YTHDC2抑制胱氨酸攝取和下游抗氧化程序
通常在具有高致瘤特性的**中觀察到代謝活性。為了研究YTHDC2對(duì)代謝物的影響，進(jìn)行了代謝組學(xué)分析，比較了具有低和高YTHDC2表達(dá)（的LUAD標(biāo)本。GSH代謝是確定的前20條KEGG途徑之一。在顯著改變的代謝物中，與YTHDC2高**相比，在YTHDC2低**中觀察到胱氨酸增加了3.975倍。此外，觀察到Y(jié)THDC2與細(xì)胞內(nèi)胱氨酸之間呈負(fù)相關(guān)。這些數(shù)據(jù)表明YTHDC2減少細(xì)胞內(nèi)胱氨酸。為了驗(yàn)證YTHDC2是否降低了胱氨酸攝取，我們培養(yǎng)了具有高(pHY#1-8)或低(pLY#1-8)YTHDC2表達(dá)水平的原代患者來源的LUAD細(xì)胞。L-14C-胱氨酸攝取測(cè)定結(jié)果表明，YTHDC2通過其YTH結(jié)構(gòu)域抑制了H1299和H1975細(xì)胞產(chǎn)生的異種移植物、小鼠形成的LUAD和患者來源的LUAD細(xì)胞中的胱氨酸攝取。已顯示CHAC1mRNA水平的上調(diào)表明胱氨酸攝取受損。事實(shí)上，觀察到Y(jié)THDC2增加了CHAC1mRNA水平。 第4周測(cè)定FITC標(biāo)記的葡聚糖(4kd)和血液中FITC水平。TRF標(biāo)書廣東
TransCirc數(shù)據(jù)庫(kù)整合了各種與翻譯相關(guān)的證據(jù)，檢索的結(jié)果能直觀的呈現(xiàn)翻譯產(chǎn)物的相關(guān)證據(jù)信息。數(shù)據(jù)共分析了328080種已知人類circRNA的翻譯潛能，有蛋白質(zhì)譜證據(jù)（MS）的circRNA有168個(gè)，核糖體印跡或多聚核糖體分析（RP/PP）的證據(jù)4284個(gè)circRNA，潛在翻譯產(chǎn)物序列分析（SeqComp）的301100個(gè)circRNA。有IRES預(yù)測(cè)結(jié)果的314138個(gè)circRNA，有m6A修飾位點(diǎn)信息的39397個(gè)circRNA，有翻譯起始位點(diǎn)信息（TIS）的9394個(gè)circRNA，有ORF信息的305016個(gè)circRNA。
還檢測(cè)到β-肌動(dòng)蛋白***升高，與免疫沉淀的HuR蛋白結(jié)合。接下來研究HuR-β-actin介導(dǎo)的調(diào)節(jié)機(jī)制是否參與OPC的遷移調(diào)節(jié)。β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)以及細(xì)胞遷移能力在HuR基因過表達(dá)的細(xì)胞中***增加， HuR基因敲低細(xì)胞中降低。β-肌動(dòng)蛋白的mRNA和蛋白表達(dá)在lnc-PMIF過表達(dá)細(xì)胞中***下調(diào)，但在lnc-PMIF基因敲除細(xì)胞中***上調(diào)，表明lnc-PMIF能抑制OPCs中β-actin的表達(dá)，基因過表達(dá)/敲除lnc-PMIF不改變HuR的蛋白表達(dá)。在前述lnc-PMIF敲低細(xì)胞中敲低HuR基因，細(xì)胞中β-actin的mRNA和蛋白表達(dá)***下調(diào)，細(xì)胞遷移能力也受到損害，這些數(shù)據(jù)表明lnc-PMIF可與HuR相互作用，抑制β-actin的表達(dá)來抑制OPC遷移。
1、循環(huán)miR-208b是CRC中FOLFOX化療敏感性的一種很有前途的生物標(biāo)志物
如圖1所示，作者設(shè)計(jì)了一項(xiàng)多期研究，以確定新的血清miRNAs作為預(yù)測(cè)和監(jiān)測(cè)奧沙利鉑聯(lián)合亞葉酸和5-FU（FOLFOX）化療反應(yīng)的替代標(biāo)志物。
作者檢測(cè)了69個(gè)化療敏感和47個(gè)化療不敏感患者的血漿中miR-208b表達(dá)，結(jié)果顯示與未響應(yīng)組相比，miR-208b的表達(dá)水平在響應(yīng)組***下調(diào)（圖2A-B）。同時(shí)檢測(cè)了血清*胚抗原(CEA)水平，血清miR-208b的曲線下面積(AUC)與血清CEA的AUC相比，優(yōu)于血清CEA水平。在化療響應(yīng)組，在化療前miR-208b的表達(dá)高于化療后，而在未響應(yīng)組，化療前低于化療后水平（圖2C）。生存分析顯示，無進(jìn)展生存期化療響應(yīng)組***高于未響應(yīng)組，miR-208b低表達(dá)組***高于高表達(dá)組（圖2D）。這些結(jié)果表明miR-208b可作為預(yù)測(cè)CRC中FOLFOX化療敏感性的非侵襲性標(biāo)志物。 circSDHC來源于第1染色體上的SDHC基因.
2021年6月，在Oncogene雜志上發(fā)表了文章“Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells..”。此報(bào)道通過運(yùn)用了一種強(qiáng)大的染色質(zhì)導(dǎo)向蛋白質(zhì)組學(xué)方法，稱為ChIP-SICAP，揭示去勢(shì)抗性前列腺*(CRPC)細(xì)胞中內(nèi)源性AR周圍染色質(zhì)蛋白網(wǎng)絡(luò)(染色質(zhì)蛋白網(wǎng)絡(luò))的組成。在CRPC細(xì)胞雄***信號(hào)通路的背景下，進(jìn)一步研究了與AR相關(guān)蛋白作用的染色質(zhì)重塑者SMARCA4和SIM2。通過整合ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq和功能實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù)，揭示SMARCA4和AR在染色質(zhì)上***共存，SMARCA4缺失影響了一組AR靶基因的染色質(zhì)可及性和表達(dá)，也抑制了CRPC細(xì)胞的生長(zhǎng)，驗(yàn)證了SMARCA4在CRPC細(xì)胞中的功能。雖然SIM2的沉默同樣降低了染色質(zhì)的可及性，但它影響了更多的雄***調(diào)節(jié)基因的表達(dá)。在雞胚絨膜尿囊膜實(shí)驗(yàn)中，SIM2沉默也降低了CRPC細(xì)胞的增殖和**的大小?？傊搜芯胯b定的AR染色體是研究這一重要藥物靶點(diǎn)的重要資源。間接量熱法測(cè)定平均呼吸交換商（RQ值）在SCI + FMT組恢復(fù)正常。外泌體標(biāo)書國(guó)家自然科學(xué)基金
采用LEfSe方法分析經(jīng)DHEA和tempol處理后***改變的關(guān)鍵系統(tǒng)發(fā)育類型。TRF標(biāo)書廣東
氧化應(yīng)激與阿爾茨海默病(AD)的發(fā)病機(jī)制有關(guān)。線粒體功能障礙與AD期間神經(jīng)毒性中的氧化應(yīng)激和活性氧(ROS)有關(guān)。線粒體代謝受損與AD腦損傷中的線粒體功能障礙有關(guān)。雖然已確定NOX4在腦損傷中的作用，但NOX4調(diào)控AD中星形膠質(zhì)細(xì)胞鐵死亡的機(jī)制尚不清楚。因此，小編給大家介紹于2021年3月發(fā)表于影響因子為9.986的“Redox Biology”上的文章“NOX4 promotes ferroptosis of astrocytes by oxidative stress-induced lipid peroxidation via the impairment of mitochondrial metabolism in Alzheimer’s diseases”。我們的結(jié)果表明，NOX4通過脂質(zhì)過氧化損傷AD中線粒體代謝，促進(jìn)星形膠質(zhì)細(xì)胞的鐵死亡。TRF標(biāo)書廣東
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6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)