確實(shí),MMTVneu**的caspase-3陽(yáng)性細(xì)胞比相應(yīng)的Pten+/+少;綜上所述,這些結(jié)果表明,PTEN不能被ATM磷酸化的細(xì)胞對(duì)基因毒性應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡具有抗性。為了評(píng)估表達(dá)PTEN-398A且DNA損傷未解決的細(xì)胞在輻照(圖2B, C和補(bǔ)充圖4B, C)后的持續(xù)存在是否是誘導(dǎo)凋亡反應(yīng)失敗的結(jié)果,我們?cè)贗R之前先用泛caspase抑制劑z-VAD-FMK (zVAD)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行預(yù)處理。與DMSO處理相比,zVAD增加了PTEN-WT細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量,其水平與DMSO處理的PTEN-398A細(xì)胞相當(dāng)(補(bǔ)充圖5F)。然而,需要注意的是,zVAD預(yù)處理也略微增加了IR后PTEN-398A細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。大黃酸處理對(duì)正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應(yīng)。代謝科研售后服務(wù)
1)UUO誘導(dǎo)的腎纖維化模型中TGF-β1的表達(dá)和外泌體的產(chǎn)生增加我們首先通過(guò)Masson三色染色、Sirius紅染色、westernblotting和免疫組化方法評(píng)估UUO-3d和UUO-7d模型腎纖維化和TGF-β1的表達(dá)。結(jié)果提示,TGF-β1表達(dá)和腎纖維化與梗阻天數(shù)呈正相關(guān)。為了進(jìn)一步闡明外泌體是否在UUO模型中發(fā)揮作用,我們進(jìn)行了透射電鏡、免疫熒光和westernblotting檢測(cè)。透射電鏡顯示UUO后細(xì)胞外囊泡分泌明顯增加。此外,許多細(xì)胞外囊泡的外泌體直徑為30-150nm。CD63和TSG101(外泌體標(biāo)記物)的Westernblot和免疫染色顯示,外泌體在UUO-3d組中明顯增加,在UUO-7d組中進(jìn)一步增加。此外,外泌體主要分布在腎小管上皮周圍。內(nèi)蒙古科研技術(shù)指導(dǎo)英拜生物提供專業(yè)的編輯潤(rùn)色團(tuán)隊(duì)保證服務(wù)到文章接收為止。
4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用
據(jù)報(bào)道,外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結(jié)合蛋白來(lái)轉(zhuǎn)運(yùn)。通過(guò)RNApull-down分析和質(zhì)譜分析,鑒定了三種可能參與miR-934轉(zhuǎn)運(yùn)的RNA結(jié)合蛋白,并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(dá)(Fig.4a,b)。hnRNPA2B1是一種RNA結(jié)合蛋白,通過(guò)與特定基序GGAG/CCCU結(jié)合,參與miRNAs的運(yùn)輸和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。特別是,由于miR-934序列中有兩個(gè)GGAG基序,我們推測(cè)hnRNPA2B1可能通過(guò)與GGAG序列結(jié)合,介導(dǎo)miR-934包裝成外泌體的過(guò)程。此外,miRNApull-down分析顯示,在細(xì)胞質(zhì)和外泌體中,miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結(jié)合關(guān)系,然而,突變miR-934的結(jié)合序列(GGAG)可削弱這種結(jié)合(Fig.4c)。RNA免疫沉淀分析進(jìn)一步證明,無(wú)論是在CRC細(xì)胞及其外泌體裂解物中,miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集(Fig.4d)。此外,敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細(xì)胞轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞的過(guò)程(Fig.4e)。因此,這些結(jié)果證實(shí)hnRNPA2B1可以通過(guò)與miR-934的GGAG序列結(jié)合,介導(dǎo)miR-934包裝到CRC細(xì)胞外泌體中,并將外泌體miR-934轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞中。
TFAP2B也有類似的模式,它調(diào)節(jié)遠(yuǎn)端腎單位的發(fā)育30。TFAP2B轉(zhuǎn)錄因子活性在粗升肢和遠(yuǎn)端曲小管中增加(圖3b,motif活性),TFAP2B染色質(zhì)可及性增加(圖3b,基因活性),TFAP2B轉(zhuǎn)錄增加(圖3b,基因表達(dá))。我們對(duì)遠(yuǎn)曲小管(DCT)、連接小管(CNT)和主細(xì)胞(PC)進(jìn)行了偽時(shí)間排序,這些細(xì)胞在snRNA和snATAC數(shù)據(jù)集中都形成了一組不同的轉(zhuǎn)錄相關(guān)細(xì)胞類型。在HNF4A中,觀察到近曲小管中有一個(gè)CCAN,在啟動(dòng)子、基因體和遠(yuǎn)端區(qū)域的差異開放區(qū)域(圖3c,紅框)之間有多個(gè)連接(紅色或藍(lán)色弧線)(圖3c)。外泌體miR-934誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化促進(jìn)CRC肝轉(zhuǎn)移。
5、CDK4/6預(yù)處理增強(qiáng)CAR-T細(xì)胞的持久性和有效性
接下來(lái)測(cè)試CDK4/6i處理是否會(huì)誘導(dǎo)嵌合抗原受體(CAR)-T細(xì)胞的記憶表型,并克服CAR-T細(xì)胞***成功的兩大障礙:T細(xì)胞耗竭和缺乏持久性。通過(guò)臨床試驗(yàn),以LewisY(LeY)抗原為靶點(diǎn),制造了人類CAR-T細(xì)胞(Fig.5A)并發(fā)現(xiàn)暴露于CDK4/6i產(chǎn)生CD4+和CD8+干細(xì)胞記憶(Tscm)CAR-T細(xì)胞(Fig.5B)。CAR-T細(xì)胞的3’RNA-seq揭示CDK4/6抑制后記憶表達(dá)***改變,GSEA分析證實(shí)了記憶相對(duì)效應(yīng)信號(hào)的富集,并如預(yù)期E2F靶基因下調(diào)(Fig.5C)。為了檢測(cè)在體內(nèi)的持久性,使用兩個(gè)**供體的PBMC生成的LeYCAR-T細(xì)胞用CDK4/6i預(yù)處理,并轉(zhuǎn)移到NSG小鼠中(Fig.5D)。與未經(jīng)處理的對(duì)照組相比,觀察到在移植后的幾周內(nèi),血液中CD8+和CD4+預(yù)處理的CAR-T細(xì)胞的頻率和數(shù)量***增加(Fig.5E-F)。為了評(píng)估這些CAR-T細(xì)胞的功能性記憶能力,在CAR-T細(xì)胞轉(zhuǎn)移后30天用LeY+卵巢*細(xì)胞系OVCAR-3(Fig.5D)處理小鼠,觀察到與未處理的CAR組相比,預(yù)處理的CAR-T細(xì)胞在小鼠血液中的擴(kuò)增***增加(Fig.5G)。 我們?cè)谌祟愐认?細(xì)胞系中過(guò)表達(dá)或敲除METTL14。泌尿科研整體服務(wù)
評(píng)估了成對(duì)*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達(dá)。代謝科研售后服務(wù)
背景:超過(guò)100個(gè)不同的RNA修改特征已經(jīng)在過(guò)去的幾十年里,其中,該N6-methyladenosine(m6A)修改是**豐富的形式在真核mRNA。不同的m6A讀者蛋白優(yōu)先區(qū)分轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)的RNAm6A景觀。在細(xì)胞質(zhì)中,大多數(shù)YTH(YTHDF1-3和YTHDC2)和IGF2BP(IGF2BP1-3)家族蛋白與m6a修飾的mrna結(jié)合并調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性和翻譯。此外,其他蛋白質(zhì)可以結(jié)合m6a修飾的前體rna在細(xì)胞核內(nèi),并影響其加工。
m6a相關(guān)基因缺陷影響多種生物過(guò)程。例如,metttl3的缺失導(dǎo)致受損的胚胎干細(xì)胞退出自我更新走向分化;抑制METTL14導(dǎo)致明顯的胚胎生長(zhǎng)遲緩;斑馬魚胚胎中YTHDF2的消融延遲了早期胚胎發(fā)育中的母-合子過(guò)渡。特別是,RNAm6a相關(guān)基因正在成為在各種**中促進(jìn)**啟動(dòng)和進(jìn)展的關(guān)鍵調(diào)控因子,包括肺*中的metttl3、肝*中的metttl14、白血病中的FTO和乳腺*中的ALKBH5。然而,m6A如何調(diào)節(jié)*變以及下游通路和機(jī)制如何傳遞這些信號(hào)尚不完全清楚。 代謝科研售后服務(wù)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過(guò)表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)