為了探索 HIF1α促進(jìn)circMYH9表達(dá)的分子機(jī)制，測量了 MYH9 前體 mRNA 的表達(dá)。SG或Glu饑餓增加了MYH9的前體mRNA 水平，HIF1α敲低降低了缺乏SG或Glu的CRC細(xì)胞中的MYH9前體 mRNA 水平。這些結(jié)果表明HIF1α在轉(zhuǎn)錄水平上促進(jìn) MYH9 前體 mRNA，這進(jìn)一步增加了circMYH9。使用 JASPAR 搜索了MYH9啟動子中的HIF1α結(jié)合位點和基序。確定了兩個**可能的HIF1α結(jié)合位點。ChIP-qPCR 證明 HIF1α與HCT116細(xì)胞中MYH9 啟動子的兩個HBS位點結(jié)合。為了證實HIF1α通過HBS促進(jìn)MYH9表達(dá)，構(gòu)建了包含全長MYH9啟動子區(qū)域和HBS缺失的circMYH9啟動子區(qū)域的熒光素酶報告基因。HBS1或HBS2的缺失部分消除了HIF1α敲低或過表達(dá)對MYH9 熒光素酶報告基因活性的抑制或促進(jìn)，而HBS1和HBS2的缺失則完全消除了 HIF1α shRNA 或質(zhì)粒對MYH9熒光素酶報告基因活性的影響。這些數(shù)據(jù)表明，HBS區(qū)域?qū)τ赟G或Glu剝奪下的HIF1α依賴性circMYH9轉(zhuǎn)錄調(diào)控至關(guān)重要。表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點的***有關(guān)。課題服務(wù)價格
5、血漿外泌體S100A4和OPN水平聯(lián)合可以作為HCC患者術(shù)后的強(qiáng)力預(yù)后因子
在168例接受肝切除術(shù)的HCC患者中，進(jìn)一步研究了血漿外泌體S100A4和OPN水平的臨床意義。結(jié)果發(fā)現(xiàn)外泌體S100A4水平和OPN的表達(dá)***正相關(guān)，并且外泌體S100A4低表達(dá)組患者的總體生存率和無疾病生存率要***高于外泌體S100A4高表達(dá)組（圖6b-d）。隨后，基于外泌體S100A4水平和OPN水平的聯(lián)合分析，將患者分為4組，結(jié)果發(fā)現(xiàn)雙低水平S100A4和OPN組具有比較好的預(yù)后，而雙高組則預(yù)后**差（圖6e-f）。 生物相關(guān)課題外泌體CD44v6和C1QBP可能是預(yù)測PDAC患者預(yù)后的有前途的生物標(biāo)志物。
七、YTHDF1-FZD7-b-catenin軸促進(jìn)胃*進(jìn)展
和B, Western blot分析YTHDF1、FZD7、B -catenin和***的B -catenin在YTHDF1敲低的MGC-803 (A)和HGC-27 (B)細(xì)胞中轉(zhuǎn)染FZD7構(gòu)建物或空載體對照。C和D，如上所述MGC-803 (C)和HGC-27 (D)細(xì)胞的增殖。E，如上所述MGC-803(左)和HGC-27(右)細(xì)胞的遷移分析。F，如上所述MGC-803(左)和HGC-27(右)細(xì)胞的侵襲分析。G，熱圖顯示YTHDF1, FZD7，(總)b-catenin在人胃*樣本中的表達(dá)結(jié)果(n= 79)。H, YTHDF1、FZD7和(總)b-catenin在人胃*樣本中的表達(dá)的相關(guān)性分析(n= 79;Pearson和Spearman相關(guān)檢驗)。I，三對胃**及鄰近正常組織中YTHDF1、FZD7、活化b-catenin的代表性IHC芯片結(jié)果。J，胃*患者YTHDF1、FZD7、(total) b-catenin (low, n 39; high, n 40)及總生存率Kaplan Meier分析(log-rank with Mantel Cox test)。K，顯示YTHDF1如何調(diào)節(jié)b-catenin信號通路促進(jìn)胃*進(jìn)展的示意圖。
TransCirc數(shù)據(jù)庫整合了各種與翻譯相關(guān)的證據(jù)，檢索的結(jié)果能直觀的呈現(xiàn)翻譯產(chǎn)物的相關(guān)證據(jù)信息。數(shù)據(jù)共分析了328080種已知人類circRNA的翻譯潛能，有蛋白質(zhì)譜證據(jù)（MS）的circRNA有168個，核糖體印跡或多聚核糖體分析（RP/PP）的證據(jù)4284個circRNA，潛在翻譯產(chǎn)物序列分析（SeqComp）的301100個circRNA。有IRES預(yù)測結(jié)果的314138個circRNA，有m6A修飾位點信息的39397個circRNA，有翻譯起始位點信息（TIS）的9394個circRNA，有ORF信息的305016個circRNA。ATM對PTEN的磷酸化驅(qū)動細(xì)胞周期進(jìn)程。
為了確定EVs介導(dǎo)的ELNAT1在體內(nèi)促進(jìn)LN轉(zhuǎn)移，首先構(gòu)建一個小鼠腘窩的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移模型。小鼠隨機(jī)分為2組（n=12），每3天接受由載體（UM-UC-EVVector）或ELNAT1（UM-UC-3-EVELNAT1）轉(zhuǎn)染的UM-UC-3細(xì)胞分泌的EVs瘤內(nèi)注射，當(dāng)原發(fā)**大小達(dá)到200mm3時采集**和腘窩的LNs（Figure3D）。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，通過體內(nèi)成像系統(tǒng)（IVIS）發(fā)現(xiàn)，與UM-UC-EVVector相比，UM-UC-3-EVELNAT1促進(jìn)了UM-UC-3細(xì)胞向腘窩LNs的轉(zhuǎn)移，LNs體積更大（Figure3E-I）。
由于淋巴管生成是淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵步驟，因此進(jìn)一步評估了EVs介導(dǎo)的ELNAT1在體內(nèi)對淋巴管生成的影響。結(jié)果顯示，UM-UC-3-EVELNAT1組***增加了小鼠足底**瘤內(nèi)和瘤旁區(qū)域的淋巴管內(nèi)皮透明質(zhì)酸受體1陽性（LYVE-1positive）（Figure3J,K）。以上結(jié)果表明，EVs介導(dǎo)的ELNAT1促進(jìn)BCa體內(nèi)淋巴管生成和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。 進(jìn)一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細(xì)胞對基因毒性損傷的反應(yīng)。推廣課題服務(wù)兩年
我們使用抗體陣列評估了表達(dá)PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性。課題服務(wù)價格
7.EVs介導(dǎo)的ELNAT1被HLECs內(nèi)化以誘導(dǎo)淋巴管生成
共聚焦顯微鏡顯示HLECs中PKH67標(biāo)記EVs孵育后的點狀熒光強(qiáng)度（Figure7A），表明HLECs內(nèi)化了BCa分泌的EVs。此外,孵化UM-UC-3-EVELNAT1***上調(diào)HLECs中ELNAT1表達(dá),而孵化T24-EVsi-ELNAT1，則T24細(xì)胞分泌的EVs中ELNAT1表達(dá)下調(diào)，則削弱了HLECs中EVs誘導(dǎo)ELNAT1過表達(dá)的能力（Figure7B,C）。為了排除淋巴血管生成是由內(nèi)源性ELNAT1***HLECs中誘導(dǎo)的可能性，構(gòu)建了ELNAT1-KOHLECSELNAT1（HLECsELNAT1-KO）模型（Figure7D,E）。與HLECsELNAT1-WT一致，我們觀察到，EVs介導(dǎo)的ELNAT1過表達(dá)增強(qiáng)了HLECsELNAT1-KO的管狀形成和遷移能力，而下調(diào)ELNAT1則抑制了BCa細(xì)胞分泌EVs誘導(dǎo)HLECsELNAT1-KO管狀形成和遷移的能力（Figure7F-H）。這表明BCa細(xì)胞分泌的EVs通過運(yùn)輸EVs介導(dǎo)的ELNAT1促進(jìn)淋巴管生成，而不是轉(zhuǎn)錄***內(nèi)源性的ELNAT1。綜上所述，這些結(jié)果表明EVs介導(dǎo)的ELNAT1被HLECs內(nèi)化誘導(dǎo)BCa淋巴管生成。 課題服務(wù)價格
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗