這些基因的體細(xì)胞突變狀態(tài)如圖所示。平均突變頻率比較高的基因是TP53（31.4%）、PTEN（5.7%）、NOTCH1（3.6%）、CTNNB1（3.6%）、XIST（3.4%）和MALAT1（3.4%）。還觀察到在子宮內(nèi)膜體*（UCEC）中有相對(duì)較高的突變頻率（7.6%）。
在泛*中構(gòu)建 m6A 亞型和特征
我們使用K-means算法分別將患者分為不同的m6A亞型。Elbow法確定了三種亞型。對(duì)數(shù)秩檢驗(yàn)發(fā)現(xiàn)，在排除死亡比例的**后，27種**中有24種**的定義亞型與總生存率***相關(guān)?<?10%。具體來說，我們定義了按中位生存時(shí)間（MST）排序的聚類。MST**長的組定義為第1組，MST**短的組定義為第3組，中間組定義為第2組。與第1組相比，第2組和第3組在27種**中有22種的生存率***降低。此外，當(dāng)臨床結(jié)果為無進(jìn)展間期（PFI）時(shí)，分類在大多數(shù)**類型中仍然***（16/26）或疾病特異性生存率（DSS）（18/26）。在總體人群的KM生存率分析中，m6A亞型在調(diào)整**類型后可***分層患者的生存率。四個(gè)體細(xì)胞突變?cè)诓煌琺6A亞型中的分布有***性差異，包括TP53、NOTCH1、CTNNB1和PTEN。 我們?cè)谌祟愐认?細(xì)胞系中過表達(dá)或敲除METTL14。成都細(xì)胞發(fā)育與分化科研
3.脂肪細(xì)胞通過外泌體linc-ROR去分化促進(jìn)PC**的發(fā)生功能上，菌落形成分析的結(jié)果顯示，在共培養(yǎng)體系中，敲低/過表達(dá)外泌體linc-ROR表達(dá)***降低/增強(qiáng)了PC細(xì)胞的生長活力，實(shí)時(shí)細(xì)胞分析(RTCA)xCELLigence實(shí)驗(yàn)產(chǎn)生了類似的結(jié)果。如圖所示，共培養(yǎng)/較高linc-ROR組比各自的對(duì)照組表現(xiàn)出更好的生長。這些結(jié)果也被EdU實(shí)驗(yàn)結(jié)果所證實(shí)。綜上所述，外泌體linc-ROR表達(dá)較高的脂肪細(xì)胞脫分化后，PC細(xì)胞增殖能力增強(qiáng)。
4.脂肪細(xì)胞和PC細(xì)胞共培養(yǎng)系統(tǒng)誘導(dǎo)PC細(xì)胞的遷移、侵襲和形態(tài)改變，并伴有EMT研究結(jié)果還表明，與PBS-shCtrl/PBS-Ctrl相比，脂肪細(xì)胞和外泌體linc-ROR共培養(yǎng)體系的條件培養(yǎng)基增強(qiáng)了PC細(xì)胞系的運(yùn)動(dòng)性。作者發(fā)現(xiàn)由外泌體linc-ROR表達(dá)增加引起的脂肪細(xì)胞脫分化使PC細(xì)胞更有運(yùn)動(dòng)能力。此外，經(jīng)外泌體linc-ROR處理的脂肪細(xì)胞產(chǎn)生的條件培養(yǎng)基在很大程度上誘導(dǎo)PC細(xì)胞通過Transwell過濾器遷移和侵襲。條件培養(yǎng)液改變了PC細(xì)胞的形態(tài)，從凝聚型轉(zhuǎn)變?yōu)榉稚⑿停湫捅憩F(xiàn)為細(xì)胞間連接丟失和細(xì)胞偽足擴(kuò)展，免疫熒光(IF)實(shí)驗(yàn)顯示，間質(zhì)標(biāo)記物波形蛋白表達(dá)增加，上皮標(biāo)記物E-cadherin表達(dá)減少。這些數(shù)據(jù)證實(shí)了外泌體linc-ROR的表達(dá)增加，通過共培養(yǎng)系統(tǒng)作用于脂肪細(xì)胞，促進(jìn)體外PC轉(zhuǎn)移。 遼寧細(xì)胞死亡通路發(fā)現(xiàn)者科研英拜有一支高精尖的團(tuán)隊(duì)。
8.過表達(dá)Caspase-11加重MCD誘導(dǎo)的小鼠肝脂肪變性
由于缺乏Caspase-11減弱MCD誘導(dǎo)的肝脂肪變性，我們檢測肝臟中Caspase-11過表達(dá)對(duì)MCD誘導(dǎo)的肝脂肪變性的影響。我們?cè)贏lb-Cre小鼠肝細(xì)胞中過表達(dá)Caspase-11(圖8A)。正常情況下，對(duì)照組和過表達(dá)Caspase11的小鼠肝臟組織學(xué)形態(tài)正常。MCD處理導(dǎo)致對(duì)照和過表達(dá)Caspase11的小鼠肝臟出現(xiàn)明顯的脂質(zhì)積聚(空泡)。此外，過表達(dá)caspase-11的小鼠肝臟中的空泡比對(duì)照小鼠肝臟中的大且多(圖8B)。相應(yīng)的，與MCD處理的對(duì)照組相比，過表達(dá)Caspase-11的小鼠脂肪變性評(píng)分(圖8C)和膨脹評(píng)分(圖8D)***升高。類似地，與對(duì)照組小鼠相比，MCD處理的caspase-11過表達(dá)的的小鼠血清中ALT(圖8E)、AST(圖8F)和肝臟甘油三酯(圖8G)升高。
在沒有RNA配體的情況下，RIG-I采用一種自動(dòng)抑制的構(gòu)象，CARDs發(fā)出信號(hào)。因此假設(shè)circNDUFB2可能通過促進(jìn)其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測RIG-I的CARDs（FLAG-CARD）和螺旋酶結(jié)構(gòu)域（HA-ΔCARD）之間的相互作用。結(jié)果表明circNDUFB2抑制了RIG-I的CARDs和螺旋酶結(jié)構(gòu)域之間的相互作用。此外，circNDUFB2增強(qiáng)了CARDs與線粒體抗病毒信號(hào)蛋白（MAVS）的相互作用。這些結(jié)果表明circNDUFB2可能通過破壞CARDs與其解旋酶結(jié)構(gòu)域之間的分子內(nèi)相互作用來***RIG-I，并使RIG-I保持活性，從而***RIG-I-MAVS信號(hào)級(jí)聯(lián)。circNDUFB2的免疫反應(yīng)抑制NSCLC進(jìn)展英拜生物提供生物科學(xué)內(nèi)的專業(yè)的技術(shù)咨詢，技術(shù)合作。
對(duì)snATAC-seq數(shù)據(jù)集使用97%置信閾值對(duì)細(xì)胞類型分配進(jìn)行過濾，以去除異型雙重體。通過標(biāo)簽轉(zhuǎn)移獲得的snATAC-seq細(xì)胞類型預(yù)測(圖1d)與無監(jiān)督簇的編輯注釋(圖1e, f)的比較表明，所有主要的細(xì)胞類型都存在于這兩個(gè)數(shù)據(jù)集中，并且在檢測和分配細(xì)胞身份方面，snATAC-seq與snRNA-seq具有可比性(補(bǔ)充圖3)。使用基于基因活性的細(xì)胞類型分配進(jìn)行下游分析，這是通過對(duì)snatc -seq數(shù)據(jù)集的無監(jiān)督聚類獲得的。有趣的是，snATAC-seq能夠檢測到近端小管簇內(nèi)的兩個(gè)亞群，這可能**近端曲小管(圖1e, PCT)和近端直小管(圖1e, PST)。PCT顯示編碼SGLT2的SLC5A2具有更強(qiáng)的染色質(zhì)可及性;而PST在編碼SGLT1的SLC5A1(圖1f，補(bǔ)充圖4)中表現(xiàn)出更強(qiáng)的可達(dá)性。SGLT2在近端小管S1和S2段重新吸收葡萄糖，SGLT1位于S3。英拜提供可靠的技術(shù)咨詢。肺纖維化小鼠模型科研省自然科學(xué)基金
METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長和轉(zhuǎn)移。成都細(xì)胞發(fā)育與分化科研
越來越多的證據(jù)表明**相關(guān)巨噬細(xì)胞（TAMs）和外泌體在轉(zhuǎn)移前niche（生態(tài)位）形成中發(fā)揮重要作用。TAMs是轉(zhuǎn)移前生態(tài)位形成和結(jié)直腸*肝轉(zhuǎn)移(CRLM)的基礎(chǔ)。然而，**來源的外泌體miRNAs與TAMs相互作用的分子機(jī)制仍然很大程度上未知。本研究發(fā)現(xiàn)**來源外泌體miR-934可以誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化，進(jìn)而促進(jìn)CRC的肝轉(zhuǎn)移。該文于2020年11月發(fā)表在《Journal of Hematology and Oncology》IF：11.059期刊上。
1、miR-934表達(dá)升高與CRLM進(jìn)展及預(yù)后不良呈正相關(guān)
為了揭示參與CRLM的miRNA，作者基于TCGA數(shù)據(jù)庫比較了CRC的1期**和4期**的miRNA表達(dá)譜，發(fā)現(xiàn)miR-934是在4期**中高表達(dá)差異表達(dá)*****的miRNA（Fig.1a,b）。此外，作者將110個(gè)CRC組織按有無肝轉(zhuǎn)移分為兩組，發(fā)現(xiàn)肝轉(zhuǎn)移組與未轉(zhuǎn)移組相比，組織和血清miR-934表達(dá)上調(diào)（Fig.1c,d）。接下來，為了研究miR-934在CRLM進(jìn)展中的作用，使用ISH比較了miR-934在包含308個(gè)CRC樣本的組織芯片(TMA)中的表達(dá)，與正常粘膜組織相比，CRC組織中miR-934的表達(dá)明顯上調(diào);miR-934表達(dá)增加與T分期、M分期、晚期AJCC分期和**復(fù)發(fā)呈正相關(guān)，尤其是在肝轉(zhuǎn)移的病例中（Fig.1e）。
成都細(xì)胞發(fā)育與分化科研
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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