snoRNAs派生的小RNAs
miRNA在一系列調(diào)控過程中起著重要作用，如細(xì)胞存活和細(xì)胞增殖的調(diào)控,由snoRNAs產(chǎn)生的sno-miRNAs產(chǎn)生的小RNA具有雙重功能,同樣的轉(zhuǎn)錄本可以作為snoRNA和miRNA的前體。ACA45是***個(gè)被報(bào)道能夠被降解成短片段snoRNAs，它是通過與Ago蛋白的相互作用被發(fā)現(xiàn)的，而Ago作為miRNARISC復(fù)合物的成員，這就表明ACA45的進(jìn)一步的加工處理是依賴于Dicer酶的。降解產(chǎn)生的20-22nt的短片段RNA的作用機(jī)制類似與miRNA抑制目的基因(CDC2L6)的表達(dá)[11]。很多研究揭示了snoRNAs可能參與抑*基因P53的調(diào)控，snoRNA來源的miR-605被報(bào)道能抑制MDM2蛋白合成，從而促進(jìn)抑*基因P53的表達(dá)（圖4）近期報(bào)道發(fā)現(xiàn)11個(gè)C/DboxsnoRNAs能夠降解形成短片段RNA從而抑制靶基因的表達(dá)[12]。在***的研究中snoRNAs進(jìn)一步被加工成更小的RNAs被稱為sno派生的RNAs(sdRNAs)，通過對(duì)來自32種**類型的10262例患者樣本的~22nt大小的smRNA-seq數(shù)據(jù)集的綜合分析，研究人員繪制了泛*sdRNAome的圖譜，結(jié)合多個(gè)臨床相關(guān)特征上的特征，特別是**免疫和臨床結(jié)果。大量的sdRNAs與**免疫微環(huán)境特征***相關(guān)，如免疫抑制標(biāo)志物、CD8+T細(xì)胞浸潤(rùn)、細(xì)胞溶解性T細(xì)胞活性、**血管組織等[13]。 評(píng)估了成對(duì)*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子（METTL3、METTL14和WTAP）的表達(dá)。遼寧免疫病理芯片科研
六、改進(jìn)分選策略以分離胚胎HSCs/MPPs
研究者基于細(xì)胞表面標(biāo)記設(shè)計(jì)了一種針對(duì)HSCs/MPP的新的熒光***細(xì)胞分選策略（簡(jiǎn)稱CD-REF），使用CD-REF分選板對(duì)股骨BM細(xì)胞進(jìn)行分選，結(jié)果顯示標(biāo)記為HSCs/MPP和HSCs/MPPs-Cycle簇的CD-REF細(xì)胞約占88％。為了評(píng)估CD-REF細(xì)胞譜系輸出的分化潛力和穩(wěn)健性，研究人員在小鼠MS5飼養(yǎng)層或更具生理相關(guān)性的人類胎兒間充質(zhì)干細(xì)胞（fMSCs）上對(duì)三個(gè)胎兒的單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行了分選，結(jié)果顯示MS5和fMSCs上分別存在著四系、三系、雙系、單系和未分化的譜系集落。接下來，又對(duì)單個(gè)CD-REF和免疫表型HSCs進(jìn)行了分類，結(jié)果顯示CD-REF在胎兒肝臟和骨髓中富集了多譜系輸出的細(xì)胞群，且CD-REF細(xì)胞具有與表型HSCs相當(dāng)?shù)亩酀撃苄院妥V系輸出能力，這與前述分化軌跡探究一致，再次驗(yàn)證CD-REF**了高富集的HSC/MPPs群體。 抗體芯片科研國家自然科學(xué)基金大黃酸處理對(duì)正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應(yīng)。
與基因表達(dá)改變一致，白樺素處理以濃度依賴性的方式***減少了膽固醇和脂肪酸的從頭合成（圖3D-E）。此外，白樺素降低了細(xì)胞膽固醇（圖3F）和中性脂質(zhì)（主要是膽固醇酯和甘油三酸酯）的穩(wěn)態(tài)水平（圖3G）。兩者合計(jì)，我們的數(shù)據(jù)表明白樺素抑制SREBP加工并下調(diào)膽固醇和脂肪酸的生物合成，從而降低細(xì)胞脂質(zhì)水平。有趣的是，洛伐他汀顯著降低了膽固醇的合成（圖3D），但也適度地增加了脂肪酸的生物合成（圖3E），這可能是因?yàn)槁宸ニ∈荋MGCR的抑制劑，它可以阻斷膽固醇的合成，進(jìn)而刺激SREBP的活化，從而增加脂肪酸合成。
1）Pex誘導(dǎo)肝纖維化微環(huán)境，促進(jìn)PDAC肝轉(zhuǎn)移
從小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細(xì)胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結(jié)構(gòu)，大小約為50-150nm(圖1A，B)。進(jìn)一步的westernblot分析證實(shí)了分離的外泌體的存在(圖1C)。為了確定Pex在PDAC肝轉(zhuǎn)移中的作用，我們首先進(jìn)行了“教育”程序，并進(jìn)一步通過脾內(nèi)注射建立了PDAC肝轉(zhuǎn)移模型(圖1D)。在“教育”過程后，STE和原子力顯微鏡(AFM)顯示，與Npex組相比，Pex組小鼠的肝臟剛度***增加(圖1E，F(xiàn))。此外，肝組織膠原密度增加(圖1G)，肝ECM明顯重構(gòu)(圖1H，I)。同樣，PDAC原位植入模型也顯示原位**可增加肝臟膠原沉積。肝轉(zhuǎn)移模型顯示，與Npex組相比，Pex組肝轉(zhuǎn)移更多，肝質(zhì)量更高(圖1J)。這些數(shù)據(jù)表明，Pex可以通過重構(gòu)肝臟ECM來誘導(dǎo)肝纖維化微環(huán)境，促進(jìn)PDAC肝轉(zhuǎn)移。 增加乳酸桿菌水平導(dǎo)致尿酸水平下降。
為了進(jìn)一步研究MAO-A是否作為巨噬細(xì)胞自主因子直接調(diào)控TAM極化從而影響抗**免疫，進(jìn)行了巨噬細(xì)胞過繼轉(zhuǎn)移**實(shí)驗(yàn)。從Maoa WT和KO小鼠中獲取BM細(xì)胞，然后培養(yǎng)成骨髓源性巨噬細(xì)胞(bone marrow macrophages, BMDMs)。然后將這些Maoa WT或KO BMDMs與B16-OVA黑色素瘤細(xì)胞混合，皮下注射到BoyJ WT受體小鼠中建立實(shí)體**（圖2g）。在本實(shí)驗(yàn)中，MAO-A缺乏的比較***于TAM細(xì)胞。在接受Maoa KO BMDMs小鼠中觀察到**生長(zhǎng)抑制（圖2h-i），TAM免疫抑制markers下調(diào)（圖2j），免疫刺激markers上調(diào)（圖2k-l），以及增強(qiáng)**浸潤(rùn)C(jī)D8+T細(xì)胞***（圖2m）。綜上所述，這些體內(nèi)研究表明MAO-A作為一種直接調(diào)節(jié)TAM極化的自主因子，從而影響T細(xì)胞抗**反應(yīng)性和影響**生長(zhǎng)。
巨噬細(xì)胞表型協(xié)調(diào)急性胰腺炎損傷后的炎癥和修復(fù)再生。遼寧免疫病理芯片科研
circNDUFB2觸發(fā)NSCLC細(xì)胞的免疫防御反應(yīng)
為了研究參與circNDUFB2的信號(hào)通路，使用RNA測(cè)序（RNA-seq）進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組分析。結(jié)果表明circNDUFB2過表達(dá)影響934個(gè)基因的表達(dá)水平，其中743個(gè)基因上調(diào)，191個(gè)基因被下調(diào)?；虮倔w生物學(xué)過程（GO_BP）和KEGG途徑富集分析表明circNDUFB2觸發(fā)了免疫防御和I型干擾素（IFNs）信號(hào)傳導(dǎo)?；蚣患治觯℅SEA）也表明目標(biāo)基因的信號(hào)傳導(dǎo)途徑參與了免疫反應(yīng)。確認(rèn)了在circNDUFB2過表達(dá)的NSCLC細(xì)胞中一組免疫基因表達(dá)被上調(diào)，而circNDUFB2敲低降低了NSCLC細(xì)胞中這些基因的水平。這些結(jié)果表明，過量表達(dá)circNDUFB2，而不是其具有相同序列的線性RN**段，導(dǎo)致免疫基因上調(diào)。 酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)（ELISA）證實(shí)circNDUFB2過表達(dá)顯著增加了細(xì)胞培養(yǎng)上清液中CXCL10，CXCL11，CCL5和IFNβ的水平，而circNDUFB2敲低降低了細(xì)胞培養(yǎng)上清液中這些細(xì)胞因子的水平。這些結(jié)果證明circNDUFB2在NSCLC細(xì)胞中引發(fā)免疫應(yīng)答。 遼寧免疫病理芯片科研
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)