一、人胎肝和骨髓造血室的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組
為獲取胚胎發(fā)育期間造血細(xì)胞的全部譜系，研究者從17 – 22 PCW的胚胎肝臟、股骨和髖骨中對(duì)表型確定的血液群體進(jìn)行單細(xì)胞分類，并對(duì)15個(gè)胚胎的單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq檢測(cè)（圖1）。基于差異表達(dá)分析和標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)***性排名前20的標(biāo)記基因，標(biāo)注了23個(gè)不同的群體，發(fā)現(xiàn)在肝臟或股骨中檢測(cè)不到任何T細(xì)胞或先天淋巴細(xì)胞（ILCs），單細(xì)胞分析顯示在所有免疫表型定義的干細(xì)胞和祖細(xì)胞群體中存在大量的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性，其中一些表型祖細(xì)胞群體（如HSCs，MPPs，CMPs，GMPs，MEPs和CLPs）由10多個(gè)不同的轉(zhuǎn)錄表型定義群體組成，這進(jìn)一步證明人類臍帶血的祖細(xì)胞室具有高度的異質(zhì)性。此外，該研究分析表明當(dāng)前使用的細(xì)胞表面標(biāo)記物不能很好地預(yù)測(cè)人類胚胎造血祖細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄狀態(tài)。 腸道微生物發(fā)酵的某些**終產(chǎn)物可進(jìn)入血液影響宿主***系統(tǒng)的生理功能。重慶NF-kB標(biāo)書
目前，PROTAC-DB包括1662個(gè)PROTAC，202個(gè)彈頭（靶向目標(biāo)蛋白質(zhì)的小分子），65個(gè)E3配體（能夠募集E3連接酶的小分子）和806個(gè)接頭，以及它們的化學(xué)結(jié)構(gòu)，生物學(xué)活性和理化性質(zhì)。除了彈頭和E3配體的生物活性外，PROTAC-DB還提供PROTAC的降解能力，結(jié)合親和力和細(xì)胞活性。
數(shù)據(jù)庫(kù)的查詢和瀏覽為了方便對(duì)PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)進(jìn)行檢索，作者提供了檢索和瀏覽工具。在檢索工具上，PROTAC-DB可以進(jìn)行基于文本的檢索和基于結(jié)構(gòu)的檢索?；谖谋镜乃阉魇窃谡麄€(gè)PROTAC-DB中進(jìn)行搜索的一種簡(jiǎn)單方式，只需輸入單個(gè)術(shù)語(yǔ)，如目標(biāo)名稱、化合物名稱或ID。對(duì)于基于結(jié)構(gòu)的搜索，用戶可以在ChemDoodle編輯器中輸入SMILES字符串、上傳MO***F文件或繪制分子草圖。導(dǎo)入自編輯的分子后，可以從三個(gè)搜索選項(xiàng)(similarity、substructure或exact)中選擇一個(gè)。在相似性搜索中，利用類FCFP指紋中的位向量Morgan指紋來計(jì)算兩個(gè)分子之間的Tanimoto相似度?？梢赃x擇數(shù)據(jù)集(PROTAC、彈頭、E3配體或Linker)進(jìn)行搜索。
凋亡 標(biāo)書服務(wù)兩年這些細(xì)胞表現(xiàn)出更強(qiáng)的攻擊性和增殖能力.
目前，CTD中超過247000種化學(xué)-表型相互作用使用了870個(gè)解剖學(xué)術(shù)語(yǔ)。 用戶可以通過選擇門戶圖標(biāo)向下鉆取可導(dǎo)航層次結(jié)構(gòu)或使用 CTD 關(guān)鍵字搜索框中的“解剖”選擇列表選項(xiàng)，從主頁(yè)訪問 CTD Anatomy。CTD Anatomy 頁(yè)面組織和合并數(shù)據(jù)，允許用戶從解剖學(xué)角度探索交互；這可用于識(shí)別不同生理系統(tǒng)（例如腎臟、肝臟、大腦和心血管系統(tǒng)）獨(dú)有或共享的化學(xué)物質(zhì)和表型，或發(fā)現(xiàn)例如影響影響的 1158 種化學(xué)物質(zhì) 心臟中有 600 種表型。同樣，已經(jīng)開始將 CTD 暴露與 CTD 解剖學(xué)相結(jié)合，使環(huán)境健康科學(xué)家能夠調(diào)查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學(xué)應(yīng)激誘導(dǎo)表型的細(xì)節(jié)。***，為了幫助提高數(shù)據(jù)庫(kù)的互操作性。
三、在體內(nèi)，tbi介導(dǎo)的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制
為了確定TBI是否會(huì)損害體內(nèi)的核質(zhì)運(yùn)輸，我們?cè)诠夁\(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中過表達(dá)了一個(gè)帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標(biāo)記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達(dá)nlsnes -GFP的大腦中，GFP信號(hào)分布在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中(圖3A)。然而，定量分析顯示，在nls - nes -GFP表達(dá)的vnc暴露于TBI中，核GFP信號(hào)減少的細(xì)胞百分比***增加，而核GFP強(qiáng)度***降低(圖3B和C)，說明GFP核進(jìn)口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來，我們?cè)谶\(yùn)動(dòng)神經(jīng)元中表達(dá)了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標(biāo)記的沒有核輸出活性的GFP蛋白。表達(dá)NLS的非創(chuàng)傷性腦損傷動(dòng)物的腦細(xì)胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細(xì)胞核的強(qiáng)大定位(圖3A)，而創(chuàng)傷性腦損傷動(dòng)物的vnc顯示了核GFP減少的細(xì)胞數(shù)量***增加，核GFP強(qiáng)度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲暴露于TBI，并在DMSO單獨(dú)、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養(yǎng)。對(duì)經(jīng)歷過TBI的果蠅幼蟲的羽化試驗(yàn)顯示，KPT-350處理的動(dòng)物(圖3D)或KPT-276處理的動(dòng)物(圖3E)具有***的劑量依賴性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號(hào)***高于dmso處理的對(duì)照組(圖3G）。 CircRNA在NSCLC發(fā)生、發(fā)展中誘導(dǎo)免疫反應(yīng)的行為和機(jī)制尚未見報(bào)道.
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué) (scRNA-Seq) 模塊
scRNA-seq 模塊系統(tǒng)地組織了基因表達(dá)隨年齡增長(zhǎng)的組織和細(xì)胞類型特異性異質(zhì)變化。該模塊提供不同細(xì)胞類型或亞型的高分辨率、綜合參考圖，以及它們的時(shí)空分布信息，以及在不同衰老相關(guān)或疾病條件下每種細(xì)胞類型或亞型的基因表達(dá)模式。該模塊目前包括來自大鼠、猴子和人類的 14 種衰老組織的單細(xì)胞 RNA 測(cè)序數(shù)據(jù)集。這些數(shù)據(jù)包括從單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)圖譜中的多個(gè)哺乳動(dòng)物組織中提取的細(xì)胞類型注釋和細(xì)胞類型特異性 DEG，用于衰老和熱量限制 (CR)。該模塊還包含單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，涵蓋非人類靈長(zhǎng)類動(dòng)物的卵巢、胰島、主動(dòng)脈、視網(wǎng)膜和心肺衰老，以及老年 COVID-19 患者中人類循環(huán)免疫細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)景觀。 circNDUFB2與IGF2BPs相互作用促進(jìn)泛素/蛋白酶體介導(dǎo)的IGF2BPs降解.北京信號(hào)通路標(biāo)書
促進(jìn)了對(duì)定義腎臟細(xì)胞特性的基因和途徑的更深入的理解。重慶NF-kB標(biāo)書
肺腺* (LUAD) 是**常見的非小細(xì)胞肺*類型。然而，LUAD **發(fā)生的潛在機(jī)制在很大程度上是未知的。N6-甲基腺苷 (m6A) RNA 甲基化在各種人類**中的關(guān)鍵作用，包括肺*。***來講一篇關(guān)于m6A與肺*的文章，題名為：The m 6 A reader YTHDC2 inhibits lung adenocarcinoma tumorigenesis by suppressing SLC7A11-dependent antioxidant function（IF=11.79）。YTHDC2的抑制與LUAD中的**進(jìn)展有關(guān)
為了評(píng)估m(xù)6A閱讀器在肺*中的表達(dá)譜，通過 GEPIA 數(shù)據(jù)庫(kù)分析了已知的閱讀器，包括 YTHDF1/2/3、YTHDC1/2、HNRNPA2B1、HNRNPC/G、eIF3A、FMR1 和 IGF2BP1/2。其中，與正常肺相比，LUAD 和 LUSC 中只有 YTHDC2 下調(diào)。然而，IGF2BP2 在 LUAD 和 LUSC 中差異表達(dá)。Oncomine 數(shù)據(jù)庫(kù)還顯示 YTHDC2 在 LUAD 中通常被下調(diào)。Kaplan-Meier 圖的分析進(jìn)一步表明，較低的 YTHDC2 與 LUAD 中較差的總體生存率相關(guān)。這些結(jié)果使我們研究了 YTHDC2 在 LUAD 中的作用。 重慶NF-kB標(biāo)書
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀，客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng)：提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)