北京SNP檢測標書

來源: 發(fā)布時間:2021-11-04

6)M1-Exos通過傳遞miR-155上調ROS水平,損害bEnd.3細胞線粒體功能

我們研究了外泌體miR-155與bEnd.3細胞中線粒體功能的關系。我們發(fā)現,與miR-NCOE-Exos相比,miR-155OE-Exos處理上調了ROS水平(圖6A和B),線粒體超氧化物水平(圖6C和D)和線粒體電位(圖6E);然而,miR-155KD-Exos處理則顯示了相反的結果(圖6A-E)。此外,miR-155OE-Exos可使線粒體腫脹更大,形態(tài)更短,線粒體碎片細胞比例更高,而miR-155KD-Exos可減輕線粒體腫脹(圖6F和G)。miR-155OE-Exos處理后的OCR、基礎呼吸、ATP產生、呼吸能力和呼吸逆轉均明顯下降,而miR-155KD-Exos處理減輕了氧化呼吸功能障礙(圖6H和I)。這些結果表明,上調外泌體miR-155可導致過度ROS的產生和線粒體功能障礙。 PCOS大鼠血清水蘇糖水平升高。北京SNP檢測標書

QKI促進NSCLC細胞中circNDUFB2的生物發(fā)生

circNDUFB2和NDUFB2均來自NDUFB2 pre-mRNA,而NDUFB2 mRNA在NSCLC中略有上調。因此,推測circNDUFB2的下調在轉錄后發(fā)生。我們在circNDUFB2中搜索與潛在QRE匹配的序列。接下來進行了RIP分析,確認QKI確實與NDUFB2 pre-mRNA中的假定QRE結合。在NSCLC細胞中QKI過表達可能會上調circNDUFB2。 這些數據表明,QKI與NDUFB2 pre-mRNA的circNDUFB2形成外顯子側翼的內含子結合,從而促進circNDUFB2的形成。 FISH標書中標率高GO和KEGG分析顯示circNDUFB2觸發(fā)免疫防御和I型干擾素(IFNs)信號。

1)USP35敲除抑制肺*細胞生長、集落形成和**進展

我們首先檢測了肺*組織和細胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示,USP35在肺ADC和SCC**中都***上調。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細胞系相比,USP35mRNA水平在肺*細胞系(A549、H358、H460、H1299和H1650)中也高度表達(圖1B)。鑒于H460和H1299細胞中USP35mRNA的豐度較高,我們在下一項研究中使用了這兩種細胞系。與mRNA水平一致,在H460和H1299細胞中USP35蛋白也增加了(圖1C)。為了闡明USP35在肺*發(fā)病機制中的作用,我們在H460和H1299細胞中沉默了USP35(圖1D)。有趣的是,USP35敲除抑制了H460和H1299細胞在體外的生長能力和集落形成(圖1E、F)。來自**異種移植實驗的數據進一步表明,USP35沉默抑制了25天生長后的**體積和重量(圖1G,H)??傊?,USP35在調節(jié)肺*細胞生長和**進展中起著關鍵作用。

單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術可以在單細胞水平下研究復雜的多細胞生物的轉錄組譜。這為科學家提供了一種研究表達模式中細胞異質性的新工具,尤其是疾病細胞的異質性。更重要的是,scRNA-seq的快速發(fā)展帶來了在疾病微環(huán)境中探索細胞亞群的見識,這有助于研究疾病的發(fā)***展,耐藥性和免疫逃逸。scRNA-seq技術已被廣泛應用于病例對照研究中差異表達基因的識別以及細胞亞群之間差異的識別。

***我們來講一篇刊登在Nucleic Acids Research期刊(IF=11.502),題名為SC2disease: a manually curated database of single-cell transcriptome for human diseases的文章。SC2disease是一個人工收集的數據庫,能為研究者提供各種疾病的各種細胞類型準確的基因表達譜資源。該網站通過回顧2020年3月之前使用scRNA-seq研究人類樣本疾病的文獻,并開發(fā)了SC2disease數據庫,通過疾病、組織和細胞類型整理數據。SC2disease包含946481條數據,對應341種細胞類型、29種組織和25種疾病。SC2disease數據庫中的每個條目都包含不同細胞類型、組織和疾病相關健康狀況之間差異表達基因的比較。 miR-127-3p是一種*****因子可下調CDKN3/E2F1軸的活性。


同時,circNDUFB2顯著增加了p-P65,p-IRF3,p-STAT1和p-STAT2。circNDUFB2還促進了IRF3和P65進入核內的易位。免疫熒光分析證實circNDUFB2促進了IRF3的磷酸化,并隨后觸發(fā)其轉移到細胞核中。更重要的是,RIG-1的敲除顯著消除了這些基因的蛋白質水平或磷酸化水平的上調以及由circNDUFB2誘導的A549細胞中IRF3和P65的核易位。ELISAs測量細胞培養(yǎng)上清液中的細胞因子水平,發(fā)現RIG-1敲低顯著消除了對CXCL10,CXCL11,CCL5和IFNβ的誘導。上述結果表明RIG-1在介導NSCLC細胞中circNDUFB2的免疫應答中起關鍵作用,而circNDUFB2引發(fā)的免疫應答不依賴于circNDUFB2中m6A的修飾。我們構建了生物素標記的circSDHC探針.北京lncRNA標書

研究了所有三組循環(huán)代謝產物豐度與腸道微生物群之間的聯系.北京SNP檢測標書

還檢測到β-肌動蛋白***升高,與免疫沉淀的HuR蛋白結合。接下來研究HuR-β-actin介導的調節(jié)機制是否參與OPC的遷移調節(jié)。β-actin的mRNA和蛋白表達以及細胞遷移能力在HuR基因過表達的細胞中***增加, HuR基因敲低細胞中降低。β-肌動蛋白的mRNA和蛋白表達在lnc-PMIF過表達細胞中***下調,但在lnc-PMIF基因敲除細胞中***上調,表明lnc-PMIF能抑制OPCs中β-actin的表達,基因過表達/敲除lnc-PMIF不改變HuR的蛋白表達。在前述lnc-PMIF敲低細胞中敲低HuR基因,細胞中β-actin的mRNA和蛋白表達***下調,細胞遷移能力也受到損害,這些數據表明lnc-PMIF可與HuR相互作用,抑制β-actin的表達來抑制OPC遷移。北京SNP檢測標書

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