表達(dá)的84個(gè)miRNA。已注釋的miRNA的數(shù)量不斷擴(kuò)大,重點(diǎn)關(guān)注那些特異表達(dá)某種細(xì)胞系或組織的miRNA變得尤為重要,并非所有的miRNA在每一個(gè)組織中都表達(dá)。因此,我們通過實(shí)驗(yàn)在人類肝臟樣本池通過miRBaseV18分析已鑒定的miRNA的表達(dá),并將結(jié)果與相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行比較。每一種miRNA可以調(diào)節(jié)一個(gè)或多個(gè)信使RNA轉(zhuǎn)錄,反之一個(gè)給定的信使RNA可以由-個(gè)或多個(gè)miRNA調(diào)節(jié)。因此,盡管他們很有特點(diǎn),每個(gè)miRNA的復(fù)雜作用尚未完全定義。這個(gè)芯片比較大化發(fā)現(xiàn)與肝組織或肝細(xì)胞系生物學(xué)表型相關(guān)的miRNA。每張芯片含一個(gè)對(duì)照組使得分析數(shù)據(jù)時(shí)可以用相對(duì)定量00CT方法評(píng)估逆轉(zhuǎn)錄效率,基因組DNA污染和PCR效率。利用這張芯片,通過實(shí)時(shí)定量PCR,可以簡易且可靠地肝中miRNA的表達(dá)。大黃酸處理對(duì)正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應(yīng)??贵w芯片科研實(shí)驗(yàn)可參觀
這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以改善DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎。湖北通用細(xì)胞因子科研
為了確定CDK4 /6i誘導(dǎo)的記憶形成是否通過細(xì)胞周期的RB介導(dǎo)的G1期阻滯,用G1阻滯劑處理細(xì)胞,胸腺嘧啶,通過阻止DNA合成和進(jìn)入S期,**于RB的誘導(dǎo)G1阻滯。結(jié)果顯示胸腺嘧啶處理的細(xì)胞表型復(fù)制了CDK4/6抑制,并在很大程度上挽救了Rb1 KO細(xì)胞中Tcm的形成(Fig. 3J) ,表明RB介導(dǎo)的G1阻滯本身有助于CDK4 /6i誘導(dǎo)的記憶分化。通過3'RNA-seq進(jìn)一步分析Rb1 KO細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)記憶相關(guān)基因下調(diào)和效應(yīng)標(biāo)記增加(圖3K-L),CDK4/6抑制后未能逆轉(zhuǎn)(圖3M-N)。這些結(jié)果表明CDK4/6i介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄重編程和記憶形成是通過RB依賴的G1細(xì)胞周期停滯和同時(shí)抑制CDK4/6信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。湖北通用細(xì)胞因子科研
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)