五、gata1調控靶基因的染色質可及性及表達動態(tài)
采用LEfSe方法分析經(jīng)DHEA和tempol處理后***改變的關鍵系統(tǒng)發(fā)育類型。Desulfovibrionaceae屬富集于oil+PBS組，而Muribaculaceae和Alloprevotella屬富集于DHEA+PBS和DHEA+tempol組(圖5A-B)，這表明tempol可以重塑微生物PCOS大鼠的腸道微生物群的結構。通過分析細菌分類在門和屬水平上的相似性程度，進一步比較三組腸道菌群的整體組成。在門水平上，厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)是3個類群的優(yōu)勢門(圖5)。DHEA處理增加了放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、Patescibacteria、軟毛桿菌門(Tenericutes)和Verrucomicrobia的豐度，減少了psilonbacteraeota和變形菌門(Proteobacteria)的數(shù)量。然而，在tempol干預下，放線菌門、Patescibacteria門、變形菌門和Tenericutes門的變化減弱了(圖5D)。在屬水平上，Lachnospiraceae_NK4A136_group和Multibaculaceae為優(yōu)勢屬(圖5E)。DHEA***提高了thaauera、葡萄球菌、Ideonella、棒狀桿菌和瘤胃球菌_2的豐度，降低了瘤胃球菌_1的豐度。這些變化被tempol處理抵消了(圖5F)。武漢病理科研外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化促進CRC肝轉移。
三、通過RNA-seq、RIP-seq和MeRIP-seq鑒定ythdf1調控的轉錄本
了解流量調節(jié)內皮基因的表達在轉錄和體內外遺傳性染色質易訪問性水平,我們和其他人使用批量rna或dna從池獲得ECs暴露s-flow或維使用鼠標部分頸動脈結扎(PCL)模型或豬動脈。我們建立了PCL模型，并顯示在2周內，d-flow快速誘導，而s-flow阻止，高膽固醇小鼠***的發(fā)展。PCL模型包括結扎左側頸總動脈(LCA)的4個遠端分支中的3個以誘導d-血流，同時使用繼續(xù)暴露于s-血流的對側右側頸總動脈(RCA)作為內部控制。我們進一步開發(fā)了一種管腔沖洗方法，使我們能夠從PCL后的lca和rca中獲得內皮富集的rna和dna。然后用mRNA微陣列、microRNA微陣列和RNA測序(RNA-seq)分析這些聚合的整體RNA，以識別mRNA轉錄組和受ECs流量調節(jié)的microRNAs。這些研究導致了大量的流動敏感基因和microrna的發(fā)現(xiàn)，這些基因和microrna在內皮生物學和***中的作用已經(jīng)被詳細描述和研究。我們還能夠從lca和rca中獲得大量DNA樣本，并通過減少代表性亞硫酸氫鹽測序(RRBS)方法進行分析。本研究表明，d-flow和s-flow差異調控ECs的表觀基因組DNA甲基化譜，鑒定了許多受流量調控的基因位點。細菌可能是導致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。
外泌體傳遞的miRNA-335-5p通過靶向RASA1促進CRC細胞遷移、侵襲、EMT和轉移
作者用miR-335-5p模擬物或陰性對照(NC)轉染的SW480細胞的條件培養(yǎng)基中收集外泌體。使用qRT-PCR檢測這些外泌體中miR-335-5p的水平。結果顯示含有模擬物（miR-335-5p模擬物-exo）的外泌體顯著促進了SW480和SW620細胞的遷移和侵襲，并且還降低了RASA1蛋白表達并增加了Ras蛋白表達。此外，miR-335-5p模擬物-exo抑制EMT，如上皮標志物E-鈣粘蛋白的表達降低和間充質標志物波形蛋白的表達增加。***，用miR-335-5p模擬物-exo處理的細胞顯示出更強的體內轉移促進作用，肺表面宏觀結節(jié)的數(shù)量急劇增加。這些結果表明，外泌體介導的miR-335-5p穿梭可能會加速CRC細胞的體外遷移和侵襲以及體內轉移，同時伴隨著Ras信號和EMT的***。 英拜生物提供生物科學內的專業(yè)的技術咨詢，技術合作。江蘇脊柱損傷科研
FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。生物信息學科研
Pur-α降低AD患者Aβ負荷，防止認知功能下降**近研究表明，Pur-α在硬化癥和額顳葉癡呆中起重要作用。但對Pur-α在AD中的作用知之甚少。由于Pur-α是CircCwc27的直接靶點，研究中通過注射與腺*病毒相關的、攜帶flag標記物的Flag-AAV9-Control和Flag-AAV9-Pur-α到APP/PS1小鼠海馬體中，觀察Pur-α對AD病理的影響。注射兩個月后，在小鼠海馬體中出現(xiàn)明顯的綠色熒光，說明存在有效轉導。然而，CircCwc27在Pur-α過表達的大腦中表達沒有變化。與對照組相比，Pur-α過表達***減少APP/PS1小鼠海馬區(qū)Aβ沉積和促炎因子。注射Flag-AAV9-Pur-α在很大程度上保護APP/PS1小鼠免于嚴重的記憶缺陷。綜上所述，Pur-α可減少Aβ沉積，挽救空間記憶損傷。生物信息學科研
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7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗