9）M1-Exos通過(guò)miR-155/SOCS6/p65軸加重了bEnd.3細(xì)胞的EndoMT
為了探討外泌體miR-155/SOCS6/p65軸在M1-Exos誘導(dǎo)的EndoMT中的作用，我們?cè)隗w外進(jìn)行了一系列功能喪失和功能獲得實(shí)驗(yàn)。我們發(fā)現(xiàn)，SOCS6過(guò)表達(dá)部分逆轉(zhuǎn)了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos誘導(dǎo)的TEER值降低和通透性增加(圖9A和B)。ZO-1和Occludin的熒光強(qiáng)度進(jìn)一步顯示SOCS6過(guò)表達(dá)***逆轉(zhuǎn)了miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos在bEnd.3細(xì)胞中引起的TJs破壞(圖9C)。此外，EndoMT標(biāo)記物的蛋白水平與這些結(jié)果一致，SOCS6上調(diào)可消除miR-NCOE-Exos或miR-155OE-Exos介導(dǎo)的p65上調(diào)(圖9D)。值得注意的是，當(dāng)miR-NCKD-Exos或miR-155KD-Exos下調(diào)SOCS6時(shí)，則出現(xiàn)相反的結(jié)果(圖9E-H)。 課題CRO服務(wù)找上海英拜。泌尿課題服務(wù)兩年
4.篩選關(guān)鍵模塊（hubmodule）并進(jìn)行富集分析分析發(fā)現(xiàn)，棕色模塊與CD8+T細(xì)胞***相關(guān)（R2=-0.05，P=9e-05），因此選擇棕色模塊為hubmodule進(jìn)行富集分析。
5.在hubmodule中篩選出關(guān)鍵基因（hubgene）并驗(yàn)證為了研究與樞紐模塊中CD8+T細(xì)胞浸潤(rùn)相關(guān)的潛在樞紐基因，構(gòu)建了蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò)[臨界標(biāo)準(zhǔn)：reliability>0.7andconnectivity>15(node/edge)]將hubmodule中的基因識(shí)別為中心節(jié)點(diǎn)，并通過(guò)Cytoscape對(duì)其進(jìn)行可視化;對(duì)hubmodule中所有基因進(jìn)行基于TCGA數(shù)據(jù)的預(yù)后分析，八個(gè)基因（CLCN2，ERLIN2，F(xiàn)5，F(xiàn)AM107B，GFM1，HSPB3，METTL8和SYT3）與LSCC患者的預(yù)后相關(guān)，接下來(lái)對(duì)這8個(gè)基因進(jìn)行差異表達(dá)分析，六個(gè)基因（GFM1，HSPB3，SYT3，ERLIN2，METTL8和CLCN2）在LSCC組織中顯著差異表達(dá)。
課題中標(biāo)率高可以上傳原始的fast文件。
一、YTHDF1在胃*中的過(guò)表達(dá)
通過(guò)評(píng)估YTHDF1突變的分布，我們發(fā)現(xiàn)65%的突變是基因擴(kuò)增，這通常會(huì)導(dǎo)致基因產(chǎn)物的過(guò)表達(dá)(圖1A).通過(guò)對(duì)TCGA數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)YTHDF1在胃*患者中的表達(dá)確實(shí)明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高表達(dá)與胃*進(jìn)展(圖1C)和較差的總生存期(圖1D)相關(guān)。對(duì)正常胃組織和胃*標(biāo)本進(jìn)行免疫組化分析，證實(shí)**組織中YTHDF1蛋白表達(dá)上調(diào)(圖1F)。此外，YTHDF1在胃*患者中的異常高表達(dá)與更嚴(yán)重的臨床病理特征(如神經(jīng)周圍侵犯、侵襲性**分期(III/IV期vs.I/II期)、靜脈侵犯等***相關(guān)(圖1G）。KaplanMeier生存分析也顯示，YTHDF1高表達(dá)的胃*患者4年總生存期較差。綜上所述，YTHDF1在胃*發(fā)生中具有潛在的致瘤作用。
創(chuàng)傷性腦損傷（TBI）是重要的健康問(wèn)題，每年有超過(guò)5000萬(wàn)新發(fā)TBI病例。在TBI的病理生理過(guò)程中，會(huì)發(fā)生各種形式的細(xì)胞死亡，包括細(xì)胞凋亡，壞死，程序性壞死，自噬，焦亡和鐵死亡。目前尚未充分挖掘TBI中鐵死亡的發(fā)病機(jī)理。***我們講一篇蘇州大學(xué)團(tuán)隊(duì)在JOURNALOFPINEALRESEARCH（IF=）期刊發(fā)表的題名為DeletionofferritinHinneuronscounteractstheprotectiveeffectofmelatoninagainsttraumaticbraininjury-inducedferroptosis的文獻(xiàn)。該文獻(xiàn)主要講述褪黑素通過(guò)FTH調(diào)節(jié)TBI中鐵死亡。褪黑素可減輕TBI引起的鐵死亡為了確定褪黑素是否可以挽救TBI引起的鐵死亡，在相應(yīng)的高峰表達(dá)（例如1天和3天）進(jìn)行了與鐵死亡相關(guān)蛋白的蛋白質(zhì)印跡分析。發(fā)現(xiàn)褪黑素給藥在TBI后1天***了TBI誘導(dǎo)的xCT，Cox2，Tfr1，F(xiàn)pn和Nox2蛋白表達(dá)的上調(diào)。同樣，褪黑素***在TBI后3天阻止了Fth，F(xiàn)tl和4HNE蛋白的表達(dá)。用促鐵蛋白抑制劑liproxstatin-1（Lip-1）也獲得了相似的結(jié)果。此外，免疫組化染色顯示，與對(duì)照組相比在TBI后第7天，褪黑素和Lip-1的處理減少了神經(jīng)元中4HNE陽(yáng)性細(xì)胞的數(shù)量，表明褪黑素對(duì)TBI誘導(dǎo)的脂質(zhì)具有神經(jīng)保護(hù)作用過(guò)氧化。褪黑素和Lip-1均***TBI誘導(dǎo)的皮質(zhì)GSH水平降低。 公共比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。
病理上，脊髓損傷(SCI)后血脊髓屏障(BSCB)破裂導(dǎo)致大量周圍巨噬細(xì)胞浸潤(rùn)到損傷區(qū)域，并在新生血管周圍聚集。M1極化的巨噬細(xì)胞在SCI過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用。***小編給大家介紹于2020年3月發(fā)表在影響因子為9.986的“Redox Biology”上的文章“Exosomal miR-155 from M1-polarized macrophages promotes EndoMT and impairs mitochondrial function via activating NF-κB signaling pathway in vascular endothelial cells after traumatic spinal cord injury”。本研究旨在探討M1極化的骨髓源性巨噬細(xì)胞(M1-BMDMs)對(duì)血管內(nèi)皮細(xì)胞的影響及其機(jī)制。在本研究中，我們發(fā)現(xiàn)SCI后巨噬細(xì)胞浸潤(rùn)可通過(guò)傳遞外泌體miR-155促進(jìn)血管內(nèi)皮細(xì)胞內(nèi)內(nèi)膜結(jié)構(gòu)和損害線粒體功能，從而加重BSCB完整性破壞，miR-155隨后通過(guò)抑制SOCS6誘導(dǎo)的p65降解，***NF-κB通路。提供分子生物以及到后續(xù)動(dòng)物建模的一整套服務(wù)。醫(yī)學(xué)相關(guān)課題整體服務(wù)
也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。泌尿課題服務(wù)兩年
RBM17促進(jìn)PTC細(xì)胞的增殖和遷移，并在PTC**組織中升高
接下來(lái)探究RBM17在PTC細(xì)胞中的功能，RBM17的mRNA和蛋白表達(dá)在K1細(xì)胞系中遠(yuǎn)低于TPC-1和BC***細(xì)胞，其表達(dá)趨勢(shì)類似于tiRNA-Gly（圖4A-B）。于是構(gòu)建了RBM17過(guò)表達(dá)的K1細(xì)胞系，發(fā)現(xiàn)其增殖和遷移曾麗***增加（圖4C-F）。RBM17敲低則效果相反（圖4G-J）。此外，RBM蛋白表達(dá)在PTC**組織中***高于*旁組織（圖4K）。以上結(jié)果表明RBM17的作用和tiRNA-Gly相似，在PTC中促進(jìn)**進(jìn)展。
RBM17的衰減抑制了tiRNA-Gly對(duì)PTC細(xì)胞的影響，RBM17在PTC組織中的表達(dá)受tiRNA-Gly的調(diào)控
隨后，作者分別檢測(cè)了人PTC組織中tiRNA-Gly高表達(dá)和tiRNA-Gly低表達(dá)的組織樣本中RBM17的表達(dá)水平，結(jié)果發(fā)現(xiàn)與預(yù)期一致，tiRNA-Gly高表達(dá)組RBM17的表達(dá)也***高于tiRNA-Gly低表達(dá)組（圖5A）。進(jìn)行了類似于拯救實(shí)驗(yàn)，即過(guò)表達(dá)tiRNA-Gly組，敲除RBM17組，以及過(guò)表達(dá)tiRNA-Gly的同時(shí)敲除RBM17組，結(jié)果表明，tiRNA-Gly過(guò)表達(dá)+siRBM17同時(shí)處理可以部分消除單獨(dú)處理時(shí)引起的TPC-1和BC***細(xì)胞增殖和遷移的改變（圖5B-C）。體內(nèi)實(shí)驗(yàn)表明，tiRNA-Gly敲低導(dǎo)致RBM17的表達(dá)急劇性下降（圖5D）?？傊瑃iRNA-Gly對(duì)PTC增殖和遷移的作用依賴于RBM17。 泌尿課題服務(wù)兩年
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6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)