其次，采用UPGMA、PCoA和NMDS評估不同群體的腸道菌群β-多樣性。UPGMA聚類方法將對照組和PCOS大鼠樣本分為兩組，表明PCOS大鼠和對照組的腸道微生物分布不同。雖然DHEA + tempol組不能完全與DHEA + PBS組分離，但與DHEA + PBS組有所不同，說明給藥tempol影響了PCOS大鼠的腸道微生物分布(圖4G)。PCoA和NMDS分析進(jìn)一步顯示，三組大鼠腸道總體微生物組成不同(圖4H-I)，而Permanova/ Anosim分析表明，三組間差異***(圖4J)。上述結(jié)果表明，DHEA和tempol處理可影響腸道微生物的β-多樣性。ATM對PTEN的磷酸化導(dǎo)致PTEN在質(zhì)膜上重新分布。TBI課題CRO
與HuR的RRM3結(jié)合，中斷HuR-β-actinmRNA相互作用，抑制β-actin表達(dá)，抑制OPC遷移
為闡明lnc-PMIF如何與HuR相互作用調(diào)節(jié)β-actin表達(dá)和OPC遷移，首先通過生物信息學(xué)分析預(yù)測了lnc-PMIF的二級結(jié)構(gòu)，并合成生物素化的全長lnc-PMIF（WT）和截短的lnc-PMIF突變體，分別為突變體A1（無5’莖環(huán)的正義）、突變體A2（有中心莖環(huán)和3’莖環(huán)的正義）和突變體A3（*有3’莖環(huán)的正義1100-1455bp），轉(zhuǎn)染MC3T3-E1細(xì)胞，并進(jìn)行標(biāo)記RNA鏈霉親和素下拉試驗(yàn)。蛋白免疫印跡分析顯示，HuR存在于轉(zhuǎn)染W(wǎng)Tlnc-PMIF、截短lnc-PMIF突變體A1或截短lnc-PMIF突變體A2的細(xì)胞的下拉部分中，但在轉(zhuǎn)染截短lnc-PMIF突變體A3的細(xì)胞的下拉部分中不存在。這些數(shù)據(jù)表明，lnc-PMIF的中心莖環(huán)足以實(shí)現(xiàn)lnc-PMIF和HuR之間的相互作用。 創(chuàng)傷性腦損傷課題實(shí)驗(yàn)外包了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。
與SMARCA4類似，SMARCC1[15](在ChIP-SICAP中發(fā)現(xiàn))顯示與C1和C2位點(diǎn)相結(jié)合(圖2g）。
重點(diǎn)分析了ARBs染色質(zhì)可及性的變化，發(fā)現(xiàn)雄***通常增加了ARBs的可及性(圖3a, ATAC, siCTRL)。盡管SBs和ARBs之間有很大的重疊，但SMARCA4刪除*減少了2149個ARBs的染色質(zhì)可及性。這些sismarca4受影響的位點(diǎn)中有一半是開放的，不管***暴露與否(pre-accessible)，其余的在***暴露后顯示其可及性增加(de novo位點(diǎn)，圖3a和c)。被AR招募的SMARCA4增加染色質(zhì)可及性，潛在地協(xié)助其他因素招募到這些位點(diǎn)(圖3d，補(bǔ)充表2)。由于雄***誘導(dǎo)了FOXA1在sismarca4影響位點(diǎn)的結(jié)合(圖3e)， AR誘導(dǎo)的SMARCA4的招募可能有助于雄***誘導(dǎo)FOXA1的結(jié)合。上述結(jié)果表明SMARCA4在CRPC細(xì)胞染色質(zhì)景觀的調(diào)節(jié)中既有AR依賴的作用，也有非ARr**的作用。
2017年俞立團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，整合素與ECM蛋白的配對結(jié)合決定了遷移體的形成[2]，該研究成果也發(fā)表在CellResearch期刊。2108年俞立團(tuán)隊(duì)明確闡述了收集和檢測遷移體的實(shí)驗(yàn)方法[3]。2019年，俞立團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)Tspan4和膽固醇在遷移體形成時組織成為微米級大型微結(jié)構(gòu)域，這一結(jié)構(gòu)即遷移體的基本結(jié)構(gòu)，還證實(shí)遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結(jié)構(gòu)的剛度增加而產(chǎn)生的一種生物物理過程[4]，該研究成果發(fā)表于NatureCellBiology期刊中（IF=）。并同年在同期刊中發(fā)表，遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生，Tspan4a和Tspan7（遷移體生成相關(guān)基因）突變體斑馬魚的***形態(tài)發(fā)生受損，并闡明遷移體誘導(dǎo)胚胎細(xì)胞至正確的位置，從而影響***形態(tài)發(fā)生[5]。2019年俞立團(tuán)隊(duì)還發(fā)表了關(guān)于遷移體標(biāo)志物的文章[6]，該文章闡明了人血清中存在遷移體；與外泌體相比，遷移體中存在四種特異性蛋白：NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。2021年5月，俞立團(tuán)隊(duì)在Cell期刊（IF=）上發(fā)表文章，文章主要講述在外界刺激下，細(xì)胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月，俞立團(tuán)隊(duì)利用斷層成像技術(shù)研究不同物種的大規(guī)模細(xì)胞遷移和神經(jīng)活動。根客戶的研究方向查閱相關(guān)文獻(xiàn)。
點(diǎn)擊該結(jié)構(gòu)的圖像可以獲得放大的圖像。為了幫助用戶精細(xì)化搜索，PROTAC-DB還包含基于物理化學(xué)的過濾工具屬性(例如分子量、log P、log S、拓?fù)錁O性表面積)，包含了搜索結(jié)果中每個屬性的最小值和最大值。對于PROTAC，除了二維結(jié)構(gòu)、化合物ID和靶蛋白外，數(shù)據(jù)表中還顯示了生物活性，包括降解能力、結(jié)合親和力和細(xì)胞活性。該數(shù)據(jù)表可以根據(jù)生物活動的值進(jìn)行排序。對于彈頭和E3配體，搜索結(jié)果中只顯示了初始結(jié)構(gòu)。修改后PROTAC中的結(jié)構(gòu)匯總在其相應(yīng)的詳細(xì)信息頁面中。此外，數(shù)據(jù)表中還顯示了初始結(jié)構(gòu)的生物活性。同樣，也可以根據(jù)這些標(biāo)準(zhǔn)對數(shù)據(jù)表進(jìn)行排序。對于Linker，數(shù)據(jù)表中只顯示了2D結(jié)構(gòu)、化合物ID和目標(biāo)蛋白。結(jié)構(gòu)中的‘R1’和‘R2’分別**彈頭和E3配體的結(jié)合位點(diǎn)。生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的精細(xì)研究。免疫組化課題實(shí)驗(yàn)檢測服務(wù)
深耕科研行業(yè)提高科研的高效。TBI課題CRO
8）SOCS6通過泛素化和降解p65抑制NF-κB信號通路
鑒于miR-155通過增強(qiáng)細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核中p65的表達(dá)負(fù)調(diào)控SOCS6的表達(dá)，并***NF-κB信號通路，我們下一步研究SOCS6與p65之間潛在的相互作用。首先，我們在bEnd.3細(xì)胞中過表達(dá)或下調(diào)SOCS6。發(fā)現(xiàn)p65表達(dá)與SOCS6水平呈負(fù)相關(guān)(圖8A)。DiscoveryStudio?分析的3D對接也表明SOCS6可能與p65相互作用(圖8B)。此外，熒光共定位實(shí)驗(yàn)表明，SOCS6與p65在細(xì)胞質(zhì)***定位(圖8C和D)，Co-IP實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步揭示了SOCS6與p65的相互作用(圖8E)。值得注意的是蛋白酶體MG132可以部分逆轉(zhuǎn)SOCS6過表達(dá)對p65蛋白水平的抑制作用(圖8F)。同時，在環(huán)己酰亞胺的情況下，SOCS6的沉默***延緩了內(nèi)源性p65的降解速率，而過表達(dá)SOCS6則***加速了p65的降解(圖8G)。***，通過泛素化實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證SOCS6是否通過蛋白酶體降解誘導(dǎo)p65失穩(wěn)。我們發(fā)現(xiàn)過表達(dá)SOCS6增加了bEnd.3細(xì)胞中p65多聚泛素化。沉默SOCS6則相反(圖8H)。綜上所述，這些結(jié)果表明SOCS6可以與p65結(jié)合并誘導(dǎo)其多聚泛素化和蛋白酶體降解。 TBI課題CRO
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4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)