WTAP是DLBCL中piRNA-30473的一個(gè)功能重要的靶基因
作者研究WTAP是否在DLBCL的臨床結(jié)果中發(fā)揮了關(guān)鍵作用,并使用免疫組化分析來評(píng)估DLBCL患者樣本中WTAP蛋白的表達(dá)。免疫組化和GEO數(shù)據(jù)庫分析均顯示W(wǎng)TAP表達(dá)升高預(yù)示DLBCL患者預(yù)后不良(圖4A,4B)。另外耗盡WTAP也可誘導(dǎo)生長抑制和細(xì)胞周期阻滯,且無凋亡跡象(圖4C,4D,4E,圖4F)。通過過表達(dá)WTAP可在很大程度上挽救對(duì)piRNA-30473的抑制作用。這些數(shù)據(jù)表明WTAP是piRNA-30473的重要功能靶點(diǎn),并在DLBCL中發(fā)揮致*作用。 外泌體CD44v6和C1QBP可能是預(yù)測PDAC患者預(yù)后的有前途的生物標(biāo)志物。抗體芯片
在野生型小鼠和Caspase-11缺陷小鼠中,MCD處理***降低了pro-caspase1的蛋白水平(圖5A和F),而增加了活性Caspase-1的蛋白水平(圖5A和G)。此外,Caspase-11缺陷小鼠的活性caspase-1水平明顯低于野生型小鼠,說明MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟中Caspase-1的***較少。同樣,我們?cè)贛CD處理的Caspase-11缺陷小鼠的肝細(xì)胞中檢測到較少的Gsdmd-N表達(dá)(圖5H和I)。這些結(jié)果表明,Caspase-11缺失減弱了MCD誘導(dǎo)的Gsdmd和IL-1β的***。
6.Caspase-11缺乏抑制脂多糖誘導(dǎo)的肝細(xì)胞焦亡和體外損傷
我們?cè)隗w外評(píng)價(jià)Caspase-11缺乏對(duì)肝細(xì)胞焦亡的影響。我們用脂多糖(LPS)處理野生型小鼠原代肝細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)LPS誘導(dǎo)了pro-caspase-11和caspase-11的表達(dá)(圖6A和B),表明LPS誘導(dǎo)了原代肝細(xì)胞中caspase-11的***。我們進(jìn)一步處理來自野生型和Caspase-11缺陷小鼠的原代肝細(xì)胞,并監(jiān)測Gsdmd的表達(dá)和***。如圖6C和D所示,LPS處理未在野生型和Caspase-11缺陷的原代肝細(xì)胞中誘導(dǎo)pro-Gsdmd的表達(dá)。 內(nèi)蒙古課題服務(wù)兩年將 CTD 暴露與 CTD 解剖學(xué)相結(jié)合使環(huán)境健康科學(xué)家能夠調(diào)查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學(xué)應(yīng)激誘導(dǎo)表型的細(xì)節(jié)。
miR-101-3p或miR-423-5p過表達(dá)抑制體內(nèi)**的發(fā)生
為了評(píng)價(jià)miR-101-3p和miR423-5p在體內(nèi)的抗**作用,我們將轉(zhuǎn)染LV16-miR-101-3p、LV16-miR-423-5p或LV16-NC的Daoy細(xì)胞皮下注射Balb/c雄性裸鼠。RT-qPCR檢測miR-101-3p和miR-423-5p在慢病毒轉(zhuǎn)染的Daoy細(xì)胞中的相對(duì)表達(dá)水平。**在注射后2周被發(fā)現(xiàn),小鼠在植入后7周被處死。與對(duì)照組相比,LV16-miR-101-3p-和LV16-miR-423-5p處理組的**生長明顯受到抑制。miR-101-3p或miR-423-5p***后,**重量也***降低。免疫組化檢測EZH2、FOXP4和Ki67在異種移植瘤組織中的表達(dá)。在表達(dá)LV16-miR-101-3p-和LV16-miR-423-5p的**組織中FOXP4和Ki-67的水平均下調(diào),而在LV16-miR-101-3p組EZH2也下調(diào)。這些數(shù)據(jù)表明,miR-101-3p和miR-423-5p通過抑制FOXP4和EZH2的表達(dá),在體內(nèi)抑制**生長。
然而,SsD***降低了MerTK和BCL-2轉(zhuǎn)錄本的穩(wěn)定性,這隨后導(dǎo)致了它們的翻譯降低(圖7F和7G)?;蛱禺愋詍6A qPCR證實(shí)MerTK、BCL-2和STAT3的RNA或蛋白水平的變化是由m6A介導(dǎo)的mRNA穩(wěn)定性引起的。為了在體內(nèi)檢測這些效應(yīng),我們將Kas-1尼洛替尼耐藥細(xì)胞移植給裸鼠。細(xì)胞接種后,為了保持耐藥表型,我們繼續(xù)每周兩次腹腔注射尼洛替尼,直到**體積接近100mm3。然后,隨機(jī)分組給予次優(yōu)劑量的SsD (圖7H)。SsD本身略微減緩了耐藥**的生長(圖7I和7J)。在機(jī)制上,我們觀察到mRNA m6A甲基化的總體增加(圖7K)。
結(jié)論:我們的研究揭示了FTO/m6A修飾信號(hào)之間之前未被認(rèn)識(shí)到的聯(lián)系,并闡明了SsD在AML中的功能。該研究可能為靶向FTO/m6A的表轉(zhuǎn)錄組提供一個(gè)有前途的策略,并突出柴胡皂甙***白血病的臨床潛力。 課題外包服務(wù)找英拜放心安心。
此外,低氧誘導(dǎo)乳腺*細(xì)胞中依賴ZNF217的NANOG 和KLF4 的mRNA m6A甲基化抑制,且ALKBH5敲除***降低免疫缺陷小鼠乳腺*的肺轉(zhuǎn)移[24]。在肺*中,METTL3能夠促進(jìn)肺腺*細(xì)胞的生長、生存和侵襲,但還不清楚它是否作為 m6A 調(diào)節(jié)器或效應(yīng)器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細(xì)胞白血病(AML)患者中,m (6) A 調(diào)控基因的突變或拷貝數(shù)變化與TP53 突變存在密切聯(lián)系,且m (6) A 調(diào)控基因的改變與AML不良預(yù)后相關(guān)[26]。此外,F(xiàn)TO在AML中高表達(dá),它通過降低mRNA轉(zhuǎn)錄本中的m(6)水平,調(diào)節(jié)ASB2和RARA等靶點(diǎn)的表達(dá),增強(qiáng)了白血病*基因介導(dǎo)的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和白血病形成,并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導(dǎo)的AML細(xì)胞分化[27]。在脂肪形成過程中,F(xiàn)TO表達(dá)與m6A水平成負(fù)相關(guān),促進(jìn)脂肪形成[3]。在膠質(zhì)細(xì)胞瘤樣細(xì)胞中,ALKBH5通過lncRNA FOXM1介導(dǎo)FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質(zhì)瘤細(xì)胞的成瘤性[28]。此外,甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3或METTL14的敲除,能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達(dá),極大地促進(jìn)了膠質(zhì)瘤細(xì)胞的生長、自我更新和**形成[29]。***ATM對(duì)PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。蛋白組學(xué)
我們使用抗體陣列評(píng)估了表達(dá)PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細(xì)胞裂解液的應(yīng)激反應(yīng)和凋亡通路的活性??贵w芯片
六、原始亞型預(yù)示著對(duì)激酶抑制劑的敏感性增加
生成各化合物的藥物劑量響應(yīng)曲線,并比較各亞型間曲線下面積(areaunderthecurve,AUCd)(單個(gè)藥物劑量響應(yīng)曲線見圖6、)。體外藥物篩選顯示,原始聚類患者樣本對(duì)索拉非尼、舒尼替尼和魯索利替尼的敏感性高于合并亞型(Wilcoxon秩和檢驗(yàn)p-value分別=2E5、0.02和0.01;在UHN患者樣本中,Quizartinib的亞型間差異反應(yīng)較弱,而伊馬替尼和達(dá)沙替尼的亞型間無差異(補(bǔ)充圖27)。使用BeatAML33數(shù)據(jù)集,驗(yàn)證原始和committed亞型對(duì)激酶抑制劑的反應(yīng)之間的聯(lián)系,該數(shù)據(jù)集包含npm1突變AML患者樣本的體外藥物篩選。我們觀察到UHN和BeatAML數(shù)據(jù)集之間的良好一致性,原始聚類中的樣本對(duì)Sorafenib和Sunitinib表現(xiàn)出更高的敏感性(圖6)。有趣的是,Quizartinib在UHN隊(duì)列中有微弱的差異反應(yīng),但在BeatAML隊(duì)列中卻有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異。 抗體芯片
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