METTL3降低APC表達(dá)，促進(jìn)β-catenin介導(dǎo)的下游基因表達(dá)、有氧糖酵解、ESCC細(xì)胞增殖和**發(fā)展APC功能的喪失使β-連環(huán)蛋白穩(wěn)定，從而誘導(dǎo)下游基因（CCND1和MYC）的表達(dá)。CCND1促進(jìn)細(xì)胞周期，c-Myc增強有氧糖酵解。正如預(yù)期的那樣，METTL3缺失增強了KYSE180細(xì)胞中APC的表達(dá)，降低了β-連環(huán)蛋白、細(xì)胞CCND1、c-Myc和PKM2的表達(dá)。此外，METTL3缺失降低了葡萄糖攝取、乳酸產(chǎn)生、細(xì)胞增殖和細(xì)胞集落數(shù)。值得注意的是，這種METTL3缺失引起基因表達(dá)（圖6a）、糖酵解（圖6b，c）、細(xì)胞增殖（補充圖6f）和集落形成的抑制在很大程度上被這些細(xì)胞中的APC缺失所消除。相反，METTL3過度表達(dá)引起葡萄糖消耗和乳酸產(chǎn)生的增加，這被YTHDF2消耗所消除。這些結(jié)果表明METTL3降低APC表達(dá)，促進(jìn)β-catenin介導(dǎo)的下游基因表達(dá)、有氧糖酵解和ESCC細(xì)胞增殖。神經(jīng)元中FTH的敲除抵消了褪黑素對創(chuàng)傷性腦損傷鐵死亡的保護(hù)作用。上海氨基酸代謝科研
TDP-43是一種主要的核DNA/RNA結(jié)合蛋白，穿梭于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)之間。TDP-43調(diào)控RNA處理，如基因轉(zhuǎn)錄、mRNA剪接、mRNA穩(wěn)定性、mRNA運輸和定位，病理突變破壞RNA代謝。在許多神經(jīng)退行性疾病中，TDP-43偏離細(xì)胞核并聚集在細(xì)胞質(zhì)中。細(xì)胞質(zhì)TDP-43聚集體被認(rèn)為是神經(jīng)退行性變的重要機制，因為這些聚集體被異常磷酸化和泛素化。有多種機制被提出來解釋神經(jīng)退行性疾病中TDP-43異常的細(xì)胞質(zhì)積累和TDP-43病理的進(jìn)行性擴(kuò)散。
TDP-43包含一個類似朊病毒的低復(fù)雜度域，并具有一個本質(zhì)上的無序區(qū)域(IDR)，使TDP-43易于聚集。RNA結(jié)合蛋白(rbp)中的IDRs被認(rèn)為在核糖體蛋白顆粒(如p -小體、應(yīng)激顆粒和神經(jīng)元顆粒)的組裝中起關(guān)鍵作用，提示rbp的突變或異常聚集可能會破壞這些顆粒的動力學(xué)。此外，rbp中的IDRs如TDP-43經(jīng)歷了液-液相分離，TDP-43的病理突變改變了液-液相分離，這可能有助于疾病進(jìn)程。因此，rbp如TDP-43的改變可能是神經(jīng)退行性變的重要指標(biāo)。然而，盡管這些機制可能解釋了TDP-43病理突變在神經(jīng)退行性疾病中的作用，但TDP-43如何在無突變的情況下聚集形成并導(dǎo)致神經(jīng)退行性疾病，如反復(fù)創(chuàng)傷患者的大腦，目前尚不清楚。 浙江染色質(zhì)科研乳酸菌是益生菌在嘌呤代謝中發(fā)揮關(guān)鍵作用。
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SC2disease提供瀏覽器和搜索引擎，以查詢有關(guān)不同疾病中特定于細(xì)胞類型的基因的詳細(xì)信息，具體流程如圖。
“疾病”和“單元格類型”是SC2disease瀏覽器的根類別?！凹膊 备悇e中總共包括25種疾病，通過單擊疾病名稱可以顯示與所關(guān)注疾病相關(guān)的特定于細(xì)胞類型的基因的詳細(xì)信息。**初將所有細(xì)胞類型分為16組，以幫助想要瀏覽特定細(xì)胞類型中標(biāo)記基因的研究人員。還可以使用“搜索”功能搜索他們感興趣的疾病，基因或細(xì)胞類型。每個基因的信息將在表格中以一行顯示，其中包括疾病名稱，實驗組織，細(xì)胞類型，基因名稱，用于描述基因表達(dá)的變量名稱（log 2 FC或均值），變量的值，DEG比較，源發(fā)布的標(biāo)識符，排序平臺和詳細(xì)信息。
6、CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化促進(jìn)CRLM
將弱轉(zhuǎn)移的CRC細(xì)胞系SW480和RKO與miR-934mimics預(yù)處理的THP-1細(xì)胞的CM共培養(yǎng)。結(jié)果顯示，無論是體內(nèi)還是體外，侵襲和轉(zhuǎn)移能力都隨著miR-934mimics外泌體處理而升高，隨著anti-miR-934外泌體處理而下降（Fig.6c–g）。這些結(jié)果表明，CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化可以增強CRC細(xì)胞的侵襲和肝轉(zhuǎn)移能力。
7、CRC細(xì)胞來源的外泌體miR-934誘導(dǎo)M2巨噬細(xì)胞極化，通過***CRC細(xì)胞中的CXCL13/CXCR5軸促進(jìn)CRLM
用HCT-8細(xì)胞來源的外泌體與陰性對照處理或PMA預(yù)處理的THP-1細(xì)胞孵育，分析趨化因子水平。如Fig.7a所示，CXCL13、IL-10和CCL22的表達(dá)水平遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其他趨化因子的水平。然后，PMA-pretreatedTHP-1細(xì)胞轉(zhuǎn)染miR-934mimics或NC，ELISA表明CXCL13的表達(dá)***增加(大約10倍)而CCL22和IL-10(二至三倍)，這表明CXCL13可能在CRLM的進(jìn)展扮演了一個重要的角色（Fig.7b）。此外，結(jié)果顯示，過表達(dá)miR-934或下調(diào)miR-934可部分增強或減弱HT29/HCT8細(xì)胞來源外泌體對M2巨噬細(xì)胞分泌CXCL13的增強作用（Fig.7c）。 英拜生物您隨身的科研小助手。
4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取
Xc-系統(tǒng)是一個胱氨酸/谷氨酸逆向轉(zhuǎn)運蛋白，捕獲細(xì)胞外的胱氨酸，用于谷胱甘肽的合成，以交換谷氨酸的釋放。在圖3中，被抑制的Xc-系統(tǒng)功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關(guān)，然而YTHDC2如何調(diào)節(jié)Xc-系統(tǒng)依然未知。文獻(xiàn)報道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統(tǒng)活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發(fā)現(xiàn)，SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負(fù)調(diào)控(圖4A、B)。在小鼠中，與KPE和KPYΔYTH小鼠相比，KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達(dá)下調(diào)(圖4C、D)。這證明YTH結(jié)構(gòu)域是YTHDC2抑制SLC7A11表達(dá)的前提。 大黃酸可以改變腸道菌群組成。上海腸道屏障科研
思路是您的操作我們來做。上海氨基酸代謝科研
轉(zhuǎn)錄組學(xué) (RNA-Seq) 模塊
RNA-seq 模塊對與衰老相關(guān)的全基因組轉(zhuǎn)錄組變化進(jìn)行編目。RNA-seq 模塊中收集的數(shù)據(jù)集來自與衰老研究相關(guān)的已發(fā)表文章。該模塊收集在特定基因干預(yù)（過表達(dá)、敲除等）時觀察到的轉(zhuǎn)錄組變化，該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達(dá)譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個可能與衰老有關(guān)的差異表達(dá)基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中，可以通過基因名稱輕松搜索 DEG，并且每個 DEG 條目都包含潛在的實驗條件和基因表達(dá)的倍數(shù)變化及其發(fā)布的來源。可以下載每篇文章中的所有搜索結(jié)果和相應(yīng)的DEG數(shù)據(jù)庫。 上海氨基酸代謝科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度，保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗