再生胰腺中胰腺巨噬細(xì)胞的動態(tài)轉(zhuǎn)錄組譜
為了進(jìn)一步了解 AP 恢復(fù)過程中巨噬細(xì)胞的表型和功能，分離出胰腺巨噬細(xì)胞用于 RNA-seq 分析。顯著性差異表達(dá)基因繪制熱圖。為了評估這些基因簇的功能，使用網(wǎng)絡(luò)工具 DAVID Gene Ontology (GO) 進(jìn)行了功能注釋分析。值得注意的是，在急性炎癥期（簇32，D1 特征簇）高度表達(dá)的基因特別富集炎癥反應(yīng)和 CCR2 依賴性趨化性。簇 25 和 27 包含在 ADM 階段（第 3 天）高表達(dá)的基因，具有不同的表達(dá)模式和功能，表明該階段的巨噬細(xì)胞異質(zhì)性。例如，與ECM-受體相互作用和PI3K-AKT信號通路相關(guān)的基因在簇27中富集，而與細(xì)胞周期相關(guān)的基因在簇25中富集。 外泌體CD44v6和C1QBP可能是預(yù)測PDAC患者預(yù)后的有前途的生物標(biāo)志物。壞死性小腸結(jié)腸炎小鼠模型
對離體培養(yǎng)的Maoa野生型和KO BMMDs中ROS水平的測定也顯示，在IL-4/IL-13刺激或不刺激下，Maoa KO BMMDs中ROS水平降低，與體內(nèi)TAM結(jié)果一致（圖4d）。向IL-4/ IL-13刺激的Maoa WT和KO BMDMs補(bǔ)充H2O2可將其細(xì)胞內(nèi)ROS水平提高到相似水平，并消除它們在免疫抑制標(biāo)記物和特征基因表達(dá)的差異（圖4e-g）。另一方面，補(bǔ)充酪氨酸(MAO-A的底物)可增加ROS水平，并上調(diào)免疫抑制基因在Maoa WT BMDMs中的表達(dá)，但在Maoa KO BMDMs中不上調(diào)（圖4h-j）。綜上所述，這些數(shù)據(jù)表明MAO-A通過調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞內(nèi)ROS水平來調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞的免疫抑制極化。肝損傷課題CRO可以推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。
然后使用單細(xì)胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄譜（Fig. 4G）。使用pseudobulk RNA-seq分析和預(yù)轉(zhuǎn)移體外培養(yǎng)的基因比較，生成了持續(xù)細(xì)胞的基因標(biāo)記，其標(biāo)志是記憶相關(guān)基因(Sell，F(xiàn)oxp1，Tcf7，Cd7，Il7r，Klf2，Ccl5)的高表達(dá)和效應(yīng)相關(guān)基因(Gzmd，Ifng，Prf1，Gzma，Gzmb)的低表達(dá)(Fig. 4H-I)。對先前的體外單細(xì)胞數(shù)據(jù)（Fig. 2H-J）的進(jìn)一步分析顯示，CDK4/6i處理后，具有這種持續(xù)性特征的細(xì)胞頻率從7.5%增加至26.8%（Fig. 4J-K）。這些數(shù)據(jù)表明，抑制CDK4/6促進(jìn)T細(xì)胞向真實(shí)的記憶表型分化，其特征是功能的長期持久性。
2、hUC-MSCs增加MRL/lpr小鼠脾CD4+T細(xì)胞的衰老通過Sirt1/p53信號
作者推測hUC-MSCs***MRL/lpr小鼠的潛在機(jī)制可能是通過增強(qiáng)CD4+T細(xì)胞的衰老來抑制其積累。為了驗(yàn)證這一點(diǎn)，作者從脾細(xì)胞懸液中分離出單核細(xì)胞，然后純化CD4+T細(xì)胞用于RNA和蛋白質(zhì)制備。測量了p21和p16水平作為早衰的標(biāo)記物。結(jié)果顯示與WT對照組相比，p21和p16的mRNA和蛋白質(zhì)水平在MRL/lpr小鼠中***降低，與此同時，與接受PBS處理的MRL/lpr小鼠相比，p21和p16的mRNA和蛋白表達(dá)在hUC-MSCs***組中***增加(圖2A-C)。研究還發(fā)現(xiàn)，與WT小鼠相比，MRL/lpr脾臟CD4+T細(xì)胞的Sirt1表達(dá)水平升高，在Lys-379位點(diǎn)的p53乙酰化水平降低，而hUC-MSCs***可以通過降低Sirt1水平、增加p53水平和p53乙?；絹砟孓D(zhuǎn)這一變化(圖2C-E)?？傊?，上述結(jié)果提示，MRL/lpr小鼠脾臟CD4+T細(xì)胞的衰老可能是有缺陷的由于Sirt1/p53的信號改變導(dǎo)致，這可能導(dǎo)致CD4+T細(xì)胞的過度增殖。因此，hUC-MSCs的臨床作用可能與脾CD4+T細(xì)胞衰老通路的恢復(fù)有關(guān)。 小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細(xì)胞分離的外泌體呈現(xiàn)典型的外泌體結(jié)構(gòu)。
7、LncHrt對梗死心臟的***潛力
在證明LncHrt可以保護(hù)心臟免受心肌梗死損傷后，接下來探討LncHrt是否可以作為***梗死心臟的潛在***靶點(diǎn)。MI后向心肌內(nèi)注射AAV9-LncHrt或AAV9-CTRL，并持續(xù)監(jiān)測LncHrt的表達(dá)，直至其在兩組間表現(xiàn)出***差異。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，LncHrt敲除后改善了心臟的形態(tài)，***降低了HW/BW比值。注射2周后，LncHrt敲除改善了心臟功能，表現(xiàn)為縮短分?jǐn)?shù)增加，心室內(nèi)經(jīng)減小。組織學(xué)也表明LncHrt敲除后心臟組織的病理性變化***減少。此外，敲除LncHrt后心臟代謝內(nèi)穩(wěn)態(tài)也得到恢復(fù)，表現(xiàn)在氧通量，呼吸作用和ATP等。總之，這些表明LncHrt對梗死心臟的有***潛力。 高通量分子實(shí)驗(yàn)的后續(xù)標(biāo)書申請指導(dǎo)服務(wù)?；A(chǔ)分子實(shí)驗(yàn)課題產(chǎn)學(xué)研合作
英拜生物對實(shí)驗(yàn)可行性分析。壞死性小腸結(jié)腸炎小鼠模型
隨后，通過進(jìn)行spearman分析，研究了所有三組循環(huán)代謝產(chǎn)物豐度與腸道微生物群之間的聯(lián)系，以測試33個屬與52個代謝產(chǎn)物之間的關(guān)聯(lián)，其中有11個代謝物與各屬均無***相關(guān)(圖7A)。其余甘油磷脂類只與一兩種屬相關(guān)，而多不飽和脂肪酸(8-HETE, 8,9 - DiHETrE, 20-羥基二十甲酸)與至少7個屬***相關(guān)。此外，血清水蘇糖與瘤胃球菌1或2之間的相關(guān)性表明，PCOS大鼠血清水蘇糖水平降低與瘤胃球菌1豐度降低和瘤胃球菌2豐度增加有關(guān)(圖7B-C)。當(dāng)tempol干預(yù)改變瘤胃球菌_1和_2的豐度時，PCOS大鼠血清水蘇糖水平升高。壞死性小腸結(jié)腸炎小鼠模型
公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)