確定關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)突變?cè)谠己蚦ommitted亞型中的分布(圖1C，補(bǔ)充討論中的亞型和突變部分和補(bǔ)充表6 17)。盡管亞型中富含某些突變(原始組的FLT3-ITD和承諾組的DNMT3A)，驅(qū)動(dòng)突變的遺傳改變對(duì)原始和committed亞型的預(yù)測(cè)較差(補(bǔ)充圖3 16和補(bǔ)充討論)，基因突變和亞型之間的Matthews相關(guān)系數(shù)(MCC)較低(FLT3-ITD的MCC = 0.32, DNMT3A的MCC = 0.16;在precision-recall曲線(AUPRC = 0.62)值下，突變與亞型之間的多變量分析得到一個(gè)薄弱區(qū)域(Supplementary Fig. 7)。我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測(cè)序基因表達(dá)譜。寧夏課題詢問報(bào)價(jià)
m6A生物學(xué)功能
越來越多的證據(jù)表明m6A修飾在哺乳動(dòng)物中發(fā)揮重要的生物功能。例如，在轉(zhuǎn)錄后水平上調(diào)控RNA的穩(wěn)定性[11]、定位[12]、運(yùn)輸、剪切[13]和翻譯[14]。Claudio R. 等發(fā)現(xiàn)依賴METTL3的pri-miRNA甲基化，會(huì)促進(jìn)DGCR8識(shí)別和加工，從而促進(jìn)microRNA的成熟[15]。此外，m6A識(shí)別蛋白 HNRNPA2B1促進(jìn) pri-miRNA 加工成 pre-miRNA[16]。另外，環(huán)狀RNA上m6A的修飾能促進(jìn)環(huán)狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達(dá)調(diào)控中起著重要的作用，其調(diào)控機(jī)制的異?？赡芘c人類疾病或**相關(guān)。目前發(fā)現(xiàn)m6A可能會(huì)影響精子發(fā)育（ALKBH5，METTL3，Ythdc2）、發(fā)育（METTL3、FTO、ALKBH5）、免疫（METTL3）、UV誘導(dǎo)的DNA損傷反應(yīng)（METTL3，F(xiàn)TO）、**生成（YTHDF2）或轉(zhuǎn)移（METTL14）、干細(xì)胞更新（METTL14）、脂肪分化（FTO）、生物節(jié)律、細(xì)胞發(fā)育分化、細(xì)胞分裂及其它的一些生命過程。例如，ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾，其特點(diǎn)是凋亡影響減數(shù)分裂中期的精子細(xì)胞，引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18]，在生殖細(xì)胞中，METTL3的敲除嚴(yán)重抑制精子分化和減數(shù)分裂的發(fā)生，轉(zhuǎn)錄組和m6A分析顯示 精子發(fā)生相關(guān)基因的表達(dá)和選擇性剪接發(fā)生了改變[19]。 湖北課題技術(shù)指導(dǎo)使用motif和CHIP-seq預(yù)測(cè)影響基因簇表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。
circNDUFB2過表后IGF2BPs的mRNA無***變化，蛋白質(zhì)水平***降低。此外，circNDUFB2突變體不影響IGF2BPs的蛋白質(zhì)水平。因此推測(cè)circNDUFB2可能通過相互作用使IGF2BP蛋白失穩(wěn)。發(fā)現(xiàn)circNDUFB2的過度表達(dá)***降低了IGF2BP蛋白的水平，這可以通過MG132（蛋白酶抑制劑）恢復(fù)。circNDUFB2***增加了IGF2BPs的泛素化水平，但這種作用因其突變而受損。這些結(jié)果表明circNDUFB2通過促進(jìn)泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩(wěn)定性。
TRIM25是介導(dǎo)IGF2BP泛素化的E3連接酶
6）SsD抑制患者原代細(xì)胞
我們從吉林大學(xué)***醫(yī)院**組織/生物標(biāo)本庫(kù)獲取AML患者外周血，進(jìn)一步評(píng)估SsD對(duì)白血病進(jìn)展的影響。SsD***抑制了白血病細(xì)胞增殖(圖6A)、集落形成能力(圖6B)、誘導(dǎo)細(xì)胞周期阻滯(圖6C)。在機(jī)制上，這是由FTO介導(dǎo)的m6ARNA甲基化及其在SsD處理的原代細(xì)胞中的靶點(diǎn)調(diào)控的(圖6D-G)。當(dāng)我們使用“人-鼠”異種移植白血病模型來評(píng)估SsD在體內(nèi)對(duì)白血病進(jìn)展的影響時(shí)(圖6H)，與上述類似，使用SsD******抑制AML進(jìn)展，包括降低WBC，減少BM中的白血病母細(xì)胞，減少脾腫大，抑制肺轉(zhuǎn)移，延長(zhǎng)AML原代細(xì)胞異種移植小鼠的存活時(shí)間(圖6I-N)。因此，這些體內(nèi)研究結(jié)果表明SsD具有***FTO介導(dǎo)的AML的潛力。 英拜生物對(duì)實(shí)驗(yàn)可行性分析。
彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤(DLBCL)是**常見的淋巴惡性**亞型，它的開始和進(jìn)展受到遺傳和表觀遺傳的畸變控制。N6-甲基腺苷(m6A)作為**豐富的真核信息RNA修飾，通過調(diào)控靶基因影響多種基礎(chǔ)生物過程；然而，m6A修飾在DLBCL中的作用尚不清楚。此外，piwi相互作用RNA (piRNAs)已被證明是**的表觀遺傳效應(yīng)。目前，有研究發(fā)現(xiàn)piRNA-30473通過調(diào)控DLBCL中m6A RNA甲基化而促進(jìn)**發(fā)生和不良預(yù)后，該研究于2021年3月發(fā)表在《Blood》雜志，IF為17.543。zVAD預(yù)處理也略微增加了IR后PTEN-398A細(xì)胞中未解決的DNA損傷灶的數(shù)量。云南課題整體服務(wù)
也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。寧夏課題詢問報(bào)價(jià)
5、確認(rèn)PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴(kuò)增中的作用
隨后探究了PDCD4在調(diào)節(jié)Treg擴(kuò)增中的作用。如圖A-C所示，成功構(gòu)建了PDCD4的過表達(dá)和干擾表達(dá)細(xì)胞系。與對(duì)照組相比，PDCD4過表達(dá)***降低了Treg細(xì)胞的擴(kuò)增率，而干擾其表達(dá)則***提高了Treg細(xì)胞的擴(kuò)增率。表明PDCD4是負(fù)調(diào)節(jié)Treg細(xì)胞擴(kuò)增的關(guān)鍵基因。
6、**來源外泌體miR-208b影響體內(nèi)化療效果和**生長(zhǎng)
隨后作者探究了**來源外泌體miR-208b體內(nèi)對(duì)化療效果和**生長(zhǎng)的影響。用慢病毒轉(zhuǎn)染CT26細(xì)胞產(chǎn)生miR-208b過表達(dá)和miR-208b敲低細(xì)胞系。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)示意圖如圖7A所示，實(shí)驗(yàn)采用6組(每組10只小鼠)，其中3組使用奧沙利鉑，BALB/c小鼠植入CT26細(xì)胞，建立**植入模型。如圖7B-7D所示，miR-208b-OE組**生長(zhǎng)速度較快，而中miR-208-KD組**生長(zhǎng)明顯慢于對(duì)照組。 寧夏課題詢問報(bào)價(jià)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)