6）Pex衍生的CD44v6和C1QBP的高表達(dá)預(yù)示著PDAC患者的肝轉(zhuǎn)移和低生存率
采用免疫組化和westernblot檢測肝轉(zhuǎn)移灶周圍肝組織和正常肝組織的纖維化ECM微環(huán)境。與體內(nèi)實(shí)驗(yàn)一致，纖維連接蛋白、I型膠原和α-SMA水平***升高，而玻連蛋白和固生蛋白C水平下調(diào)(圖7A，B)。接下來，我們研究了外泌體衍生CD44v6和C1QBP在PDAC患者中的預(yù)后價值。外泌體CD44v6和C1QBP在PDAC組織中的表達(dá)明顯高于正常胰腺組織(圖7C)。此外，有肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達(dá)明顯高于無肝轉(zhuǎn)移的PDAC患者(圖7C)。免疫電鏡顯示，CD44v6和C1QBP在PDAC組織來源的EVs***表達(dá)(圖7D)。Pex中CD44v6和C1QBP高表達(dá)的患者比其他患者更容易發(fā)生肝轉(zhuǎn)移(圖7E)。 專注于生命科學(xué)內(nèi)的前沿研究。WB科研中標(biāo)率高
為了闡明miR-934是否主要來源于CRC細(xì)胞的外泌體，使用GW4869抑制CRC細(xì)胞的外泌體分泌，發(fā)現(xiàn)miR-934在CRC細(xì)胞來源的外泌體中的表達(dá)水平明顯高于外泌體耗盡的CRC細(xì)胞（Fig.2h）。此外，采用qPCR分析miR-934在總CM、外泌體耗盡CM(超離心耗竭)和外泌體中的表達(dá)，結(jié)果顯示，miR-934在總CM或外泌體中的表達(dá)***高于外泌體缺失的CM（Fig.2i）。此外，使用qPCR研究了上述四種CRC細(xì)胞系的外泌體中miR-934的表達(dá)，發(fā)現(xiàn)外泌體中miR-934的表達(dá)模式與CRC細(xì)胞CM中的表達(dá)模式一致（Fig.2j）。以上結(jié)果表明miR-934主要包裹在CRC細(xì)胞來源的外泌體中。血管生產(chǎn)因子科研實(shí)驗(yàn)外包大黃酸導(dǎo)致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。
結(jié)腸*(CRC)是世界上第三常見的**，也是**相關(guān)死亡的主要原因。*細(xì)胞迅速擴(kuò)張，所有實(shí)體瘤由于血管化不足而經(jīng)歷缺氧。缺氧是實(shí)體**的一個標(biāo)志，它促進(jìn)細(xì)胞生長、生存和轉(zhuǎn)移，并對化療和放療產(chǎn)生耐藥性。缺氧反應(yīng)主要由轉(zhuǎn)錄因子缺氧誘導(dǎo)因子1α(HIF-1α)和HIF-2α介導(dǎo)，而HIF-1α和HIF-2α在CRC中表現(xiàn)出不同的作用。我們的研究表明，**細(xì)胞依賴于HIF-2α的一種機(jī)制脆弱性，可用于CRC***。該研究2021年6月發(fā)表在《JOURNALOFCLINICALINVESTIGATION》，IF為14.808。
MT2受體可能參與褪黑素對TBI引起的鐵死亡的保護(hù)作用
為了闡明褪黑素的保護(hù)TBI作用是否依賴于褪黑素受體，首先確定了TBI后褪黑素受體（MT1和MT2）的表達(dá)模式。從12小時到14天觀察到皮質(zhì)MT1和MT2表達(dá)顯著降低。此外，褪黑素可在24小時顯著改善褪黑素***的TBI小鼠大腦中MT1和MT2的損失。為了確定褪黑素的受體是否參與褪黑素對TBI引起的鐵死亡的保護(hù)作用，當(dāng)用Luzindole（褪黑素受體拮抗劑）或4P-PDOT（一種選擇性MT2受體拮抗劑）預(yù)處理小鼠時，我們發(fā)現(xiàn)用Luzindole和4P-PDOT進(jìn)行的預(yù)處理均消除了TBI后24小時褪黑素對MT1和Cox2表達(dá)的影響。值得注意的是，用4P-PDOT預(yù)處理消除了褪黑素對MT2表達(dá)和GSH含量的修復(fù)作用，以及褪黑素對xCT和4HNE的影響。本研究的數(shù)據(jù)表明，MT2受體是主要的褪黑素受體亞型，可能參與了褪黑素對TBI引起的鐵死亡的保護(hù)作用。 英拜在全國各省會城市均有自己的**客戶。
與CRC細(xì)胞共培養(yǎng)可通過ALKBH3增加血細(xì)胞5’-tRF-GlyGCC
與所有檢測的CRC細(xì)胞共培養(yǎng)可***提高PENG-EBV細(xì)胞中的5’-tRF-GlyGCC水平。與CRC細(xì)胞共培養(yǎng)可***提高THP-1細(xì)胞中5’-tRF-GlyGCC水平。與所有CRC細(xì)胞共培養(yǎng)時，PENG-EBV細(xì)胞中ALKBH3mRNA的表達(dá)也明顯增加。westernblot分析證實(shí)，與CRC細(xì)胞共培養(yǎng)提高了PENG-EBV細(xì)胞中ALKBH3蛋白的表達(dá)。作者進(jìn)一步研究了ALKBH3是否參與CRC誘導(dǎo)的血細(xì)胞5’-tRF-GlyGCC。ALKBH3在PENG-EBV細(xì)胞中的表達(dá)被下調(diào)。結(jié)果表明，缺失ALKBH3可減弱SW620和SW480誘導(dǎo)的PENGE-EBV細(xì)胞中5’-tRF-GlyGCC的表達(dá)。提示CRC細(xì)胞可通過上調(diào)ALKBH3上調(diào)外周血5’-tRF-GlyGCC水平。 英拜專注高通量測序行業(yè)的整體服務(wù)。上海氨基酸代謝科研
血清或尿液中尿酸濃度的升高與痛風(fēng)腎臟和血管疾病密切相關(guān)。WB科研中標(biāo)率高
circNDUFB2抑制NSCLC進(jìn)展
體外研究表明circNDUFB2過表達(dá)顯著抑制了NSCLC細(xì)胞的增殖，遷移和侵襲，而circNDUFB2敲低顯著促進(jìn)了這些表型。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明circNDUFB2過表達(dá)可顯著抑制NSCLC細(xì)胞的致瘤性和轉(zhuǎn)移。這些數(shù)據(jù)表明circNDUFB2可能在NSCLC進(jìn)展中起抑制作用。
circNDUFB2與NSCLC細(xì)胞中的IGF2BP1/2/3相互作用
為了探索circNDUFB2是否通過與蛋白質(zhì)相互作用發(fā)揮功能，RNA pulldown來鑒定與其相關(guān)的蛋白質(zhì)。RNApulldown沉淀物通過SDS-PAGE分離。銀染后，切下約65 kDa的有義特異性條帶，并使用質(zhì)譜進(jìn)行分析。發(fā)現(xiàn)**個豐富的蛋白質(zhì)分別是IGF2BP2，IGF2BP1和IGF2BP3。使用Western blot和RIP分析證實(shí)了這一結(jié)果。此外， RNA FISH免疫熒光分析，發(fā)現(xiàn)circNDUFB2與IGF2BPs共定位在細(xì)胞質(zhì)中。為了探討IGF2BPs的KH域?qū)τ谂ccircNDUFB2之間的相互作用，構(gòu)建IGF2BPs突變體，KH結(jié)構(gòu)域突變明顯減少了IGF2BP與circNDUFB2之間的相互作用。接下來進(jìn)行了circNDUFB2突變，發(fā)現(xiàn)circNDUFB2突變顯著降低了IGF2BP與circNDUFB2之間的相互作用。 WB科研中標(biāo)率高
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)