2.TYRO3使**細(xì)胞對(duì)抗PD-1***耐藥
在同系BALB/c小鼠模型中比較了Tyro3過(guò)表達(dá)(Tyro3-OE)和4T1-P細(xì)胞對(duì)抗mPD-1***的反應(yīng)。在荷4T1-P**的小鼠中，抗mPD-1******減少**的生長(zhǎng)，并延長(zhǎng)了生存期。這些結(jié)果表明，盡管4T1-P**對(duì)抗mPD-1***有反應(yīng)，Tyro3的過(guò)表達(dá)促進(jìn)了這些**的耐藥性。為進(jìn)一步確定在4T1-R耐藥細(xì)胞中抗PD-1/PD-L1耐藥是否需要TYRO3，敲除4T1-R細(xì)胞(TYRO3–/–)中的TYRO3。荷瘤Tyro3敲低細(xì)胞的小鼠對(duì)抗mPD-1***敏感，**生長(zhǎng)***減少，小鼠存活時(shí)間更長(zhǎng)。這些結(jié)果證明TYRO3在抗PD-1/PD-L1耐藥中的重要作用。 發(fā)現(xiàn)乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。上海微生物失調(diào)科研
一、Pten398A加速M(fèi)MTVneu驅(qū)動(dòng)的乳腺**發(fā)生
為了研究ATM磷酸化PTEN的體內(nèi)功能，我們?cè)谛∈笾性O(shè)計(jì)了一個(gè)敲入等位基因，其中398位絲氨酸取代了丙氨酸(Pten398A)。Pten398A/+和Pten398A/398A小鼠存活，發(fā)育明顯正常。為了研究atm依賴(lài)的PTEN磷酸化在乳腺*中的可能作用，我們?cè)谛∈笕橄?*病毒(MMTV)啟動(dòng)子/增強(qiáng)子轉(zhuǎn)錄控制下表達(dá)滅活neu (Erbb2)融合基因的小鼠背景下培養(yǎng)了Pten398A等位基因。在這個(gè)成熟的模型中，MMTVneu基因在正常乳腺上皮中低水平表達(dá)，導(dǎo)致乳腺**的發(fā)展，據(jù)報(bào)道中位發(fā)生率為205天。Pten+/+;MMTVneu小鼠發(fā)生了預(yù)期潛伏期的乳腺**，顯示了233天的中位生存期(圖1A)。
上海細(xì)胞凋亡基因芯片科研英拜有一支高精尖的團(tuán)隊(duì)。
肺*是**常被診斷的**之一，也是導(dǎo)致**死亡的主要原因，非小細(xì)胞肺*（NSCLC）約占肺*病例的85％。環(huán)狀RNA（circRNA）是一類(lèi)共價(jià)閉合的單鏈RNA，與**的發(fā)展有關(guān)。***我們來(lái)看一篇發(fā)表在Nature Communications期刊的一篇文章，題名為：circNDUFB2 inhibits non-small cell lung cancer progression via destabilizing IGF2BPs and activating anti-tumor immunity。
circNDUFB2在NSCLC中被下調(diào)
通過(guò)circRNA芯片分析了三對(duì)NSCLC樣品中circRNA的表達(dá)譜，總共鑒定出109個(gè)circRNA失調(diào)，33個(gè)上調(diào)，76個(gè)下調(diào)。qRT-PCR驗(yàn)證52個(gè)配對(duì)NSCLC樣品中**差異circRNA的表達(dá)。circNDUFB2是**顯著下調(diào)的circRNA。臨床分析發(fā)現(xiàn)circNDUFB2高表達(dá)與NSCLC患者的**大小、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和分期呈負(fù)相關(guān)。結(jié)果表明，circNDUFB2在NSCLC中經(jīng)常被下調(diào)，并且與NSCLC的惡性特征呈負(fù)相關(guān)。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產(chǎn)生，長(zhǎng)度為249nt。circNDUFB2可由發(fā)散引物擴(kuò)增，收斂引物不能擴(kuò)增。核酸酶消化證實(shí)circNDUFB2具有閉環(huán)結(jié)構(gòu)。放線菌素D處理表明，與NDUFB2mRNA相比，circNDUFB2是穩(wěn)定的。核質(zhì)分離PCR以及熒光原位雜交（FISH）顯示circNDUFB2主要定位于細(xì)胞質(zhì)中。這些結(jié)果表明circNDUFB2是一個(gè)circRNA。
4）體外實(shí)驗(yàn)表明，上調(diào)UCP1以減輕AKI期間的脂質(zhì)積累，可通過(guò)影響炎癥和凋亡，***抑制疾病進(jìn)展
越來(lái)越多的證據(jù)表明，在AKI中有明顯的脂質(zhì)積累和UCP1的異常表達(dá)，并與腎損傷的嚴(yán)重程度有很強(qiáng)的相關(guān)性。為了確定脂質(zhì)積累是否影響AKI期間的細(xì)胞功能，我們首先使用UCP1過(guò)表達(dá)慢病毒和UCP1激動(dòng)劑CL316243構(gòu)建AKI細(xì)胞脂質(zhì)積累***模型。如圖4A所示，在AKI中上調(diào)UCP1***脂質(zhì)積聚，導(dǎo)致腎小管損傷指數(shù)、NGAL***下調(diào)，說(shuō)明UCP1***脂質(zhì)積聚可***減輕模型細(xì)胞的損傷。鑒于炎癥和凋亡是AKI細(xì)胞損傷**重要和直接的原因，我們對(duì)上述細(xì)胞模型中的炎癥和凋亡標(biāo)記物進(jìn)行了量化。IL-1β、IL-6和TNF-α隨著UCP1的上調(diào)而***降低(圖4B-D)。在凋亡指標(biāo)Bax和C-caspase3中也觀察到類(lèi)似的趨勢(shì)，而B(niǎo)cl-2升高(圖4E)。***，通過(guò)TUNEL熒光染色直接定量評(píng)估細(xì)胞凋亡，證實(shí)上調(diào)UCP1緩解AKI模型細(xì)胞的凋亡(圖4F)。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以改善DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎。
一、YTHDF1在胃*中的過(guò)表達(dá)
通過(guò)評(píng)估YTHDF1突變的分布，我們發(fā)現(xiàn)65%的突變是基因擴(kuò)增，這通常會(huì)導(dǎo)致基因產(chǎn)物的過(guò)表達(dá)(圖1A).通過(guò)對(duì)TCGA數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)YTHDF1在胃*患者中的表達(dá)確實(shí)明顯高于正常組織(圖1B)。YTHDF1的高表達(dá)與胃*進(jìn)展(圖1C)和較差的總生存期(圖1D)相關(guān)。對(duì)正常胃組織和胃*標(biāo)本進(jìn)行免疫組化分析，證實(shí)**組織中YTHDF1蛋白表達(dá)上調(diào)(圖1F)。此外，YTHDF1在胃*患者中的異常高表達(dá)與更嚴(yán)重的臨床病理特征(如神經(jīng)周?chē)址?、侵襲性**分期(III/IV期vs.I/II期)、靜脈侵犯等***相關(guān)(圖1G）。KaplanMeier生存分析也顯示，YTHDF1高表達(dá)的胃*患者4年總生存期較差。綜上所述，YTHDF1在胃*發(fā)生中具有潛在的致瘤作用。 這些數(shù)據(jù)表明大黃酸***可以消除尿酸引起的腸道通透性增強(qiáng)。上海微生物失調(diào)科研
外泌體miR-934誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化促進(jìn)CRC肝轉(zhuǎn)移。上海微生物失調(diào)科研
7）miR-155負(fù)調(diào)控SOCS6表達(dá)，***NF-κB通路
為了進(jìn)一步探討外泌體miR-155誘導(dǎo)EndoMT和線粒體功能障礙的潛在機(jī)制，我們重點(diǎn)研究了miR-155的下游基因。首先，利用在線miRNA靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)了84個(gè)潛在靶基因。SOCS6是具有3’UTR的下游mRNA之一，可能與miR-155結(jié)合(圖7A)。結(jié)合GSE49329和GSE49330數(shù)據(jù)庫(kù)，我們發(fā)現(xiàn)miR-155的表達(dá)與SOCS6的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(圖7B)。為了進(jìn)一步證實(shí)SOCS63’UTR是miR-155的直接靶標(biāo)，我們根據(jù)預(yù)測(cè)的結(jié)合位點(diǎn)(圖7C)構(gòu)建了SOCS63’UTR野生型(WT)和突變型(MUT)序列。熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)顯示，與對(duì)照組相比，共轉(zhuǎn)染SOCS6的WT-3’UTR時(shí)，miR-155過(guò)表達(dá)明顯降低了熒光素酶活性(圖7D)。qRT-PCR和westernblot進(jìn)一步顯示，miR-155過(guò)表達(dá)導(dǎo)致SOCS6表達(dá)降低，而miR-155敲低上調(diào)SOCS6mRNA和蛋白水平(圖7E和F)。GO分析顯示miR-155可以負(fù)向調(diào)控細(xì)胞-細(xì)胞粘附，參與調(diào)控成纖維細(xì)胞增殖(圖7G)。從GO分析可知，miR-155可能介導(dǎo)NF-κB信號(hào)通路(圖7G)。過(guò)表達(dá)miR-155可***提高細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中p65蛋白的水平，而敲低miR-155可起到相反的作用(圖7H)。 上海微生物失調(diào)科研
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶(hù)可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專(zhuān)題，外泌體研究專(zhuān)題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書(shū)奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng)：提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě)，標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)