該數(shù)據(jù)庫還將解剖學(xué)及其相關(guān)表型與環(huán)境化學(xué)物質(zhì)聯(lián)系起來,使它們可計算用于薈萃分析,并使 CTD 中化學(xué)和表型景觀的解剖學(xué)視角成為可能。2020 年, CTD 利用醫(yī)學(xué)主題詞中“解剖學(xué)”分支的修改子集作為其受控詞匯源,其中包括 1799 個用于解剖結(jié)構(gòu)和區(qū)域、生理系統(tǒng)、流體和組織、細胞和亞細胞成分的術(shù)語。 目前,CTD中超過247000種化學(xué)-表型相互作用使用了870個解剖學(xué)術(shù)語。 用戶可以通過選擇門戶圖標向下鉆取可導(dǎo)航層次結(jié)構(gòu)或使用 CTD 關(guān)鍵字搜索框中的“解剖”選擇列表選項,從主頁訪問 CTD Anatomy。CTD Anatomy 頁面組織和合并數(shù)據(jù),允許用戶從解剖學(xué)角度探索交互;這可用于識別不同生理系統(tǒng)(例如腎臟、肝臟、大腦和心血管系統(tǒng))獨有或共享的化學(xué)物質(zhì)和表型,或發(fā)現(xiàn)例如影響影響的 1158 種化學(xué)物質(zhì) 心臟中有 600 種表型。同樣,已經(jīng)開始將 CTD 暴露與 CTD 解剖學(xué)相結(jié)合,使環(huán)境健康科學(xué)家能夠調(diào)查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學(xué)應(yīng)激誘導(dǎo)表型的細節(jié)。***,為了幫助提高數(shù)據(jù)庫的互操作性。醫(yī)學(xué)整體課題外包服務(wù)。生物相關(guān)課題省自然科學(xué)基金
隸屬于隸屬于梭狀芽孢桿菌目丁酸生成菌在移植后早期的腸道中枯竭,而變形菌門和乳酸菌門(如腸球菌)豐度增加,可能由于缺乏丁酸時腸腔內(nèi)的氧氣水平增加和***素耐藥性所致。然而,到目前為止,HSCT患者的微生物群動態(tài)主要在HSCT后的***個月進行詳細監(jiān)測,而不是長期監(jiān)測。因此,目前尚不清楚微生物群是否以及何時恢復(fù)到造血干細胞移植前類似微生物群落結(jié)構(gòu)。條件誘導(dǎo)的腸上皮通透性可促進細菌易位和菌血癥,被認為是急性移植物抗宿主病(aGvHD)發(fā)病機制的第一步。急性GvHD是同種異體造血干細胞移植的常見副作用,同種異體供體T細胞對宿主體內(nèi)健康組織(包括腸道上皮)表現(xiàn)出細胞毒性活性。根據(jù)受影響***的程度,急性GvHD的嚴重程度可分為四個等級:0級I表現(xiàn)為無或輕度,II級IV表現(xiàn)為中度至重度aGvHD。**近,研究表明較低的腸道微生物群多樣性與aGvHD和aGvHD死亡率相關(guān),并且某些細菌類群在HSCT后可能參與促進aGvHD。然而,在HSCT之前的微生物群組成是否在預(yù)測可能的aGvHD嚴重程度方面具有預(yù)測價值尚未被檢驗,本研究對此進行了探討。常規(guī)課題售后服務(wù)提供整體課題外包實驗構(gòu)思。
鑒于以上結(jié)果,作者想進一步探究tiRNA-Gly與RBM17作用的分子結(jié)果。結(jié)果顯示,tiRNA-Gly可提高總RBM17蛋白的水平,但是不影響RBM17的mRNA水平(圖3H-I)。隨后,用蛋白質(zhì)合成抑制劑環(huán)己胺(CHX)處理細胞,tiRNA-Gly轉(zhuǎn)染后增加了K1細胞內(nèi)源性RBM17蛋白的半衰期,而β-actin作為對照(圖3J)。此外,蛋白酶體抑制劑MG132處理后,內(nèi)源性RBM17在轉(zhuǎn)染tiRNA-Gly的K1細胞中的積累量**高于轉(zhuǎn)染siRNA-NC的K1細胞,表明tiRNA-Gly抑制了蛋白酶體依賴性的PTC細胞中RBM17的降解(圖3K)。此外,tiRNA-Gly的過表達***抑制了泛素化RBM17的水平(圖3L)。綜上所述,tiRNA-Gly可以穩(wěn)定RBM17蛋白通過泛素/蛋白酶體依賴性降解。
在第7天,腺泡的大小沒有明顯變化(圖2k)。第14天,Myc-INPP4BWT而不是MycINPP4BC842A表達MCF-10A的細胞形成了更大的腺泡(1.8倍),每個腺泡的細胞數(shù)量比載體對照增加了1.4倍(圖2ln)。過表達INPP4B促進MCF-10A細胞增殖,但不影響細胞的尖基底極性和細胞凋亡。與此一致的是,過表達Myc-INPP4BWT而不是Myc-INPP4BC842A在血清剝奪后的單層培養(yǎng)中增強了MCF-10A細胞的增殖(1.7倍)(圖2o,p)。
總之,這一數(shù)據(jù)與INPP4B以PI(3,4)P2-磷酸酶依賴的方式促進pik3a突變體ER+乳腺*和pik3a野生型乳腺上皮細胞增殖的解釋相一致。 致力于醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的實驗技術(shù)服務(wù)和相關(guān)生物醫(yī)學(xué)課題的研究。
2021年5月,***一篇發(fā)表在cancer research(IF=12.7000)的文章(YTHDF1 Promotes Gastric Carcinogenesis by Controlling Translation of FZD7)。此研究分析了cBioPortal (cBio cancer Genomics Portal)630例原發(fā)性胃腺*數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)YTHDF1(m6A讀取蛋白)的突變主要是基因擴增,導(dǎo)致其過表達。YTHDF1的高表達與更具侵襲性的**進展和較差的總生存期相關(guān)。抑制YTHDF1在體內(nèi)外均可抑制胃*細胞增殖和**發(fā)生。在機制上,YTHDF1以m6依賴的方式促進了Wnt關(guān)鍵受體frizzled7 (FZD7)的翻譯,突變的YTHDF1增強了FZD7的表達,導(dǎo)致Wnt/b-catenin通路的過度***,促進了胃*的發(fā)生。我們的研究結(jié)果表明,YTHDF1及其m6a介導(dǎo)的Wnt/b-catenin信號通路在胃*中的致*作用,為靶向此類表觀遺傳調(diào)控因子提供了一種新的方法進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應(yīng)。生物相關(guān)課題推薦咨詢
上海英拜提供課題外包服務(wù)。生物相關(guān)課題省自然科學(xué)基金
在體外,上調(diào)UCP1減少AKI期間的脂質(zhì)積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬
自噬已被證實在AKI中發(fā)揮重要作用。因此,自噬已經(jīng)成為我們關(guān)注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉(zhuǎn)染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中,自噬相關(guān)指標顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示,上調(diào)UCP1消除AKI中的脂質(zhì)積累后,細胞自噬得到促進(圖7C)?;谶@些發(fā)現(xiàn),為了驗證自噬在UCP1功能中的重要性,我們進行了功能恢復(fù)實驗。如圖7D-F所示,氯喹抑制自噬***逆轉(zhuǎn)了順鉑組UCP1引起的炎癥指標下降。同樣,TUNEL染色顯示,使用氯喹抑制自噬,可以明顯逆轉(zhuǎn)UCP1促進的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結(jié)果表明,脂質(zhì)積累通過作用于AKI細胞自噬,在調(diào)節(jié)細胞功能方面發(fā)揮著重要作用。 生物相關(guān)課題省自然科學(xué)基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學(xué)實驗