隨著全球老齡化人口的逐步增長，研究和制定健康老齡化戰(zhàn)略的需求變得越來越重要，并呈現(xiàn)出新的緊迫性。衰老是一個復(fù)雜的過程，受遺傳和表觀遺傳調(diào)控、翻譯后調(diào)控、代謝調(diào)控、宿主-微生物組相互作用、生活方式和許多其他因素的影響。近年來，高通量組學(xué)技術(shù)（包括基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀基因組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、藥物基因組學(xué)和宏基因組學(xué)）已廣泛應(yīng)用于衰老研究，從而對衰老相關(guān)的分子變化進(jìn)行大規(guī)模分析。因此，與衰老相關(guān)的有價值的數(shù)據(jù)量越來越大，需要一個開放和集成的數(shù)據(jù)庫來支持新的衰老研究領(lǐng)域。英拜跟客戶形成產(chǎn)學(xué)研合作模式。血清富集蛋白科研省自然科學(xué)基金
3、心肌LncHrt過表達(dá)挽救心肌梗死的轉(zhuǎn)錄組
為了探究LncHrt的分子機制，作者對LncHrt過表達(dá)的MI發(fā)生7天后的心臟組織和對照組進(jìn)行了基因組RNA測序，鑒定差異表達(dá)基因（DEGs）。KEGG分析顯示這些上調(diào)的DEGs主要富集到代謝相關(guān)通路，如代謝通路、碳代謝、氧化磷酸化、TCA循環(huán)、糖酵解、脂肪酸代謝等，下調(diào)的DEGs則***富集于心臟病理通路，如ECM-受體相互作用和焦點粘連。GO分析也表明上調(diào)DEGs***富集于代謝過程和心臟肌肉組分，下調(diào)DEGs則富集在免疫系統(tǒng)過程和炎癥響應(yīng)等，表明LncHrt過表達(dá)可能通過介導(dǎo)心臟代謝途徑改善MI發(fā)生后的心功能。為了驗證這一假設(shè)，對LncHrt過表達(dá)的MI發(fā)生7天后的心臟組織和對照組進(jìn)行比較轉(zhuǎn)錄組分析，得出了與上述研究類似的結(jié)果?？傊?，這些結(jié)果表明心肌LncHrt過表達(dá)挽救心肌梗死的轉(zhuǎn)錄組通過心臟代謝途徑。 天津斷鏈脂肪酸科研細(xì)菌可能是導(dǎo)致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。
2、白樺素下調(diào)SREBP靶基因，降低細(xì)胞脂質(zhì)水平
由于SREBP-2是其自身的直接靶標(biāo)，因此白樺素將其表達(dá)下調(diào)40％（圖3A）。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉(zhuǎn)錄因子這一觀點一致，膽固醇合成途徑中的10個被測基因，例如HMGCR，HMG-CoA合酶（HMGCS）和角鯊烯環(huán)氧酶（SE），都被白樺素處理抑制了（圖3A）。類似地，與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關(guān)的所有9個基因，例如SREBP-1c，脂肪酸合酶（FAS）和乙酰輔酶A羧化酶α（ACC），都被白樺素顯著下調(diào)（圖3B）。與早期觀察結(jié)果一致（圖1A），包括ABCG5和ABCG8在內(nèi)的LXR靶基因不受白樺素的影響（圖3C）。
RNA甲基化修飾約占所有RNA修飾的60%以上，而N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)是高等生物mRNA和IncRNAs.上普遍的修飾。目前發(fā)現(xiàn)microRNA,circRNA,rRNA,tRNA和snoRNA上都有發(fā)生m6A修飾。m6A修飾主要發(fā)生在RRACH序列中的腺嘌呤上,其功能由“編碼器(Writer)".“消碼器(Eraser"和“讀碼器(Reader"決定[1]?！熬幋a器(Writer)"即甲基轉(zhuǎn)移酶。目前已知這個復(fù)合物的成分有METTL3，METTL14,WTAP和KIAA1429;而ALKBH5和FTO作為去甲基酶(消碼器)可逆轉(zhuǎn)甲基化;m6A由m6A結(jié)合蛋白識別,目前發(fā)現(xiàn)m6A結(jié)合蛋白(讀碼器)有YTH結(jié)構(gòu)域蛋白(包括YTHDF1,YTHDF2,YTHDF3，YTHDC1和YTHDC2)和核不均-蛋白HNRNP家族(HNRNPA2B1和HNRNPC)。評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子（METTL3、METTL14和WTAP）的表達(dá)。
TCGA泛*中的m6A概況
為了表征m6A模式和篩選潛在靶點，在TCGA中的9804個泛*樣本中開發(fā)了一個四步計算框架。經(jīng)過質(zhì)量控制后，共有23個m6A調(diào)節(jié)因子、56個m6A交互蛋白編碼基因、10個lncRNAs和17個miRNAs被納入本研究。106個基因有密切的共表達(dá)關(guān)系（Pearsonr>0.3）。在共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中，大多數(shù)m6A調(diào)節(jié)因子和一些蛋白質(zhì)編碼基因是與其他基因相互作用的樞紐基因。在不同**類型*旁組織的差異表達(dá)比較中，許多基因在**組織中的表達(dá)水平較高，而一些蛋白質(zhì)編碼基因則表現(xiàn)出相反的關(guān)系。這些基因包括ASB2、P2RX6、AXL、ID2和SOCS2；miR-143、miR-29a、miR-125b-1和miR-145等4種miRNA在**組織中表達(dá)較低。所有l(wèi)ncRNAs在**組織中均有較高的表達(dá)。利用**和正常組織的前兩個主成分（PC），我們發(fā)現(xiàn)m6A模式具有良好的鑒別診斷價值。曲線下面積（AUC）在大多數(shù)**中超過90%。 大黃酸能緩解D。SS誘導(dǎo)的小鼠慢性結(jié)腸炎。天津微生物科研
神經(jīng)元中FTH的敲除抵消了褪黑素對創(chuàng)傷性腦損傷鐵死亡的保護(hù)作用。血清富集蛋白科研省自然科學(xué)基金
4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用
據(jù)報道，外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結(jié)合蛋白來轉(zhuǎn)運。通過RNApull-down分析和質(zhì)譜分析，鑒定了三種可能參與miR-934轉(zhuǎn)運的RNA結(jié)合蛋白，并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(dá)（Fig.4a,b）。hnRNPA2B1是一種RNA結(jié)合蛋白，通過與特定基序GGAG/CCCU結(jié)合，參與miRNAs的運輸和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。特別是，由于miR-934序列中有兩個GGAG基序，我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結(jié)合，介導(dǎo)miR-934包裝成外泌體的過程。此外，miRNApull-down分析顯示，在細(xì)胞質(zhì)和外泌體中，miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結(jié)合關(guān)系，然而，突變miR-934的結(jié)合序列(GGAG)可削弱這種結(jié)合（Fig.4c）。RNA免疫沉淀分析進(jìn)一步證明，無論是在CRC細(xì)胞及其外泌體裂解物中，miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集（Fig.4d）。此外，敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細(xì)胞轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞的過程（Fig.4e）。因此，這些結(jié)果證實hnRNPA2B1可以通過與miR-934的GGAG序列結(jié)合，介導(dǎo)miR-934包裝到CRC細(xì)胞外泌體中，并將外泌體miR-934轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞中。 血清富集蛋白科研省自然科學(xué)基金
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5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗