4、CLF1敲除抑制小鼠HCC的生長和肺部轉(zhuǎn)移隨后,作者在體內(nèi)進(jìn)一步驗(yàn)證CLF1的功能。結(jié)果如圖3所以,敲除CFL1后***降低了HCC細(xì)胞的**體積和**,并減少了肺轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)數(shù)量。IHC表明CLF1的敲除也導(dǎo)致EMT相關(guān)蛋白的抑制。總之,CLF1敲除抑制小鼠HCC的生長和肺部轉(zhuǎn)移。
5、CFL1是HIF-1α在HCC細(xì)胞中的下游靶基因?yàn)榱岁U明低氧對(duì)HCC中CFL1表達(dá)的影響,將HCCLM3和Hep3B細(xì)胞在低氧培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48h。結(jié)果發(fā)現(xiàn)低氧誘導(dǎo)導(dǎo)致CFL1的表達(dá)升高,但是當(dāng)HIF-1α敲除后,低氧誘導(dǎo)并不能提高CFL1的表達(dá),并且使用HIF-1α的抑制劑處理HCCLM3和Hep3B細(xì)胞,也能降低因低氧誘導(dǎo)導(dǎo)致CFL1表達(dá)升高(圖4A-F)。ChIP-PCR檢測進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),HIF-1α和HIF-1β與HCC細(xì)胞CFL1啟動(dòng)子中的HRE直接結(jié)合(圖4G)。在低氧條件下,轉(zhuǎn)染HRE熒光素酶質(zhì)粒或CFL1啟動(dòng)子-熒光素酶質(zhì)粒的HEK293T細(xì)胞中熒光素酶報(bào)告基因活性升高(圖4H)。 英拜的實(shí)驗(yàn)室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。深圳抗體芯片科研
***我們來講一篇刊登在Nucleic Acids Research題名為MarkerDB: an online database of molecular biomarkers的文章。MarkerDB是一個(gè)整合已知臨床和選定的臨床前分子生物標(biāo)志物的數(shù)據(jù)庫,包括四種主要類型的分子生物標(biāo)記(化學(xué),蛋白質(zhì),DNA [遺傳]和核型)和四種生物標(biāo)記類別(診斷,預(yù)測,預(yù)后和暴露)。MarkerDB提供的信息包括:生物標(biāo)志物名稱和同義詞,相關(guān)條件或病理,詳細(xì)的疾病描述,詳細(xì)的生物標(biāo)志物描述,生物標(biāo)志物特異性,敏感性和ROC曲線,標(biāo)準(zhǔn)參考值(對(duì)于蛋白質(zhì)和化學(xué)標(biāo)志物),變體(對(duì)于SNP或遺傳標(biāo)志物) ),序列信息(用于遺傳和蛋白質(zhì)標(biāo)記),分子結(jié)構(gòu)(用于蛋白質(zhì)和化學(xué)標(biāo)記),組織或生物流體來源(用于蛋白質(zhì)和化學(xué)標(biāo)記),染色**置和結(jié)構(gòu)(用于遺傳和核型標(biāo)記),臨床批準(zhǔn)狀態(tài)和相關(guān)文獻(xiàn)參考。線粒體科研整體服務(wù)大黃酸處理對(duì)正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應(yīng)。
隨后,通過進(jìn)行spearman分析,研究了所有三組循環(huán)代謝產(chǎn)物豐度與腸道微生物群之間的聯(lián)系,以測試33個(gè)屬與52個(gè)代謝產(chǎn)物之間的關(guān)聯(lián),其中有11個(gè)代謝物與各屬均無***相關(guān)(圖7A)。其余甘油磷脂類只與一兩種屬相關(guān),而多不飽和脂肪酸(8-HETE, 8,9 - DiHETrE, 20-羥基二十甲酸)與至少7個(gè)屬***相關(guān)。此外,血清水蘇糖與瘤胃球菌1或2之間的相關(guān)性表明,PCOS大鼠血清水蘇糖水平降低與瘤胃球菌1豐度降低和瘤胃球菌2豐度增加有關(guān)(圖7B-C)。當(dāng)tempol干預(yù)改變瘤胃球菌_1和_2的豐度時(shí),PCOS大鼠血清水蘇糖水平升高。
1肺腺*(LUAD)細(xì)胞及其細(xì)胞系中均可通過選擇性剪接產(chǎn)生mRNAPD-L1亞型LncRNAPD-L1為探索LUAD不同階段PD-L1蛋白的表達(dá)量異,對(duì)PD-L1蛋白陽性和陰性樣品均進(jìn)行了mRNAPD-L1表達(dá)的檢測,結(jié)果在198bp和92bp處都擴(kuò)增出了條帶。Sanger測序結(jié)果顯示,198bp條帶與PD-L1mRNA序列相匹配,而92bp處條帶為非編碼亞型PD-L1(PD-L1-Lnc)。為進(jìn)一步證實(shí),設(shè)計(jì)了探針對(duì)缺失片段進(jìn)行檢測,在878bp和705bp處檢測出兩條條帶,878bp條帶與PD-L1mRNA序列相匹配,而705bp的條帶顯示與PD-L1mRNA相比,第4個(gè)外顯子中存在106nt的序列缺失,第5個(gè)和第6個(gè)外顯子之間存在67nt的缺失。通過BASESCOPE顯色實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在肺*組織中mRNAPD-L1(藍(lán)點(diǎn))和LncRNAPD-L1(紅點(diǎn))存在明顯的共表達(dá)接下來,作者設(shè)計(jì)了PD-L1mRNA和PD-L1-Lnc的特異性探針,對(duì)這些RN**段進(jìn)行定量,通過PCR探針擴(kuò)增并進(jìn)行qRT-PCR檢測,檢測到PD-L1蛋白陽性和陰性樣品中在PD-L1mRNA和PD-L1-ln數(shù)量一致。促進(jìn)胰腺*的生長和轉(zhuǎn)移。
1、在響應(yīng)CDK4/6抑制中瘤內(nèi)記憶類CD8+T細(xì)胞的表現(xiàn)
為了***評(píng)價(jià)CDK4/6抑制對(duì)抗**T細(xì)胞免疫的影響,使用多模式單細(xì)胞測序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或?qū)φ仗幚淼腗C38-OVA**小鼠的瘤內(nèi)T細(xì)胞群體(Fig.1A)。維度分析顯示MC38-OVA**中有10個(gè)不同的T細(xì)胞群(Fig.1B)。用CDK4/6i處理的**有較低頻率的CD4+調(diào)節(jié)性T細(xì)胞(Foxp3+Tregs),而CD8+記憶類T細(xì)胞頻率更高,以Tcf7、Sell、Bcl2和Cd7高表達(dá)為特征(Fig.1B-D)。CD8+T細(xì)胞池的基因動(dòng)態(tài)表達(dá)揭示來源于CDK4/6i處理的小鼠的CD8+**免疫浸潤(TILs)向更早、更像干細(xì)胞的分化狀態(tài)傾斜(Fig.1E-F)。與此一致,較早出現(xiàn)假時(shí)間軌跡的細(xì)胞表達(dá)更高水平的記憶相關(guān)基因(Tcf7,Sell,Il7r),和更低水平的效應(yīng)相關(guān)基因(Prf1,Gzmb)和耗損標(biāo)志物(PD-1,TIM3)(Fig.1G)。 降低腸上皮細(xì)胞尿酸的產(chǎn)生。細(xì)胞連接通路發(fā)現(xiàn)者科研地區(qū)科學(xué)基金
大黃酸處理改變腸道菌群組成。深圳抗體芯片科研
4)circPDE4B促進(jìn)了RIC8A和MID1之間的三元配合物的形成,促進(jìn)了RIC8A的降解
我們試圖鑒定參與RIC8A蛋白酶體降解的E3連接酶。有趣的是,MS結(jié)果顯示circPDE4B也結(jié)合了兩個(gè)E3連接酶,包括RNF2和MID1。然而,由于RNF2定位于細(xì)胞核內(nèi),我們選擇MID1進(jìn)行進(jìn)一步研究。實(shí)際上,通過免疫沉淀分析,MID1被發(fā)現(xiàn)與RIC8A結(jié)合(圖4A)。RIC8A和MID1的免疫熒光染色也證實(shí)了它們在HCs***定位(圖4B)。IP結(jié)果表明,MID1敲低有效地削弱了RIC8A和MID1過表達(dá)的泛素化作用,增加了RIC8A泛素化作用(圖4C)。Co-IP實(shí)驗(yàn)也顯示,與對(duì)照組相比,circPDE4B敲低細(xì)胞中RIC8A和MID1的結(jié)合減少,而過表達(dá)circPDE4B則有相反的作用(圖4D)。 深圳抗體芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)