6、IFNα暴露增加CD8+T細胞的NAD+的消耗
為了了解慢性I型IFN與CD8+T細胞下游線粒體和代謝變化之間的機制聯(lián)系，首先在SLE患者CD8+T細胞的轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)中探索了哪些通路與I型IFN信號相關(guān)。結(jié)果顯示煙酸/煙酰胺代謝途徑顯示出比較高的相關(guān)性（圖6a），并且在IFN-highSLE患者的CD8+T細胞中，NAD消耗酶，如ADP-核糖聚合酶（PARP9、PARP10和PARP12）和CD3828***上調(diào)（圖6b）。觀察到延長IFNα和TCR刺激后CD8+T細胞中NAD+/NADH比值***降低（圖6d），該實驗條件模擬了在IFN-high的SLE患者CD8+T細胞中觀察到的線粒體和代謝異常，表明在活化的CD8+T細胞中，I型IFN信號引起的NAD消耗酶表達上調(diào)可導(dǎo)致NAD+耗竭和隨后的線粒體功能障礙。 嘌呤在細胞中執(zhí)行許多重要的功能。上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化科研國家自然科學(xué)基金
轉(zhuǎn)座酶染色質(zhì)可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術(shù)。單細胞核測序，能夠獲得組織的細胞圖譜，解決細胞異質(zhì)性的問題。單細胞或細胞核RNA測序(scRNA-seq或snRNAseq)促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類和小鼠腎臟的多個scRNAseq圖譜已經(jīng)確定了轉(zhuǎn)錄如何有助于細胞類型的特異性。**近的方法已經(jīng)將這種方法擴展到單細胞染色質(zhì)可及性分析。單核染色質(zhì)轉(zhuǎn)置可及性測序試驗(snATACseq)是ATAC-seq的擴展，該試劑盒利用Tn5轉(zhuǎn)置酶在數(shù)千個單個細胞中測量染色質(zhì)可及性。上海腸道菌科研英拜生物是國內(nèi)承接各類高通量測序科研項目以及一站式的測序文章發(fā)表服務(wù)的公司之一。
為了評估這些CAR-T細胞的功能性記憶能力，在CAR-T細胞轉(zhuǎn)移后30天用LeY + 卵巢*細胞系OVCAR-3(Fig. 5D)處理小鼠，觀察到與未處理的CAR組相比，預(yù)處理的CAR-T細胞在小鼠血液中的擴增***增加(Fig. 5G)。意味著先前接受過CAR-T細胞***的小鼠的**控制***增強(Fig. 5H-I)。值得注意的是，第30天的**大小與**侵襲前血液中CD3+ T細胞的數(shù)量呈***負相關(guān)(Fig. 5J)，表明CDK4/6i處理的CAR-T細胞的持久性增強是驅(qū)動**控制的關(guān)鍵因素。事實上，**接種后40天，接受預(yù)處理的CAR-T細胞的小鼠浸潤CD4+和CD8+ CAR-T細胞的數(shù)量***增加(Fig. 5K)。接下來通過將未處理或預(yù)處理的抗LeY CAR-T細胞轉(zhuǎn)移到OVCAR-3荷瘤小鼠體內(nèi)，檢測了CDK4/6i預(yù)處理對CAR-T細胞急性療效的影響。用CDK4/6i預(yù)處理CAR-T細胞可***增強其抗**活性（Fig.5L-M)。與此一致，轉(zhuǎn)移后數(shù)周發(fā)現(xiàn)接受預(yù)處理細胞的小鼠血液中CD4 + 和CD8 + 細胞以及**中CD8 + 細胞數(shù)量***增高（Fig.5N-O)?？傊?，這些數(shù)據(jù)證明CDK4/6i體外***是增強CAR-T細胞表型和長期療效的穩(wěn)健策略。
同源異形盒(HOX)基因甲基化PCR芯片研究文獻中已經(jīng)報道的態(tài)參與多細胞生物的發(fā)展的22個基因的啟動子甲基化狀態(tài)。HOX基因編碼一組包含同源結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子，**初被描述為發(fā)育過程控制節(jié)段性模式。HOX基因的異常表達一直在各種類型的**中觀察到。雖然這些HOX基因已經(jīng)被根據(jù)它們在多細胞生物發(fā)育中扮演的角色進行分類,它們在細胞系統(tǒng)中的真實功能仍待被發(fā)掘。利用這些芯片分析細胞或新鮮組織基因組DNA樣本有助于關(guān)聯(lián)CpG島甲基化狀態(tài)與生物表型。結(jié)果還可以提供洞察分化和發(fā)育或**形成背后的分子機制和生物學(xué)通路。利用這個芯片,通過簡單的限制性內(nèi)切酶消化和實時定量PCR，就可以研究分析22個不同同源異型盒基因的啟動子甲基化狀態(tài)。METTL14的上調(diào)可以通過m6A修飾降低PERP水平。
為了探究MIR210HG是否參與了一個新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫來預(yù)測與HMGA2結(jié)合的mirna(圖3F)。選擇3個軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導(dǎo)的HMGA2構(gòu)建物共轉(zhuǎn)染HEK293T細胞，共鑒定和篩選了110個miRNAs。轉(zhuǎn)染后，23個miRNA轉(zhuǎn)染細胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中，轉(zhuǎn)染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時，熒光素酶活性***降低，其中轉(zhuǎn)染miR-337-3p和miR-137時，熒光素酶活性降低**多。利用生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫TargetScan預(yù)測miR-337-3p和miR-137中與HMGA2結(jié)合的位點。雙熒光素酶基因報告基因檢測結(jié)果顯示，miR-337-3p和miR-137在其預(yù)測的結(jié)合位點上結(jié)合HMGA2(圖3H)。qPCR結(jié)果顯示，miR-337-3p和miR-137負調(diào)控HMGA2的表達(圖3I)。采用Pearson’s秩相關(guān)法分析MIR210HG與HMGA2表達的相關(guān)性，發(fā)現(xiàn)HMGA2的表達與MIR210HG呈正相關(guān)(圖3 J和K)。這些結(jié)果表明MIR210HG可能參與了新的MIR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。生長因子科研分子生物學(xué)實驗
大黃酸可以改變腸道菌群組成。上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化科研國家自然科學(xué)基金
6）SsD抑制患者原代細胞
我們從吉林大學(xué)***醫(yī)院**組織/生物標本庫獲取AML患者外周血，進一步評估SsD對白血病進展的影響。SsD***抑制了白血病細胞增殖(圖6A)、集落形成能力(圖6B)、誘導(dǎo)細胞周期阻滯(圖6C)。在機制上，這是由FTO介導(dǎo)的m6ARNA甲基化及其在SsD處理的原代細胞中的靶點調(diào)控的(圖6D-G)。當我們使用“人-鼠”異種移植白血病模型來評估SsD在體內(nèi)對白血病進展的影響時(圖6H)，與上述類似，使用SsD******抑制AML進展，包括降低WBC，減少BM中的白血病母細胞，減少脾腫大，抑制肺轉(zhuǎn)移，延長AML原代細胞異種移植小鼠的存活時間(圖6I-N)。因此，這些體內(nèi)研究結(jié)果表明SsD具有***FTO介導(dǎo)的AML的潛力。 上皮間充質(zhì)轉(zhuǎn)化科研國家自然科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標書申請：提供標書課題設(shè)計、撰寫，標書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標書均符合科研前沿?zé)狳c，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學(xué)實驗