4、CDK4/6預(yù)處理增強(qiáng)功能性記憶CD8+T細(xì)胞的持久性
長期生存能力是T細(xì)胞記憶的基本特征。為了確定CDK4/6i處理的細(xì)胞在體內(nèi)是否表現(xiàn)出優(yōu)越的存活率，將未處理和CDK4/6i預(yù)處理的體外活化CD45.1OT-iT細(xì)胞轉(zhuǎn)移至同源CD45.2小鼠中，并通過流式細(xì)胞術(shù)評價其隨時間的持續(xù)性和表型（Fig.4A）。在30天內(nèi)，在血液和脾臟中檢測到的預(yù)處理OT-I-T細(xì)胞的頻率明顯更高（Fig.4B）。30天后，未處理和預(yù)處理的OT-I-T細(xì)胞在血液和脾臟中的表型持久性相似，都具有記憶前體的特征(MPECs;KLRG1-CD127+)(Fig.4C)。為了評價CDK4/6i處理細(xì)胞的記憶能力，將未處理或體外活化的CD45.1OT-iT細(xì)胞中預(yù)處理的細(xì)胞再次轉(zhuǎn)移至同源CD45.2宿主中。30d后，分離出OT-ⅠT細(xì)胞，等量重新轉(zhuǎn)移到同時***李斯特菌-OVA(LM-OVA)的新宿主中（Fig.4D)。未處理和預(yù)處理的OT-IT細(xì)胞在LM-OVA***后擴(kuò)增和分化，迅速獲得功能性、產(chǎn)生細(xì)胞因子的SLEC表型(KLRG1+CD127-)（Fig.4E-F）。這些表明CDK4/6抑制驅(qū)動T細(xì)胞記憶的表型和功能獲得。 課題外包服務(wù)找英拜放心安心。凋亡 課題CRO
2021年4月，加拿大University Ave和中國香港大學(xué)團(tuán)隊與**研究所表觀遺傳學(xué)和基因組穩(wěn)定性小組在Cell Death & Differentiation 雜志上發(fā)表了文章“The PTEN and ATM axis controls the G1/S cell cycle checkpoint and tumorigenesis in HER2-positive breast cancer”。此報道發(fā)現(xiàn)ATM磷酸化PTEN的398位(人類蘇氨酸;在小鼠絲氨酸)的***，為了理解ATM磷酸化PTEN的生物學(xué)意義，建立了一個小鼠模型，構(gòu)建了一個不能被ATM磷酸化的PTEN突變形式，用398位(PTEN- 398a)的絲氨酸取代了丙氨酸。PTEN-398A的表達(dá)可加速her2陽性乳腺*小鼠模型的**發(fā)展和進(jìn)展。利用分子生物學(xué)方法，發(fā)現(xiàn)了一種新的機(jī)制，通過ATM磷酸化PTEN調(diào)節(jié)其細(xì)胞再分配，并有助于該蛋白的**抑制功能。分子生物學(xué)課題產(chǎn)學(xué)研合作按照實驗設(shè)計路線和實驗結(jié)果進(jìn)行文章的構(gòu)思與潤色。
用戶界面SC2disease提供瀏覽器和搜索引擎，以查詢有關(guān)不同疾病中特定于細(xì)胞類型的基因的詳細(xì)信息，具體流程如圖。
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***我們來講一篇刊登在Nucleic Acids Research題名為MarkerDB: an online database of molecular biomarkers的文章。MarkerDB是一個整合已知臨床和選定的臨床前分子生物標(biāo)志物的數(shù)據(jù)庫，包括四種主要類型的分子生物標(biāo)記（化學(xué)，蛋白質(zhì)，DNA [遺傳]和核型）和四種生物標(biāo)記類別（診斷，預(yù)測，預(yù)后和暴露）。MarkerDB提供的信息包括：生物標(biāo)志物名稱和同義詞，相關(guān)條件或病理，詳細(xì)的疾病描述，詳細(xì)的生物標(biāo)志物描述，生物標(biāo)志物特異性，敏感性和ROC曲線，標(biāo)準(zhǔn)參考值（對于蛋白質(zhì)和化學(xué)標(biāo)志物），變體（對于SNP或遺傳標(biāo)志物） ），序列信息（用于遺傳和蛋白質(zhì)標(biāo)記），分子結(jié)構(gòu)（用于蛋白質(zhì)和化學(xué)標(biāo)記），組織或生物流體來源（用于蛋白質(zhì)和化學(xué)標(biāo)記），染色**置和結(jié)構(gòu)（用于遺傳和核型標(biāo)記），臨床批準(zhǔn)狀態(tài)和相關(guān)文獻(xiàn)參考。caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細(xì)胞的標(biāo)志物。
五、gata1調(diào)控靶基因的染色質(zhì)可及性及表達(dá)動態(tài)
檢測了pySCENIC鑒定的**頂層gata1調(diào)控靶基因的scRNA-seq和scATAC-seq數(shù)據(jù)(根據(jù)AUCell評分排序)(圖5)。
我們觀察了兩個基因啟動子(距轉(zhuǎn)錄起始位點3kb[TSS])和遠(yuǎn)端調(diào)控區(qū)域(距TSS50kb)的可及性，以及沿MEMP分化軌跡所選靶基因的表達(dá)水平(圖5A)。我們觀察到，在造血干細(xì)胞/mpp中，gata1調(diào)控靶基因的啟動子在任何明顯的基因表達(dá)之前通常是開放的(圖5A)。因此，與我們之前的觀察一致，造血干細(xì)胞/mpp的染色質(zhì)可及性發(fā)生在*存在于分化程度更高的細(xì)胞中的轉(zhuǎn)錄變化之前。有趣的是，與第1類(hsc/MPPs)相比，第6類(MEMPs)中GATA1靶基因的啟動子可及性總體較低(圖5B、5D和5E)，與拮抗基因(即針對不同譜系的基因)的啟動子共可及性較低相吻合(圖5F)。相比之下，簇6中遠(yuǎn)端調(diào)控元件/增強(qiáng)子的可及性高于簇1(圖5C)。這可能表明gata調(diào)控基因可能在啟動子上啟動，而增強(qiáng)子則提供細(xì)胞類型特異性的表達(dá)。 進(jìn)一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細(xì)胞對基因毒性損傷的反應(yīng)。神經(jīng)元損傷課題CRO
TIMEOR是***個基于 Web 的自適應(yīng)時間序列多組學(xué)管道方法。凋亡 課題CRO
SP35敲除促進(jìn)肺*細(xì)胞的鐵死亡
我們研究了shUSP35介導(dǎo)的**抑制是否可歸因于細(xì)胞死亡的誘導(dǎo)。如圖2A，B所示，用Nec-1，Z-VAD和CQ***以抑制壞死、凋亡和自噬并不影響細(xì)胞凋亡，表明可能涉及其他形式的細(xì)胞死亡。鐵死亡是一種新的調(diào)節(jié)性細(xì)胞死亡，它與包括肺*在內(nèi)的**生長的發(fā)病機(jī)制有關(guān)。因此，我們使用兩種鐵死亡抑制劑，F(xiàn)er-1和Lip-1，探索了鐵死亡是否導(dǎo)致USP35沉默后的肺細(xì)胞死亡。如圖2A，B所示，鐵死亡抑制阻斷了H460和H1299細(xì)胞中shUSP35介導(dǎo)的細(xì)胞死亡。在shUSP35***的細(xì)胞中，集落形成被抑制，但被Fer-1和Lip1破壞(圖2C)。 凋亡 課題CRO
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1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
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3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗