代謝標(biāo)書贈(zèng)送提供技術(shù)路線

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-10-28

英拜生物提供婦科疾病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估8項(xiàng)檢測:妊娠糖尿病、子宮內(nèi)膜異位、多囊卵巢綜合征等。

技術(shù)原理:基因芯片(genechip)是目前生物芯片家族中**完善、應(yīng)用*****的芯片,將許多特定的寡聚核苷酸或DN**段(稱為探針)固定在芯片的每個(gè)預(yù)先設(shè)置的區(qū)域內(nèi),將待測樣本標(biāo)記后同芯片進(jìn)行雜交,利用堿基互補(bǔ)配對(duì)原理進(jìn)行雜交,通過檢測雜交信號(hào)并進(jìn)行計(jì)算機(jī)分析,從而檢測對(duì)應(yīng)片段是否存在、存在量的多少,以用于疾病的臨床診斷和檢測等眾多方面。運(yùn)用縮微技術(shù),基因芯片能夠同時(shí)分析成千上萬個(gè)生物樣本,將許多不連續(xù)的分析過程集成于玻璃介質(zhì)上,使這些分析過程連續(xù)化、微型化、集成化和自動(dòng)化。 環(huán)狀RNA(circRNA)是一類共價(jià)閉合的單鏈RNA.代謝標(biāo)書贈(zèng)送提供技術(shù)路線

TRIM25的RNA結(jié)合活性對(duì)于其對(duì)底物的泛素連接酶活性是必需的。構(gòu)建了一個(gè)帶有FLAG標(biāo)記RNA結(jié)合域(RBD)缺失突變體。TRIM25ΔRBD不影響IGF2BPs的蛋白質(zhì)水平,對(duì)IGF2BPs的泛素化水平?jīng)]有明顯影響,表明TRIM25完整的RBD對(duì)于IGF2BPs的有效泛素化和降解是必要的。這些結(jié)果表明,TRIM25通過泛素-蛋白酶體途徑促進(jìn)NSCLC細(xì)胞中IGF2BPs的降解,并且TRIM25的RNA結(jié)合活性對(duì)其在底物泛素化中的作用至關(guān)重要。

已經(jīng)顯示,TRIM25使用RNA作為其靶標(biāo)有效泛素化的支架。然后,探討了TRIM25對(duì)IGF2BPs的泛素連接酶活性是否取決于circNDUFB2的存在。 circNDUFB2的丟失顯示了TRIM25對(duì)IGF2BPs泛素化和降解的顯著減弱作用。進(jìn)一步驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)并檢查circNDUFB2是否充當(dāng)支架來增強(qiáng)TRIM25與IGF2BP的結(jié)合,進(jìn)行了Co-IP分析。在帶有circNDUFB2但沒有circNDUFB2-MUT過表達(dá)的A549細(xì)胞中,TRIM25和IGF2BP之間的關(guān)聯(lián)得到增強(qiáng)。由于circNDUFB2對(duì)RNA核酸外切酶的抗性,使用RNase A***會(huì)嚴(yán)重破壞相互作用。此外,在METTL3 / 14敲低后,IGF2BP的泛素化作用顯著降低。結(jié)果表明,circNDUFB2充當(dāng)支架,以增強(qiáng)TRIM25和IGF2BPs之間的相互作用,隨后促進(jìn)TRIM25介導(dǎo)的IGF2BPs泛素化和降解。 醫(yī)學(xué)科研標(biāo)書國家自然科學(xué)基金間接量熱法測定平均呼吸交換商(RQ值)在SCI + FMT組恢復(fù)正常。

4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用

據(jù)報(bào)道,外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結(jié)合蛋白來轉(zhuǎn)運(yùn)。通過RNApull-down分析和質(zhì)譜分析,鑒定了三種可能參與miR-934轉(zhuǎn)運(yùn)的RNA結(jié)合蛋白,并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(dá)(Fig.4a,b)。hnRNPA2B1是一種RNA結(jié)合蛋白,通過與特定基序GGAG/CCCU結(jié)合,參與miRNAs的運(yùn)輸和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。特別是,由于miR-934序列中有兩個(gè)GGAG基序,我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結(jié)合,介導(dǎo)miR-934包裝成外泌體的過程。此外,miRNApull-down分析顯示,在細(xì)胞質(zhì)和外泌體中,miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結(jié)合關(guān)系,然而,突變miR-934的結(jié)合序列(GGAG)可削弱這種結(jié)合(Fig.4c)。RNA免疫沉淀分析進(jìn)一步證明,無論是在CRC細(xì)胞及其外泌體裂解物中,miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集(Fig.4d)。此外,敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細(xì)胞轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞的過程(Fig.4e)。因此,這些結(jié)果證實(shí)hnRNPA2B1可以通過與miR-934的GGAG序列結(jié)合,介導(dǎo)miR-934包裝到CRC細(xì)胞外泌體中,并將外泌體miR-934轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞中。

二、改進(jìn)標(biāo)簽轉(zhuǎn)移和差異分析

研究了方法差異對(duì)下游生物學(xué)分析的影響

A.B.去除中性粒細(xì)胞**提高了在細(xì)胞核和細(xì)胞的均勻流形近似和投影(UMAP)投影中分離各種細(xì)胞類型的能力.

C使用這些工具,中性粒細(xì)胞的去除提高了標(biāo)記轉(zhuǎn)移評(píng)分,與核基方法相比,滲透性細(xì)胞產(chǎn)生了更多具有高標(biāo)記轉(zhuǎn)移評(píng)分的細(xì)胞.

D所有方法產(chǎn)生的CD16+單核細(xì)胞均少于流式細(xì)胞術(shù)觀察到的CD16+單核細(xì)胞,這表明無論是使用核或通透細(xì)胞的scATAC-seq過程中,CD16+單核細(xì)胞可能丟失,或者標(biāo)簽轉(zhuǎn)移方法不利于識(shí)別這種細(xì)胞類型. FMT處理可能導(dǎo)致SCI后胃腸道消化活力變快。

7)MIR210HG通過miR-337-3p和miR-137促進(jìn)**進(jìn)展

為了確定MIR210HG下調(diào)對(duì)Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞系惡性行為的抑制作用是否通過miR-337-3p/137介導(dǎo),我們進(jìn)行了功能挽救實(shí)驗(yàn)。結(jié)果證實(shí)MIR210HG沉默對(duì)Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞遷移和侵襲的惡性抑制作用被miR-337-3p/137敲低***逆轉(zhuǎn)(圖7A-7E)。這表明MIR210HG通過miR-337-3p/137調(diào)控Ishikawa和HEC-1A細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為。

8)抑制MIR210HG和miR-337-3p/137過表達(dá)抑制**生長

我們測定了MIR210HG和miR-337-3p/137在體內(nèi)**模型中的功能。裸鼠實(shí)驗(yàn)中,每組實(shí)驗(yàn)小鼠3只。結(jié)果表明與對(duì)照組相比,轉(zhuǎn)染sh-MIR210HG并過表達(dá)miR-337-3p和miR-137降低了**體積(圖8A)。轉(zhuǎn)染shMIR210HG并同時(shí)過表達(dá)miR-337-3p和miR-137的組**體積**小。免疫組化分析顯示,與單獨(dú)轉(zhuǎn)染agomir-337-3p/137和sh-MIR210HG組相比,共轉(zhuǎn)染組HMGA2和Ki-67的表達(dá)較低(圖8B)。

結(jié)論:MIR210HG在子宮內(nèi)膜*患者中是一個(gè)**的預(yù)后因素,干擾MIR210HG的體內(nèi)外表達(dá)可抑制子宮內(nèi)膜*細(xì)胞的惡性表型。MIR210HG-miR-337-3p/137被發(fā)現(xiàn)介導(dǎo)HMGA2調(diào)節(jié)子宮內(nèi)膜*細(xì)胞惡性行為的能力。MIR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2軸是新的子宮內(nèi)膜*分子預(yù)后標(biāo)志物和潛在的***靶點(diǎn)。 NSCLC中circNDUFB2下調(diào).推薦標(biāo)書整體服務(wù)

轉(zhuǎn)座酶染色質(zhì)可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細(xì)胞表觀遺傳組測序技術(shù)。代謝標(biāo)書贈(zèng)送提供技術(shù)路線

5.ELNAT1與UBC9啟動(dòng)子形成DNA-RNA三聯(lián)體,通過招募hnRNPA1增強(qiáng)H3K4me3修飾

為了探索ELNAT1誘導(dǎo)BCa淋巴轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,我們使用NGS檢測過表達(dá)ELNAT1的BCa細(xì)胞和對(duì)照細(xì)胞(Figure5A),由于SUMOylation已經(jīng)被證明可以調(diào)節(jié)特異性RNA的識(shí)別,并參與RNA分選進(jìn)入EVs的過程,因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關(guān)靶基因。在受ELNAT1調(diào)控的925個(gè)基因中,作者發(fā)現(xiàn)UBC9是SUMOylation相關(guān)基因變化*****的(Figure5B-D)。接著通過RNA純化(ChIRP)檢驗(yàn)ELNAT1與UBC9中P1(153~143bp)啟動(dòng)子區(qū)域存在生理相互作用(Figure5E,F)。CD光譜證實(shí)ELNAT1/UBC9TTS1組在270~280nm處有一個(gè)***的正峰,在210nm處有一個(gè)負(fù)峰。 代謝標(biāo)書贈(zèng)送提供技術(shù)路線

公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。

3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)