轉(zhuǎn)錄組測序科研國家自然科學(xué)基金

來源: 發(fā)布時間:2021-11-03

在Fth- KO小鼠中, TBI后褪黑素對神經(jīng)的保護作用被**取消

為了進一步探索神經(jīng)元Fth的喪失是否影響褪黑素對TBI誘導(dǎo)的鐵死亡的影響,測量了鐵死亡的幾種假定的生物標志物。發(fā)現(xiàn)***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平?jīng)]有影響。令人驚訝的是,盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達水平?jīng)]有顯著差異,但是在褪黑素***的小鼠中,觀察到Fpn mRNA和蛋白表達水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是,與未***的Fth- KO小鼠相比,用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA(Slc7a11,Ptgs2)和蛋白質(zhì)(xCT,Cox2、4HNE)的表達。另外,用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統(tǒng)計學(xué)上降低GSH和MDA以及4HNE的水平,和FJB陽性細胞的數(shù)目。這些結(jié)果表明褪黑素沒有統(tǒng)計學(xué)上減少TBI引起的鐵死亡和神經(jīng)元變性。 大黃酸處理沒有改變?nèi)樗峋蛩岬漠a(chǎn)生。轉(zhuǎn)錄組測序科研國家自然科學(xué)基金

3)DRD2重新編碼MφM1表型,下調(diào)IL-6和IL-10

據(jù)報道,DRD2可調(diào)節(jié)M1的極化。結(jié)果顯示,在DRD2表達水平較高的BrCa組織中,M1Mφ的浸潤增加,M2Mφ的浸潤減少(圖3A)。為進一步研究DRD2對TAMs的調(diào)控作用,構(gòu)建了BrCa與Mφ共培養(yǎng)體系。當Mφ與表達DRD2的BrCa細胞共培養(yǎng)時,qRT-PCR顯示M1表型標記增加,M2Mφ標記下調(diào)(圖3B-C)。qRT-PCR也證實了載體轉(zhuǎn)染的BrCa細胞將Mφ調(diào)節(jié)為M2型(圖3C)[12]。WB結(jié)果顯示,表達DRD2的BrCa細胞上調(diào)M1標記iNOS,下調(diào)M2標記CD206(圖3D)。IF染色顯示,與表達DRD2的**細胞共培養(yǎng)后,Mφ表現(xiàn)為M1表型(圖3E)。上述結(jié)果表明,BrCa中的DRD2具有將Mφ重新編碼為M1表型的能力。為了探索使Mφ向M1表型分化的關(guān)鍵調(diào)控因子,我們進行了細胞因子陣列分析。結(jié)果表明,TNF-α和兩種誘導(dǎo)M1極化的經(jīng)典細胞因子IFNγ均未增加。而與Mφ共培養(yǎng)后,DRD2***下調(diào)IL-6和IL-10(圖3F)。分析熒光值,進一步證實IL-6和IL-10下調(diào)(圖3F)。因此,DRD2可以將Mφ重新編碼為M1表型,并在crosstalk過程中***下調(diào)IL-6和IL-10。 抗細菌反應(yīng)科研英拜可解放您的雙手釋放您的時間。

4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取

Xc-系統(tǒng)是一個胱氨酸/谷氨酸逆向轉(zhuǎn)運蛋白,捕獲細胞外的胱氨酸,用于谷胱甘肽的合成,以交換谷氨酸的釋放。在圖3中,被抑制的Xc-系統(tǒng)功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關(guān),然而YTHDC2如何調(diào)節(jié)Xc-系統(tǒng)依然未知。文獻報道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統(tǒng)活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發(fā)現(xiàn),SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負調(diào)控(圖4A、B)。在小鼠中,與KPE和KPYΔYTH小鼠相比,KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達下調(diào)(圖4C、D)。這證明YTH結(jié)構(gòu)域是YTHDC2抑制SLC7A11表達的前提。

核型生物標志物

MarkerDB共有154個核型標記或核型圖,與47種不同的疾病/狀況相關(guān)。MarkerDB中的所有核型生物標記物數(shù)據(jù)都是從原始文獻中提取的,包括**學(xué)和血液學(xué)中的遺傳學(xué)和細胞遺傳學(xué)圖譜,以及人類不平衡染色體畸變目錄。目前,MarkerDB中的所有核型標記都有一個或多個疾病xiang關(guān)聯(lián),以及MarkerDB ID、標記的獨特圖譜或核型圖(顯示與疾病核型相鄰的正常核型)、核型的簡短描述、疾病關(guān)聯(lián)、一個或多個相關(guān)基因的文獻參考和超鏈接。


血清或尿液中尿酸濃度的升高與痛風(fēng)腎臟和血管疾病密切相關(guān)。

1)DRD2通過啟動子甲基化在轉(zhuǎn)錄上下調(diào)

為了研究新的潛在TSGs,采用BrCa組織和正常組織進行RNA-seq篩選。與正常乳腺組織相比,BrCa組織中DRD2mRNA表達明顯下調(diào)(圖1A)。免疫組化染色發(fā)現(xiàn),與BrCa組織相比,正常乳腺組織中DRD2蛋白水平也較高(圖1B)。同樣,基于TCGA,在BrCa中也觀察到DRD2mRNA的下調(diào),并且在BrCa中DRD2啟動子甲基化也更頻繁(圖1C)。根據(jù)Kmplot,DRD2的高表達促進了BrCa患者的更長的生存期,這也在HER2陽性基因型患者中可見。但這一優(yōu)勢在LuminalA患者中未見(圖1D)。根據(jù)RT-PCR和MSP結(jié)果,幾乎所有的BrCa細胞系與永凍的正常乳腺細胞系相比,都可以看到DRD2mRNA表達下調(diào)或缺失以及啟動子甲基化(圖1E)。因此,DRD2的高甲基化頻率可能有助于其下調(diào)BrCa。Aza藥物去甲基化恢復(fù)了兩種沉默的BrCa細胞系MDA-MB231和BT549中DRD2的表達(圖1F)。 細菌可能是導(dǎo)致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。成都ampk信號通路芯片科研

英拜生物提供生物科學(xué)內(nèi)的專業(yè)的技術(shù)咨詢,技術(shù)合作。轉(zhuǎn)錄組測序科研國家自然科學(xué)基金

支持了轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析,流式細胞術(shù)表明帶有**記憶(Tcm)表型(CD44+CD62L+)的CD8+ TILs的比例***更高,這在不同的**模型中是一致的(Fig. 1H)。為了檢驗抑制CDK4/6對抗**T細胞免疫的長期功能效應(yīng),用CDK4/6i在短時間 (抗**T細胞反應(yīng)**活躍的3-13天)處理MC38-OVA荷瘤小鼠,然后停藥。在停止***時,CDK4/6i處理小鼠和對照小鼠的**體積是相等的(Fig. 1I-J)。引人注目的是,在停止***后,既往使用CDK4/6i***的小鼠中有21只小鼠**完全***,而對照組只有9只(Fig. 1K)??傊?,這些數(shù)據(jù)表明CDK4/6的藥理抑制促進T細胞記憶,并產(chǎn)生能夠驅(qū)動有效和持續(xù)的抗**反應(yīng)的瘤內(nèi)T細胞室。轉(zhuǎn)錄組測序科研國家自然科學(xué)基金

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標書申請:提供標書課題設(shè)計、撰寫,標書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標書均符合科研前沿?zé)狳c,中標率很高。

3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學(xué)實驗