6）FPN蛋白在肺*細(xì)胞中的穩(wěn)定性需要USP35
USP35屬于DUBs家族，在控制各種蛋白質(zhì)的Ub依賴性降解中起關(guān)鍵作用。此外，F(xiàn)PN泛素化和隨后的內(nèi)吞作用導(dǎo)致鐵超載和鐵死亡。因此，我們研究了USP35是否通過影響其蛋白質(zhì)穩(wěn)定性來調(diào)節(jié)FPN表達(dá)。如圖8A所示，USP35敲除增加，而USP35過表達(dá)降低泛素化FPN水平。用MG132蛋白酶體抑制劑***后，shUSP35***細(xì)胞的全部或膜裂解物中FPN水平的降低被阻止(圖8B)。隨后，我們檢查了USP35是否是FPN的直接結(jié)合伙伴。IP分析的數(shù)據(jù)揭示了內(nèi)源性USP35和FPN之間的聯(lián)系(圖8C)?？傊?，這些數(shù)據(jù)表明USP35可以直接與FPN相互作用，并作為deubiquitinase發(fā)揮作用，以保持其蛋白質(zhì)穩(wěn)定性。 英拜提供分子生物學(xué)以及免疫病理相關(guān)實(shí)驗(yàn)。IGF信號通路科研服務(wù)兩年
進(jìn)一步檢測S100A4的功能，結(jié)果顯示敲除S100A4***降低高轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力，過表達(dá)S100A4則***增強(qiáng)低轉(zhuǎn)移性HCC細(xì)胞系的遷移和侵襲能力（圖3d）。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過表達(dá)的HCC細(xì)胞的外泌體，結(jié)果得到了類似的結(jié)論，S100A4過表達(dá)外泌體***增強(qiáng)HCC細(xì)胞的遷移和侵襲，以及體內(nèi)肺部轉(zhuǎn)移的能力（圖3e-f）。這些結(jié)果證實(shí)了外泌體S100A4具有增強(qiáng)HCC細(xì)胞轉(zhuǎn)移潛力的功能。
4、外泌體S100A4通過STAT3磷酸化***OPN轉(zhuǎn)錄
接下來探究了S100A4的作用機(jī)制，首先選擇了21個**干性相關(guān)基因，然后下載了GEO數(shù)據(jù)進(jìn)行相關(guān)性分析，結(jié)果顯示S100A4主要和11個基因正相關(guān)（圖4a）。隨后檢測了不同HCC細(xì)胞系中敲除和過表達(dá)S100A4后11個基因的表達(dá)水平的改變，結(jié)果顯示只有OPN是S100A4的下游基因，其表達(dá)受到S100A4的調(diào)控（圖4b-f）。OPN是促進(jìn)HCC轉(zhuǎn)移和干性的關(guān)鍵因子，但外泌體S100A4調(diào)節(jié)OPN的機(jī)制仍不清楚。 脂肪生產(chǎn)芯片科研實(shí)驗(yàn)可參觀英拜生物提供生物科學(xué)內(nèi)的專業(yè)的技術(shù)咨詢，技術(shù)合作。
使用SmartSeq2協(xié)議對15個胎兒的單個細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq處理（圖1a）?；诓町惐磉_(dá)(DE)分析和按標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)***性排序的前20個標(biāo)記基因。紅細(xì)胞(表達(dá)HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達(dá)FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細(xì)胞祖細(xì)胞和單核細(xì)胞(表達(dá)CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細(xì)胞、肥大細(xì)胞(表達(dá)CD63、GATA2和HDC)、漿細(xì)胞樣樹突狀細(xì)胞(pDCs;表達(dá)IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環(huán)pDCs(表達(dá)pDC和增殖標(biāo)記物;例如，MKI67)和粒細(xì)胞1、2和3(表達(dá)AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細(xì)胞分析顯示，在所有免疫表型定義的干細(xì)胞和祖細(xì)胞群體中存在***的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性，一些表型祖細(xì)胞群體(如造血干細(xì)胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過10個不同的轉(zhuǎn)錄定義群體組成（圖1c）.注釋了23個不同群體（圖1d）.
七、股骨和肝臟細(xì)胞在不同細(xì)胞類型之間的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異
HSC/MPP簇中的細(xì)胞來源于肝臟，股骨和髖部，這為評估起源于胚胎肝臟或骨髓的HSC/MPP群體中潛在的定性和定量差異提供了機(jī)會。研究者首先對處于不同細(xì)胞周期狀態(tài)的肝臟和股骨細(xì)胞的數(shù)量進(jìn)行了Fisher精確檢驗(yàn)。結(jié)果顯示，在股骨和肝臟中，絕大多數(shù)CD-REF細(xì)胞處于G0/G1期，而肝臟中處于S-G2-M期的細(xì)胞數(shù)量幾乎是股骨的兩倍。KS和MWW檢驗(yàn)顯示，與肝臟相比，股骨中HSCs/MPPS中基因表達(dá)數(shù)量也比較少，但股骨中HSCs/MPPs***上調(diào)了與核小體組裝、染色質(zhì)組裝和DNA組裝有關(guān)的基因，而肝臟中HSC/MPPs***上調(diào)了與肌動蛋細(xì)胞骨架重塑、細(xì)胞粘附和遷移有關(guān)的基因。 METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長和轉(zhuǎn)移。
METTL3增強(qiáng)APCmRNA的m6A和隨后的YTHDF結(jié)合抑制APC表達(dá)YTHDF1-3介導(dǎo)mRNA降解，針對YTHDF1的抗體進(jìn)行RIP分析，實(shí)時定量PCR分析顯示，在KYSE180中，與APCmRNA結(jié)合的YTHDF2的數(shù)量遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于YTHDF1和YTHDF3的數(shù)量，并且由于METTL3缺失而減少。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A，在很大程度上促進(jìn)了YTHDF2與APCmRNA的結(jié)合。為了研究YTHDF2與APCmRNA結(jié)合在APC表達(dá)中的作用，我們?nèi)コ薡THDF2，這增加了KYSE450細(xì)胞中APC的mRNA（圖5d和補(bǔ)充圖5e）和蛋白質(zhì)表達(dá)。YTHDF1–3的聯(lián)合缺失進(jìn)一步增加了這些細(xì)胞中APC的mRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)。此外，還進(jìn)行了熒光素酶報(bào)告子分析，結(jié)果表明，缺失YTHDF2增強(qiáng)了由含m6A的WTAPCCDS序列驅(qū)動的熒光素酶活性，而突變的APC增強(qiáng)了熒光素酶活性，并使該活性抵抗了YTHDF2缺失的調(diào)節(jié)。此外，METTL3過表達(dá)抑制由WTAPCCDS序列驅(qū)動的熒光素酶活性通過YTHDF2耗竭恢復(fù)，其不影響突變的APC增強(qiáng)的熒光素酶活性。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A，隨后的YTHDF結(jié)合抑制了APC的表達(dá)。英拜的實(shí)驗(yàn)室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。SCI科研地區(qū)科學(xué)基金
英拜有一支高精尖的團(tuán)隊(duì)。IGF信號通路科研服務(wù)兩年
5.沉默lnc-PMIF促進(jìn)老年OPCs向骨形成表面遷移，促進(jìn)老年小鼠骨形成
BMSCs中沉默lnc-PMIF，增殖無變化，OPCs成骨能力不改變，細(xì)胞遷移數(shù)量高，表明沉默lnc-PMIF可增強(qiáng)老年OPCs的遷移能力，而不干擾老年OPCs的體外增殖和成骨分化。接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠中骨形成表面Dil+細(xì)胞數(shù)***升高，提示沉默lnc-PMIF可促進(jìn)老年OPCs在體內(nèi)向骨形成表面遷移，大部分遷移的Dil+細(xì)胞中檢測到Runx2表達(dá)，表明si-PMIF處理的老年BMSCs遷移到骨形成表面發(fā)生正常的成骨分化，這將有助于小鼠的骨形成。接受si-PMIF處理的老年BMSCs小鼠骨表面TGF-β+細(xì)胞的平均積分光密度***更高，而TRAP+面積無***差異，表明si-PMIF處理的老化BMSCs可能影響細(xì)胞募集，而不是骨吸收。上述si-PMIF或si-NC處理的老年BMSCs對老年雄性小鼠進(jìn)行脛骨內(nèi)注射，4周后接受si-PMIF處理的老年BMSCs的小鼠骨量更高，脛骨干骺端微結(jié)構(gòu)更好，BMD和BV/TV更高，MAR和BFR/BS更高。這些結(jié)果證明，老年BMSCs敲低lnc-PMIF可促進(jìn)骨形成。 IGF信號通路科研服務(wù)兩年
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)